O pénis é o órgão copulatório masculino e é composto por raiz, corpo e glande (Fig. 8-19). A crura do pênis é formada por dois corpos cavernosos e o bulbo, que é a expansão caudal do corpo esponjoso, constitui a raiz do pênis. Os crura do pênis são fixados no arco isquiático e são cobertos pelo m. ischiocavernosus, enquanto que o bulbo do pênis é coberto pelo m. bulbospongiosum (Fig. 8-19). O corpo do pênis está localizado entre a raiz e a glande. No rato, o corpo do pénis tem uma flexão que faz com que, em estado não erecto, a glande do pénis seja dirigida caudalmente. Durante a ereção a direção da glande é invertida (Fig. 8-19). O corpo do pénis é composto por um único corpo cavernoso e o corpo esponjoso, que envolve a uretra. O corpo cavernoso tem dois sulcos, um sulco dorsal, que contém os vasos sanguíneos do pênis, e um sulco ventral, onde se encontra o corpo esponjoso (Fig. 8-20). Tanto o corpus cavernosum como o corpus spongiosum são formados por cavidades vasculares circundadas por tecido conjuntivo (Figs. 8-20 e 8-26). A disposição tridimensional das fibras colágenas no trabéculo do corpus cavernosum varia de acordo com a área examinada e é facilmente observada utilizando luz polarizada (Fig. 8-20).