Lactobacillus spp. er blevet betragtet som et opportunistisk patogen hos immunkompromitterede patienter, og det har tilbøjelighed til at forårsage invasive infektioner såsom bakteriæmi, abscess og endokarditis. Andre rapporterede risikofaktorer omfatter intravenøse katetre, tidligere hospitalsindlæggelse eller kirurgi og brug af bredspektret antibiotika . I undersøgelsen af Salminen et al. blev den samlede dødelighed fundet at være 26 % efter en måned og 48 % efter et år . Naqvi et al. rapporterede et tilfælde af dødelig L. rhamnosus endokarditis, der involverede en ung patient med en historie med kompliceret cirrose og tidligere C. difficile colitis . Patienter med tab af integriteten af tarmslimhindenes barriere er også i øget risiko; derfor er der rapporteret om flere tilfælde af Lactobacillus-bakteriæmi hos patienter med colitis ulcerosa . Translokation fra tarmene og systemisk spredning af organismer kan være den underliggende patogenese for invasive infektioner hos immunsvækkede patienter . L. rhamnosus-stammer har vist sig at fremkalde trombocytaggregationer, have en modificeret exopolysaccharidklynge og danne stærke biofilm .

Lactobacillus-bakteriæmi er blevet rapporteret hos patienter med akut myeloid leukæmi, stor granulær lymfatisk leukæmi og hos transplantatmodtagere . Recidiverende Lactobacillus spp. bakteriæmi med kronisk lymfatisk leukæmi er blevet rapporteret. Lactobacillerne isoleret fra blodkulturer var modtagelige for penicillin og gentamicin, og patienten blev behandlet med dette regime. Forfatterne konkluderede, at på trods af intermitterende feberfrie perioder og negative blodkulturer efter behandling er det tvivlsomt, om det er lykkedes at udrydde den underliggende kilde i betragtning af hans tilbagevendende bakteriæmi. Derfor blev patienten i sidste ende sat i livslang oral amoxicillin-clavulanatbehandling til profylakse .

Vores patient modtog en nyretransplantation i 2013 og var under vedligeholdelsesimmunosuppressionsregime med tacrolimus, mycophenolatmofetil og prednison. Gennemgangen af vores patients journal afslørede, at han havde taget probiotiske kosttilskud indeholdende Lactobacillus acidophilus og Lactobacillus bulgaris i fem måneder før hans overflytning til intensivafdelingen. Probiotiske piller blev ikke sendt til testning på grund af manglende tilgængelighed; men kolonisering ved brug af probiotika længe efter at forbruget er ophørt, er yderst tvivlsomt. Desuden er disse stammer forskellige fra dem, der blev påvist i blodkulturer. Så vidt vi ved, er der kun to andre caserapporter i litteraturen, der rapporterer primær blodstrømsinfektion forårsaget af Lactobacilli spp. hos en nyretransplantatmodtager . Vanichanan et al. rapporterede om en 60-årig nyretransplanteret modtager, der udviklede en intraabdominal absces, som dyrkede en carbapenemresistent Lactobacillus casei (L. casei), med et begivenhedsløst opfølgningsforløb i fire år. Han havde taget et probiotikum i håndkøb i seks måneder, indtil to måneder før præsentationen, hvor han udviklede abdominal ubehag på grund af forstørrede indfødte nyrer. Han gennemgik bilateral nefrektomi og blev udskrevet hjem. En uge senere vendte han tilbage til hospitalet med septisk chok og respirationssvigt. Ved dyrkning af den perihepatiske væske blev der dyrket L. casei. Desuden voksede der også en lignende organisme i det probiotiske tilskud, som patienten tog, hvilket giver anledning til bekymring for probiotika-associeret infektion hos immunsvækkede personer.

Behandlingen af invasive, alvorlige eller tilbagevendende lactobacillus-infektioner kan være en udfordring. Mange Lactobacillus-stammer, herunder L. rhamnosus, er iboende resistente over for vancomycin. Resistens over for ciprofloxacin, tetracyklin, meropenem, metronidazol og sulfonamider er blevet rapporteret, og nogle isolater udviser intermediær resistens over for linezolid .

I de seneste år er brugen af probiotika steget på verdensplan til behandling af diarré hos spædbørn og voksne, C. difficile-diarré, irritabel tarmsyndrom, allergi (kan uddybes her), forebyggelse af urogenitale infektioner, inflammatorisk tarmsygdom og candidal vaginitis. Bafeta et al. indsamlede data fra flere offentliggjorte forsøg for at undersøge, hvordan oplysninger om skadevirkninger rapporteres i publikationer af randomiserede kontrollerede forsøg (RCT’er, n=384) af probiotika, præbiotika og synbiotika. De konkluderede, at rapportering om skader i offentliggjorte rapporter om RCT’er, der vurderer probiotika, præbiotika og synbiotika, ofte mangler eller er utilstrækkelige, og det kan ikke konkluderes generelt, at disse interventioner er sikre uden at rapportere sikkerhedsdata . I en epidemiologisk undersøgelse af Lactobacillus-bakteriæmi i Finland fandt forskerne ikke nogen sammenhæng mellem den øgede probiotiske brug af L. rhamnosus GG (ATCC 53103) og forekomsten af Lactobacillus-bakteriæmi i perioden 1990-2000 . FDA foreslog immunosuppression, strukturel hjertesygdom, indlagt, graviditet og potentiale for translokation af probiotika på tværs af tarmvæggen til at være potentielt i risiko for uønskede hændelser i probiotiske kliniske forsøg.