10 wskazówek do optymalizacji próbek DNA ze śliny, na podstawie milionów próbek

wrz 10, 2021
admin

Jako specjaliści w dziedzinie pobierania próbek śliny, rozumiemy, że posiadanie próbek DNA ze śliny, które są zoptymalizowane w celu zapewnienia najlepszych możliwych wyników jest kluczowe dla Twoich badań.

Wysoka wydajność, wysoka jakość DNA ze śliny umożliwia naszym klientom przeprowadzenie większej ilości badań i wygenerowanie większej ilości danych, tym samym przyspieszając ich badania. Dodatkowo, posiadanie nieinwazyjnych opcji pobierania, takich jak Oragene, zapewnia badaczom i uczestnikom metodę pobierania, którą faktycznie lubią.

Pomyśleliśmy, że pomocne będzie zwrócenie uwagi na sprawdzone wskazówki i triki dotyczące optymalizacji Twoich próbek. Wiemy, co jest potrzebne, aby uzyskać doskonałe wyniki z próbek śliny i mamy lata doświadczeń, aby to poprzeć.

Podsumowaliśmy 10 najlepszych sposobów optymalizacji próbek śliny DNA, które mogą przyczynić się do Twojego sukcesu. Podczas czytania zadaj sobie pytanie, czy któraś z tych wskazówek może być przydatna w Twoim laboratorium. A jeśli masz dodatkowe wskazówki, którymi chciałbyś się podzielić, daj nam znać na Twitterze, Linkedin lub na naszej stronie na Facebooku.

Optymalizacja oparta na zbieraniu

  1. Ważne jest, aby ściśle przestrzegać instrukcji dotyczących zbierania. Upewnij się, że badani dostarczają wymaganą ilość śliny i nie jedzą/piją/palą/żują gumy przez 30 minut przed pobraniem próbki. Niestosowanie się do tych zaleceń może spowodować zmniejszenie wydajności DNA.
  2. Przy pluciu bąbelki się nie liczą. Upewnij się, że płynna ślina znajduje się na linii „Fill To”; wszelkie obecne pęcherzyki powinny znajdować się powyżej tej linii. To zapewni, że zostanie pobrana optymalna ilość śliny. Jeśli zbierzesz mniej śliny, nie wpłynie to na jakość, ale proporcjonalnie zmniejszy wydajność DNA.
  3. Wydajność DNA będzie się różnić w zależności od dawcy. Ważne jest, aby przetestować próbki od różnych dawców, aby uzyskać dokładny obraz wydajności, jakiej można się spodziewać.
  4. W przypadku dawców mających problemy z wypluciem 2 ml, przepływ śliny może być często stymulowany przez pocieranie policzków, tuż za tylnymi zębami. Można również stymulować wydzielanie śliny poprzez użycie szczypty cukru na języku. Potrzebna jest tylko niewielka ilość; tyle, aby osoba mogła poczuć jego smak. Kropla soku z cytryny również działa.
  5. Czasami może być trudno pobrać ślinę od osoby, która nie jest w stanie pluć na polecenie, np. od młodszego dziecka. Użycie zestawu do pobierania przeznaczonego dla osób nieplujących, takiego jak Oragene assisted collection (OG-675) lub ORAcollect for pediatrics (OC-175), ułatwi pobranie próbki zarówno Tobie jak i dawcy oraz zapewni zebranie wystarczającej ilości DNA.

Optymalizacja oparta na przetwarzaniu

  1. Krok inkubacji w temperaturze 50°C musi być przeprowadzony w oryginalnej probówce z próbką, przed pobraniem porcji do ekstrakcji DNA. Inkubacja musi być wykonana tylko raz; nie trzeba powtarzać tego kroku podczas ekstrakcji DNA z kolejnych podwielokrotności.
  2. Bez podjęcia szczególnych kroków w celu usunięcia RNA, RNA będzie współpreparować z DNA. Zalecamy ilościowe oznaczanie DNA metodą fluorescencyjną (np. Picogreen), ponieważ absorbancja UV może zawyżać ilość DNA.
  3. Jeśli dalsza aplikacja wymaga wysokich stężeń DNA, można zwiększyć stężenie poprzez zmniejszenie ilości buforu użytego do rozpuszczenia osadu DNA ze 100 µL do 50 µL. Zawsze łatwiej jest później rozcieńczyć DNA niż je zagęszczać.
  4. Próbki oragenu/śliny są stabilne w temperaturze pokojowej przez lata. Jeśli nie można ich od razu ekstrahować, nie ma potrzeby przechowywania ich w lodówce lub zamrażania; wystarczy pozostawić je na stole.
  5. Zapewnić wystarczającą ilość czasu na rozpuszczenie DNA po ekstrakcji. DNA ekstrahowane z próbek oragenu/śliny metodą prepIT-L2P ma bardzo dużą masę cząsteczkową i dlatego jego pełne rozpuszczenie wymaga czasu. Po ekstrakcji zalecamy pozostawienie próbki na noc w temperaturze pokojowej, aby umożliwić pełne rozpuszczenie DNA. Brak całkowitego rozpuszczenia DNA może wpłynąć na dokładność kwantyfikacji.

To jest nasze 10 najlepszych sposobów na optymalizację próbek DNA. Czy masz coś do dodania do tej listy? Proszę zostaw komentarz i daj nam znać.

Kliknij na przycisk żądania zestawów poniżej, jeśli jesteś zainteresowany zamówieniem bezpłatnych zestawów próbnych Oragene, lub możesz wysłać do nas e-mail na adres [email protected].

Powiązane Blogi:

Jak przeprowadzić zbiórkę próbek DNA na dużą skalę do badań genetycznych – 10 zasadniczych uwag

8 faktów, których większość ludzi nie zna na temat DNA ze śliny

Więcej o

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.