Im Jahr 1990 war John Perry Barlow Mitbegründer der Electronic Frontier Foundation (EFF), einer gemeinnützigen Organisation mit Sitz in den USA, die Rechtsbeistand leistet, um Einzelpersonen und neue Technologien vor den ihrer Ansicht nach fehlgeleiteten rechtlichen Bedrohungen zu schützen.

Seine Schriften über die Auswirkungen des Internets haben das Denken der Menschen seit den Anfängen des Netzes beeinflusst. Seine Essays für Wired, The New York Times, Communications of the ACM und andere Publikationen waren für den öffentlichen Diskurs von entscheidender Bedeutung. Am bekanntesten ist er wahrscheinlich als Lyriker, Essayist und Cyberlibertärer, aber er ist auch Fellow am Berkman Center for Internet & Society der Harvard Law School. Von 1971 bis 1995 schrieb er die Texte für einige der bekanntesten Songs von Grateful Dead, darunter „Mexicali Blues“ und „I Need a Miracle“

Barlow ist derzeit stellvertretender Vorsitzender des EFF-Vorstands. Im Jahr 2012 war Barlow einer der Gründer der EFF-nahen Organisation Freedom of the Press Foundation. In seiner „A Declaration of the Independence of Cyberspace“ (Erklärung der Unabhängigkeit des Cyberspace) vertrat er die Ansicht, dass die Rechtsordnung des Cyberspace die ethischen Überlegungen der Gemeinschaft widerspiegeln sollte.

Einen Großteil seiner Zeit verbringt er auf Reisen, hält Vorträge und berät über Bürgerrechte, Redefreiheit, das Internet und die Electronic Frontier Foundation.