Bone alkaline phosphatase (BAP) is de botspecifieke isovorm van alkalische fosfatase. BAP is een glycoproteïne dat wordt aangetroffen op het oppervlak van osteoblasten en weerspiegelt de biosynthetische activiteit van deze botvormende cellen. Aangetoond is dat BAP een gevoelige en betrouwbare indicator is van het botmetabolisme.

Normaal bot ondergaat voortdurend een remodellering waarbij botafbraak of -resorptie in evenwicht wordt gehouden door botvorming. Dit proces is noodzakelijk voor het behoud van gezonde botten. Als dit proces ontkoppeld raakt en de resorptiesnelheid groter is dan de formatiesnelheid, kan het resulterende botverlies leiden tot osteoporose en bijgevolg een grotere gevoeligheid voor fracturen.

Osteoporose is een metabolische botziekte die wordt gekenmerkt door een lage botmassa en een abnormale botmicroarchitectuur. Zij kan het gevolg zijn van een aantal klinische aandoeningen, waaronder een hoge botrotatie, endocriene aandoeningen (primaire en secundaire hyperparathyroïdie en thyrotoxicose), osteomalacie, nierinsufficiëntie, gastro-intestinale aandoeningen, langdurige corticosteroïdtherapie, multipel myeloom en naar de botten uitgezaaide kanker.

De ziekte van Paget is een andere veel voorkomende metabole botziekte die wordt veroorzaakt door een te snelle botombouw, wat leidt tot plaatselijke laesies met een abnormale botmatrix. Deze laesies kunnen leiden tot fracturen of neurologische aandoeningen. Antiresorptieve therapieën worden gebruikt om de normale botstructuur te herstellen.