No início do século XVII, o culto a Rosalia foi quase esquecido. Em 26 de Maio de 1624 uma mulher moribunda, Girolama Gatti, viu num sonho uma jovem vestida de branco, que prometeu que seria curada se fizesse um voto de subida ao Monte Pellegrino para lhe agradecer. A mulher ainda febril subiu a montanha com duas amigas, bebeu a água que escorria da caverna, sentiu que estava curada e caiu num sono repousante, sonhando novamente com a jovem vestida de branco, que lhe apontou o lugar onde seus restos mortais estavam enterrados.

O acontecimento foi relatado ao convento vizinho dos frades eremitas franciscanos, que durante o século anterior, com seu Padre Sueprior Benedetto il Moro (1526-1589), haviam tentado, sem sucesso, encontrar as relíquias de Rosalia. Agora retomaram a busca e, a 15 de julho de 1624, a quatro metros de profundidade, encontraram uma rocha, seis palmas de comprimento e três de largura, à qual estavam presos ossos humanos.

Por ordem do cardeal Giannettino Doria, arcebispo de Palermo, a rocha foi levada para sua capela particular, onde os restos foram examinados por teólogos e médicos; o resultado foi decepcionante, a equipe declarou que os ossos poderiam pertencer a mais corpos e nenhum dos três crânios encontrados parecia pertencer a uma mulher.

O cardeal não estava convencido e nomeou uma segunda comissão. Entretanto, no verão de 1624 Palermo foi atingido por uma praga, que começou a reclamar milhares de vítimas. O Cardeal reuniu autoridades e a população na catedral, e todos juntos rezaram à Virgem Maria, jurando defender o privilégio da Imaculada Conceição, que justamente então estava sendo muito debatido na Igreja, e ao mesmo tempo jurou declarar Santa Rosalia patrona de Palermo, e adorar suas relíquias, caso pudessem ser estabelecidas.

Aconteceu outro estranho acontecimento no mesmo período. Em 25 de abril de 1624 dois pedreiros de Palermo, trabalhando no mosteiro dominicano de Santo Stefano, descobriram em uma caverna em Quisquinia uma inscrição latina, até então desconhecida de todos, que se acreditava ter sido gravada pela própria Santa Rosalia durante sua vida. A inscrição foi lida: “Eu Rosalia, filha de Sinibaldo, senhor de Quisquina e (Monte) das Rosas, por amor de meu Senhor Jesus Cristo, decidi viver nesta gruta”; esta inscrição confirmava o local de sua ermida anterior, de onde ela se mudara mais tarde para Monte Pellegrino.

Em 11 de fevereiro de 1625 a segunda equipe de especialistas determinou que os ossos pertenciam claramente a uma pessoa feminina, e sobre os três crânios descobriram que dois eram um jarro de barro e uma grande pedra, enquanto o terceiro, que inicialmente parecia muito grande, foi engrossado por depósitos de calcário, que uma vez removido revelou um crânio feminino; também a primeira equipe reexaminou os restos mortais e concordou com o resultado desta segunda comissão.