Kostní alkalická fosfatáza (BAP) je kostní specifická izoforma alkalické fosfatázy. BAP je glykoprotein, který se nachází na povrchu osteoblastů a odráží biosyntetickou aktivitu těchto buněk tvořících kost. Bylo prokázáno, že BAP je citlivým a spolehlivým ukazatelem kostního metabolismu.

Normální kost neustále prochází remodelací, při níž je odbourávání nebo resorpce kosti vyvažována její tvorbou. Tento proces je nezbytný pro udržení zdraví kostí. Pokud se tento proces rozpojí a rychlost resorpce převýší rychlost tvorby, může výsledný úbytek kostní hmoty vést k osteoporóze a následně k vyšší náchylnosti ke zlomeninám.

Osteoporóza je metabolické onemocnění kostí charakterizované nízkou kostní hmotou a abnormální mikroarchitekturou kosti. Může být důsledkem řady klinických stavů včetně stavů vysokého kostního obratu, endokrinních poruch (primární a sekundární hyperparatyreóza a tyreotoxikóza), osteomalacie, selhání ledvin, gastrointestinálních onemocnění, dlouhodobé léčby kortikosteroidy, mnohočetného myelomu a rakoviny metastazující do kostí.

Pagetova choroba je další časté metabolické onemocnění kostí způsobené nadměrnou rychlostí kostní remodelace, která vede k lokálním změnám abnormální kostní matrix. Tyto léze mohou vyústit ve zlomeniny nebo neurologické postižení. K obnovení normální struktury kostí se používá antiresorpční terapie.