Lactobacillus spp. har betraktats som en opportunistisk patogen hos immunkompromiterade patienter, och den har en benägenhet att orsaka invasiva infektioner som bakteriemi, abscess och endokardit. Andra rapporterade riskfaktorer är intravenösa katetrar, tidigare sjukhusvistelse eller kirurgi och användning av bredspektrumantibiotika . I studien av Salminen et al. visade sig den totala dödligheten vara 26 % efter en månad och 48 % efter ett år . Naqvi et al. rapporterade ett fall av dödlig L. rhamnosus endokardit hos en ung patient med en historia av komplicerad cirros och tidigare C. difficile-kolit . Patienter med förlust av integriteten hos tarmslemhinnans barriär löper också en ökad risk; därför har flera förekomster av Lactobacillus-bakteriemi rapporterats hos patienter med ulcerös kolit . Translokation från tarmen och systemisk spridning av organismer kan vara den bakomliggande patogenesen för invasiva infektioner hos patienter med nedsatt immunförsvar . L. rhamnosus-stammar har visat sig inducera trombocytaggregationer, ha ett modifierat exopolysackaridkluster och bilda starka biofilmer .

Lactobacillus-bakteriemi har rapporterats hos patienter med akut myeloisk leukemi, stor granulär lymfatisk leukemi och hos transplantationsmottagare . Återkommande Lactobacillus spp. bakteremi med kronisk lymfatisk leukemi har rapporterats. Lactobacillerna som isolerades från blododlingar var mottagliga för penicillin och gentamicin, och patienten behandlades med denna regim. Författarna drog slutsatsen att trots intermittenta feberfria perioder och negativa blododlingar efter behandling är en framgångsrik utrotning av den underliggande källan tveksam med tanke på hans återkommande bakteriemi. Därför sattes patienten slutligen på livslång oral behandling med amoxicillin-klavulanat för profylax .

Vår patient fick en njurtransplantation 2013 och stod under underhållsimmunosuppressionsregim med takrolimus, mykofenolatmofetil och prednison. Granskningen av vår patients journal visade att han hade tagit probiotiska kosttillskott innehållande Lactobacillus acidophilus och Lactobacillus bulgaris i fem månader innan han överfördes till intensivvårdsavdelningen. Probiotikapiller skickades inte för testning på grund av otillgänglighet; kolonisering genom probiotikaanvändning långt efter att konsumtionen upphört är dock högst tveksamt. Dessutom skiljer sig dessa stammar från dem som upptäcktes i blododlingar. Såvitt vi vet finns det endast ytterligare två fallrapporter i litteraturen som rapporterar primär blodströmsinfektion orsakad av Lactobacilli spp. hos en njurtransplanterad mottagare . Vanichanan et al. rapporterade en 60-årig njurtransplanterad person som utvecklade en intraabdominell abscess där det växte en karbapenemresistent Lactobacillus casei (L. casei), med ett händelselöst uppföljningsförlopp i fyra år. Han hade tagit ett receptfritt probiotikum i sex månader, fram till två månader före presentationen då han utvecklade bukbesvär på grund av förstorade nativa njurar. Han genomgick bilateral nativ nefrektomi och skrevs ut hem. En vecka senare återvände han till sjukhuset med septisk chock och andningssvikt. I odlingen av den perihepatiska vätskan odlades L. casei. Dessutom växte en liknande organism i det probiotiska tillskott som patienten tog också, vilket ger upphov till oro för probiotika-associerad infektion hos immunsupprimerade individer .

Behandlingen av invasiva, allvarliga eller återkommande laktobacillusinfektioner kan vara en utmaning. Många Lactobacillus-stammar, inklusive L. rhamnosus, är i sig resistenta mot vankomycin. Resistens mot ciprofloxacin, tetracyklin, meropenem, metronidazol och sulfonamider har rapporterats, och vissa isolat uppvisar intermediär resistens mot linezolid .

Under de senaste åren har användningen av probiotika ökat över hela världen för behandling av diarré hos barn och vuxna, C. difficile-diarré, irritabelt tarmsyndrom, allergi (kan utvecklas här), förebyggande av infektioner i urogenitala trakten, inflammatorisk tarmsjukdom och candidal vaginit. Bafeta et al. samlade in data från flera publicerade prövningar för att undersöka hur information om skador rapporteras i publikationer om randomiserade kontrollerade prövningar (RCT, n=384) av probiotika, prebiotika och synbiotika. De drog slutsatsen att skaderapportering i publicerade rapporter om RCT:er med bedömning av probiotika, prebiotika och synbiotika ofta saknas eller är otillräcklig, och att man inte kan dra den allmänna slutsatsen att dessa interventioner är säkra utan att rapportera säkerhetsdata . I en epidemiologisk studie av Lactobacillus bacteremia i Finland fann forskarna ingen korrelation mellan den ökade probiotikaanvändningen av L. rhamnosus GG (ATCC 53103) och förekomsten av Lactobacillus bacteremia under 1990-2000 . FDA föreslog att immunosuppression, strukturell hjärtsjukdom, inpatienter, graviditet och potential för translokation av probiotika över tarmväggen skulle utgöra en potentiell risk för biverkningar i probiotiska kliniska prövningar.