10 tipp a nyál DNS-minták optimalizálásához, több millió minta alapján
A nyálminták gyűjtésének specialistáiként megértjük, hogy a lehető legjobb eredmények biztosítása érdekében optimalizált nyál DNS-mintákkal rendelkezünk, ami kulcsfontosságú az Ön kutatási tanulmánya szempontjából.
A nyálból származó nagy hozamú, kiváló minőségű DNS lehetővé teszi ügyfeleink számára, hogy több vizsgálatot végezzenek és több adatot generáljanak, ezáltal felgyorsítva kutatásukat. Ráadásul az olyan nem invazív gyűjtési lehetőségek, mint az Oragene, olyan gyűjtési módszert biztosítanak a kutatóknak és a résztvevőknek, amelyet valóban szeretnek.
Úgy gondoltuk, hasznos lenne kiemelni a bevált tippeket és trükköket a minták optimalizálásához. Tudjuk, hogy mi kell ahhoz, hogy nagyszerű eredményeket kapjunk a nyálmintákból, és ezt többéves tapasztalatunkkal tudjuk alátámasztani.
Összeállítottuk a DNS nyálminták optimalizálásának 10 legfontosabb módját, amelyek hozzájárulhatnak a sikerhez. Miközben olvassa, tegye fel magának a kérdést, hogy ezek közül a tippek közül bármelyik hasznos lehet-e az Ön laboratóriumában. Ha pedig további tippeket szeretne megosztani, ossza meg velünk a Twitteren, a Linkedinen vagy a Facebook-oldalunkon.
A gyűjtésen alapuló optimalizálás
- Nagyon fontos, hogy pontosan kövesse a gyűjtési utasításokat. Győződjön meg arról, hogy az alanyok leadják a szükséges mennyiségű nyálat, és a minta leadása előtt 30 perccel ne egyenek/igyanak/szívjanak/rágózzanak/rágózzanak. Ezen ajánlások be nem tartása csökkent DNS-hozamot eredményezhet.
- Köpéskor a buborékok nem számítanak. Győződjön meg róla, hogy a folyékony nyál a “Fill To” vonalnál van; a jelenlévő buborékoknak a vonal felett kell lenniük. Ez biztosítja, hogy az optimális mennyiségű nyál gyűljön össze. Ha kevesebb nyálat gyűjt, az nem befolyásolja a minőséget, de a DNS-hozam arányosan csökken.
- A DNS-hozam donoronként eltérő. Fontos, hogy különböző donoroktól származó mintákat teszteljünk, hogy pontos képet kapjunk a várható hozamról.
- A 2 ml-t nehezen kiköpő donorok esetében a nyálfolyás gyakran serkenthető az arcok dörzsölésével, közvetlenül a hátsó fogak mögött. A nyáltermelést a nyelvre tett csipetnyi cukorral is serkentheti. Csak egy pici mennyiségre van szükség; csak annyira, hogy az illető meg tudja ízlelni. Egy csepp citromlé is működik.
- Néha nehéz lehet a nyálgyűjtés olyan személytől, aki nem képes parancsra köpni, például egy kisebb gyermektől. A nem köpködők számára kifejlesztett gyűjtőkészlet, például az Oragene asszisztált gyűjtés (OG-675) vagy az ORAcollect gyermekgyógyászathoz (OC-175) használata megkönnyíti a mintavételt mind Önnek, mind a donornak, és biztosítja, hogy elegendő DNS-t gyűjtsön.
Feldolgozáson alapuló optimalizálás
- Az 50°C-os inkubációs lépést az eredeti mintacsőben kell elvégezni, mielőtt aliquotot veszünk ki a DNS-kivonáshoz. Az inkubációt csak egyszer kell elvégezni; ezt a lépést nem kell megismételni, amikor a DNS-t a későbbi aliquotokból extrahálja.
- Hacsak nem teszünk speciális lépéseket az RNS eltávolítására, az RNS együtt fog tisztulni a DNS-sel. Javasoljuk, hogy a DNS-t fluoreszcenciával (pl. Picogreen) számszerűsítse, mivel az UV-abszorbancia túlbecsülheti a DNS mennyiségét.
- Ha a downstream alkalmazás nagy DNS-koncentrációt igényel, növelheti a koncentrációt, ha a DNS-pellet feloldásához használt puffer mennyiségét 100 µl-ről 50 µl-re csökkenti. Mindig egyszerűbb később hígítani a DNS-t, mint koncentrálni.
- Az ivaros/nyálas minták szobahőmérsékleten évekig stabilak. Ha nem tudja azonnal kivonni őket, nem szükséges hűteni vagy lefagyasztani őket; egyszerűen hagyja őket a padon.
- Gondoskodjon elegendő időről, hogy a DNS a kivonás után feloldódjon. Az Oragene/nyálmintákból a prepIT-L2P módszerrel kivont DNS rendkívül nagy molekulasúlyú, ezért időbe telik, amíg teljesen feloldódik. Az extrakciót követően javasoljuk, hogy a mintát szobahőmérsékleten hagyja egy éjszakán át, hogy a DNS teljesen feloldódhasson. Ha a DNS nem oldódik fel teljesen, az befolyásolhatja a mennyiségi meghatározás pontosságát.
Ez a 10 legfontosabb módszerünk a DNS-minták optimalizálására. Van valami hozzáfűznivalója a listához? Kérjük, hagyjon megjegyzést, és ossza meg velünk.
Kattintson az alábbi készletkérés gombra, ha szeretne ingyenes Oragene próbakészleteket kérni, vagy írjon nekünk a [email protected] címre.
Kapcsolódó blogok:
Hogyan kell végrehajtani a nagyszabású DNS-mintavételt genetikai kutatásokhoz – 10 alapvető szempont
8 tény, amit a legtöbb ember nem tud a nyálból származó DNS-ről