The Botanical Garden is home to the Pfizer Plant Research Laboratory, construído com financiamento do governo nacional, do estado de Nova Iorque e da Administração Nacional Oceânica e Atmosférica (NOAA) e nomeado para o seu maior doador privado, é uma nova e importante instituição de pesquisa no Jardim que abriu em 2006.

O laboratório é uma instituição de pesquisa pura, com projetos mais diversificados do que a pesquisa feita em universidades e empresas farmacêuticas. A ênfase da pesquisa do laboratório está centrada no genoma vegetal, no estudo de como os genes funcionam no desenvolvimento das plantas. Os cientistas esperam responder à questão do mistério “abominável” de Darwin; quando, onde e por que surgiram as plantas floridas.

A pesquisa do laboratório também promove a disciplina da sistemática molecular, o estudo do DNA como evidência que pode revelar a história evolutiva e as relações das espécies vegetais. O pessoal científico também estuda o uso de plantas em comunidades imigrantes em Nova York e os mecanismos genéticos pelos quais as neurotoxinas são produzidas em algumas plantas, trabalho que pode ser ligado a neuropatias em humanos.

O laboratório consiste numa equipa de 200 investigadores profissionais e 42 doutorandos de todo o mundo.

Desde 1890, os cientistas do Jardim Botânico de Nova Iorque fizeram cerca de 2.000 missões exploratórias em todo o mundo para recolher plantas na natureza.

No laboratório de bioquímica vegetal, os compostos bioquímicos são extraídos das plantas para criar uma biblioteca de DNA das plantas do mundo e armazenados em uma seção de armazenamento de DNA, com 20 freezers contendo amostras de milhões de espécimes, incluindo espécies raras, ameaçadas ou extintas na natureza. Para protegê-los durante possíveis quedas de energia no inverno, há um gerador elétrico de reserva de 300 kilowatts.