A vegyület keserűsége vezérli a denatonium legtöbb alkalmazását. A denatonium-benzoátot az etanol denaturálására használják, hogy azt az adózás és az értékesítési korlátozások tekintetében ne kezeljék alkoholos italként. Különösen az egyik jelölés, az SD-40B jelzi, hogy az etanolt denaturálták denatonium-benzoát felhasználásával.

A denatoniumot gyakran tartalmazzák a klinikai vizsgálatokban használt placebo-gyógyszerekben, hogy utánozzák bizonyos gyógyszerek keserű ízét.

A denatonium a káros alkoholok, például a metanol, és az olyan adalékanyagok, mint az etilénglikol fogyasztását is gátolja. A denatoniumot a bedörzsölő alkoholban inaktív összetevőként használják. Sokféle káros folyadékhoz is hozzáadják, többek között oldószerekhez (például körömlakklemosóhoz), festékekhez, lakkokhoz, piperecikkekhez és más testápolási cikkekhez, a körömrágás megelőzésére szolgáló speciális körömlakkokhoz és számos más háztartási termékhez. Kevésbé veszélyes aeroszolos termékekhez (például gázporszívókhoz) is hozzáadják, hogy megakadályozzák az illékony gőzök belélegzésével való visszaélést.

1995-ben az amerikai Oregon állam előírta, hogy az édes ízű etilénglikolt és metanolt tartalmazó termékekhez, például fagyállóhoz és szélvédőmosó folyadékhoz denatonium-benzoátot kell hozzáadni, hogy megelőzzék a gyermekek és állatok mérgezését. 2012 decemberében az amerikai gyártók önkéntesen beleegyeztek abba, hogy denatonium-benzoátot adnak az országszerte értékesített fagyálló folyadékokhoz.

Az állatok köztudottan eltérő érzékenységgel reagálnak a denatonium hatására. Egyes állatriasztó szerekben használják (különösen az olyan nagytestű emlősök, mint a szarvasok esetében). A patkánymérgek emberi fogyasztástól való megóvására is használták, mivel az emberek sokkal alacsonyabb koncentrációban képesek érzékelni a denatoniumot, mint a rágcsálók.

A denatonium visszataszító íze elrettentő hatású lehet olyan termékeknél, amelyeket nem fogyasztásra terveztek, és/vagy fogyasztáskor károsak. Híres, hogy a Nintendo Switch játékkártyákat denatonium-benzoáttal vonták be, hogy megakadályozzák a kisgyermekek fogyasztását.