Jako specialisté v oblasti odběru vzorků slin chápeme, že mít vzorky DNA ze slin optimalizované pro zajištění co nejlepších výsledků je pro vaši výzkumnou studii zásadní.

Vysoká výtěžnost a kvalita DNA ze slin umožňuje našim zákazníkům provádět více studií a získávat více dat, a tím urychlit jejich výzkum. Navíc díky neinvazivním možnostem odběru, jako je Oragene, mají výzkumníci i účastníci k dispozici metodu odběru, která se jim skutečně líbí.

Mysleli jsme si, že bude užitečné upozornit na osvědčené tipy a triky pro optimalizaci vašich vzorků. Víme, co je potřeba k získání skvělých výsledků ze vzorků slin, a máme léta zkušeností, která to potvrzují.

Sestavili jsme 10 nejlepších způsobů optimalizace vzorků slin DNA, které mohou přispět k vašemu úspěchu. Při čtení si položte otázku, zda by některý z těchto tipů mohl být užitečný i ve vaší laboratoři. A pokud máte další tipy, o které se chcete podělit, dejte nám vědět na Twitteru, Linkedinu nebo na naší stránce na Facebooku.

Optimalizace na základě sběru

1. Je důležité důsledně dodržovat pokyny pro odběr. Zajistěte, aby subjekty dodaly požadované množství slin a 30 minut před odevzdáním vzorku nejedly/pily/kouřily/žvýkaly žvýkačky. Nedodržení těchto doporučení může vést ke snížení výtěžnosti DNA.
2. Při plivání se bublinky nepočítají. Ujistěte se, že jsou tekuté sliny na čáře „Fill To“ (Naplnit do); případné přítomné bublinky by měly být nad touto čárou. Tím zajistíte, že bude odebráno optimální množství slin. Pokud nasbíráte méně slin, nebude to mít vliv na kvalitu, ale výtěžnost DNA se úměrně sníží.
3. Výtěžnost DNA se u jednotlivých dárců liší. Je důležité otestovat vzorky od různých dárců, abyste získali přesnou představu o výtěžnosti, kterou můžete očekávat.
4. U dárců, kteří mají problémy s vyplivnutím 2 ml, lze často stimulovat tok slin třením tváří těsně za zadními zuby. Produkci slin můžete také stimulovat pomocí špetky cukru na jazyku. Stačí jen malé množství; jen tolik, aby osoba mohla cítit chuť. Funguje také kapka citronové šťávy.
5. Někdy může být obtížné sbírat sliny od osoby, která není schopna plivat na povel, například od mladšího dítěte. Použití odběrové soupravy určené pro osoby, které neplivou, jako je asistovaný odběr Oragene (OG-675) nebo ORAcollect pro pediatrii (OC-175), vám i dárci usnadní odběr vzorku a zajistí, že získáte dostatečné množství DNA.

Optimalizace na základě zpracování

1. Krok inkubace při 50 °C musí být proveden v původní zkumavce se vzorkem, a to před odebráním alikvotu pro extrakci DNA. Inkubaci je třeba provést pouze jednou; při extrakci DNA z dalších alikvotů není třeba tento krok opakovat.
2. Pokud se neprovedou zvláštní kroky k odstranění RNA, bude se RNA purifikovat společně s DNA. Doporučujeme kvantifikovat DNA pomocí fluorescence (např. Picogreen), protože UV absorbance může nadhodnocovat množství DNA.
3. Pokud vaše následná aplikace vyžaduje vysoké koncentrace DNA, můžete zvýšit koncentraci snížením množství pufru použitého k rozpuštění peletu DNA ze 100 µl na 50 µl. Vždy je snazší DNA později naředit, než ji muset koncentrovat.
4. Vzorky oragenu/slin jsou stabilní při pokojové teplotě po dobu několika let. Pokud je nemůžete extrahovat hned, není třeba je chladit ani mrazit; stačí je nechat na stole.
5. Po extrakci zajistěte dostatečný čas na rozpuštění DNA. DNA extrahovaná ze vzorků Oragenu/slin pomocí metody prepIT-L2P má extrémně vysokou molekulovou hmotnost, a proto bude trvat dlouho, než se zcela rozpustí. Po extrakci doporučujeme ponechat vzorek přes noc při pokojové teplotě, aby se DNA mohla zcela rozpustit. Pokud se DNA zcela nerozpustí, může to ovlivnit přesnost kvantifikace.

Toto je našich 10 nejlepších způsobů optimalizace vzorků DNA. Máte něco, čím byste tento seznam doplnili? Zanechte nám prosím komentář a dejte nám vědět.

Máte-li zájem o bezplatné zkušební soupravy Oragene, klikněte na tlačítko vyžádat si soupravy níže, nebo nám můžete napsat na adresu [email protected].

Související blogy:

Jak provést rozsáhlý odběr vzorků DNA pro genetický výzkum – 10 základních úvah

8 faktů, které většina lidí o DNA ze slin neví

.