Lactobacillus spp. został uznany za patogen oportunistyczny u pacjentów z obniżoną odpornością i ma skłonność do wywoływania zakażeń inwazyjnych, takich jak bakteriemia, ropień i zapalenie wsierdzia. Inne zgłoszone czynniki ryzyka obejmują cewniki dożylne, wcześniejszą hospitalizację lub operację oraz stosowanie antybiotyków o szerokim spektrum działania. W badaniu przeprowadzonym przez Salminen i wsp. ogólna śmiertelność wynosiła 26% w ciągu miesiąca i 48% w ciągu roku. Naqvi i wsp. opisali przypadek śmiertelnego zapalenia wsierdzia wywołanego przez L. rhamnosus u młodego pacjenta z powikłaną marskością wątroby i wcześniejszym zapaleniem jelita grubego wywołanym przez C. difficile. Pacjenci z utratą integralności bariery śluzówkowej jelita są również narażeni na zwiększone ryzyko; w związku z tym odnotowano kilka przypadków bakteriemii wywołanej przez Lactobacillus u pacjentów z wrzodziejącym zapaleniem jelita grubego. Translokacja jelitowa i ogólnoustrojowe rozprzestrzenianie się organizmów może leżeć u podstaw patogenezy zakażeń inwazyjnych u pacjentów z obniżoną odpornością. Stwierdzono, że szczepy L. rhamnosus wywołują agregację płytek krwi, mają zmodyfikowany klaster egzopolisacharydów i tworzą silne biofilmy.

Bakteriemia wywołana przez Lactobacillus została zgłoszona u pacjentów z ostrą białaczką szpikową, białaczką limfocytową z dużymi ziarnami oraz u biorców przeszczepów. Zgłaszano nawracającą bakteriemię Lactobacillus spp. z przewlekłą białaczką limfocytową. Lactobacillus wyizolowane z posiewów krwi były wrażliwe na penicylinę i gentamycynę, a pacjentka była leczona tym schematem. Autorzy stwierdzili, że pomimo okresów bezgorączkowych i ujemnych posiewów krwi po leczeniu, skuteczna eradykacja źródła zakażenia jest wątpliwa, biorąc pod uwagę nawracającą bakteriemię. W związku z tym pacjent został ostatecznie umieszczony na dożywotniej doustnej terapii amoksycyliną-klawulanianem w celu profilaktyki .

Nasz pacjent otrzymał przeszczep nerki w 2013 roku i był pod podtrzymującym schematem immunosupresji z takrolimusem, mykofenolanem mofetylu i prednizonem. Przegląd karty naszego pacjenta ujawnił, że przyjmował on suplementy probiotyczne zawierające Lactobacillus acidophilus i Lactobacillus bulgaris przez pięć miesięcy przed jego przeniesieniem na oddział intensywnej terapii. Tabletki probiotyczne nie zostały wysłane do badania z powodu niedostępności; jednak kolonizacja przez stosowanie probiotyków długo po zaprzestaniu ich spożywania jest wysoce wątpliwa. Ponadto, szczepy te różnią się od tych wykrytych w posiewach krwi. Według naszej wiedzy w literaturze istnieją jeszcze tylko dwa doniesienia o przypadkach pierwotnego zakażenia krwi wywołanego przez Lactobacilli spp. u biorcy przeszczepu nerki. Vanichanan i wsp. opisali przypadek 60-letniego biorcy przeszczepu nerki, u którego rozwinął się ropień wewnątrzbrzuszny, w którym wyhodowano Lactobacillus casei (L. casei) oporny na karbapenemy, a jego obserwacja przebiegała bez powikłań przez cztery lata. Przez sześć miesięcy przyjmował probiotyk dostępny bez recepty, a dwa miesiące przed prezentacją wystąpił u niego dyskomfort w jamie brzusznej spowodowany powiększeniem nerek własnych. Przeszedł obustronną nefrektomię natywną i został wypisany do domu. Tydzień później powrócił do szpitala we wstrząsie septycznym i z niewydolnością oddechową. W posiewie płynu okołowątrobowego wyhodowano L. casei. Ponadto w suplemencie probiotycznym przyjmowanym przez pacjenta również wyhodowano podobny organizm, co wzbudziło obawy o infekcje związane z probiotykami u osób z obniżoną odpornością .

Leczenie inwazyjnych, ciężkich lub nawracających zakażeń bakteriami z rodzaju Lactobacillus może stanowić wyzwanie. Wiele szczepów Lactobacillus, w tym L. rhamnosus, jest samoistnie opornych na wankomycynę. Odnotowano oporność na ciprofloksacynę, tetracyklinę, meropenem, metronidazol i sulfonamidy, a niektóre izolaty wykazują pośrednią oporność na linezolid .

W ostatnich latach na całym świecie wzrosło zastosowanie probiotyków w leczeniu biegunki u niemowląt i dorosłych, biegunki wywołanej przez C. difficile, zespołu jelita drażliwego, alergii (może być opracowana tutaj), zapobiegania zakażeniom dróg moczowo-płciowych, nieswoistych zapaleń jelit i kandydozowego zapalenia pochwy. Bafeta i wsp. zebrali dane z kilku opublikowanych badań, aby sprawdzić, w jaki sposób informacje dotyczące szkodliwości są podawane w publikacjach dotyczących randomizowanych badań kontrolowanych (RCT, n=384) probiotyków, prebiotyków i synbiotyków. Doszli oni do wniosku, że w opublikowanych raportach z RCT oceniających probiotyki, prebiotyki i synbiotyki często brakuje informacji o szkodliwości lub są one nieodpowiednie i nie można wyciągać ogólnych wniosków, że te interwencje są bezpieczne bez podania danych dotyczących bezpieczeństwa. W badaniu epidemiologicznym bakteriemii wywołanej przez Lactobacillus w Finlandii badacze nie stwierdzili korelacji między zwiększonym stosowaniem probiotyków L. rhamnosus GG (ATCC 53103) a częstością występowania bakteriemii wywołanej przez Lactobacillus w latach 1990-2000. FDA zasugerowała, że immunosupresja, strukturalna choroba serca, hospitalizacja, ciąża i możliwość translokacji probiotyku przez ścianę jelita są potencjalnie zagrożone wystąpieniem zdarzeń niepożądanych w badaniach klinicznych probiotyków.