1988-ban Brennaman és Nuxhall megjelent a Nemzeti Liga elnöke, Bart Giamatti előtt az NL irodájában, New Yorkban, azzal a váddal kapcsolatban, hogy Brennaman a Reds menedzsere, Pete Rose és Dave Pallone bíró közötti veszekedés után arra buzdította a tömeget, hogy késleltesse a játékot. Miután Rose-t kizárták a mérkőzésről, és Brennaman az élő rádióközvetítés során kritizálta Pallone-t, a szurkolók törmelékkel szórták tele a pályát, ami a mérkőzés elhalasztásához vezetett. Brennaman a következőket mondta az incidenssel kapcsolatban:

“Még mindig fenntartom, hogy igazunk volt” – mondta Brennaman. “Soha nem fogok bocsánatot kérni ezért. Azzal vádoltak minket, hogy lázadást szítottunk. Nem hiszem, hogy akkor is így tettünk, és most sem hiszem, hogy így tettünk.”

2007. június 12-én Brennaman a Cincinnati Reds Radio Network adásában élő adásban bocsánatot kért egy nemrég tett megjegyzése miatt, amelyben egy közelgő országjárást a Bataani Halálmenethez hasonlított. A Reds, amely akkoriban a National League legrosszabb rekordját tartotta, az Oakland Athletics, a Seattle Mariners és a Philadelphia Phillies csapatával találkozott volna az út során.

2008. április 17-én, a Chicago Cubs és a Cincinnati Reds közötti mérkőzés nyolcadik inningje alatt a chicagói Wrigley Field-en Brennaman megjegyzéseket tett a Cubs-szurkolókról és a Cubs csapatáról. Erre azután került sor, hogy Adam Dunn, a Reds akkori játékosa hazafutást ért el. A Cubs-szurkolók szokás szerint visszadobják az ellenfél játékosának labdáját a pályára. Ebben az esetben a pálya tele volt több, a szurkolók által a pályára dobott labdával, ami a játék késleltetéséhez vezetett, amíg a pályaszemélyzet összeszedte a törmeléket. Brennaman nyilatkozatait a Reds Radio Network közvetítette a mérkőzésről.”

“Ez az a fajta dolog, őszintén szólva, most az ember azt kívánja, hogy a Chicago Cubs csapata veszítsen. Az összes baseballszurkoló közül, és nem tudom tanúsítani a Yankees vagy a Red Sox esetében, mert nem látjuk őket semmilyen rendszerességgel, hacsak nem ligák közötti meccsekről van szó, de messze a legundorítóbb szurkolók a baseballban, ebben a ligában azok, akik ezt a csapatot követik itt. 15 vagy 18 labdát dobálnak a pályára, erre abszolút nincs mentség, és ez annyira jellemző a Chicago Cubs szurkolóira. Ez hihetetlen.”
“Egyszerűen csak ellenük szurkolsz. Tudod, egész télen azt mondtam, hogy arról beszéltek, hogy ez a csapat megnyeri a divíziót, és az én megjegyzésem az, hogy nem fogják megnyerni, mert a nap végén ők még mindig a Chicago Cubs, és ki fogják találni a módját, hogy elszúrják az egészet.”

2008. április 18-án Brennaman megjelent egy interjúban a WMVP-AM 1000 chicagói sportrádióban, amelyben megerősítette a Cubs-szurkolókkal kapcsolatos álláspontját, és a Chicago Cubs szurkolóit a rivális St. Louis Cardinals szurkolóihoz hasonlította.

“Ha nem tudják megérteni, hogy ami szerda este történt, az teljesen túlzás volt, akkor sajnálom” – mondta Brennaman. “Azt mondtam, milyen nehéz a Cubsnak szurkolni. Szerintem sokan ugyanúgy éreznek, mint én, csak nem akarják megfogalmazni. Nem félek kimondani, amit gondolok.”
” A Cardinals szurkolók kétségkívül a legjobbak a baseballban. Tisztelik a játékot. Nem azért mennek a meccsre, hogy hülyeségeket csináljanak.”
“A Cubsnak nagyszerű baseballszurkolói vannak. De azok, akik idiótán viselkednek, (tönkreteszik) az olyan emberek számára, mint én.”

2010. február 5-én Brennamant megbüntették, amiért az egyetem baseball bankettjén és adománygyűjtésén azt mondta, hogy a Marshall Egyetem elnöke biztosan “buzi” a softballhoz. Brennaman kijelentette: “Valószínűleg jobban is megválaszthattam volna a szavaimat, de ez semmiképpen sem tükrözi a véleményemet a melegekről. Ez csak egy megjegyzés, amit az egyetem elnökével kapcsolatban tettem.”