Holmes a été médaillé au tournoi de qualification du PGA Tour 2005. Lors de son premier départ sur le PGA Tour, au Sony Open 2006 à Hawaï, il se classe dixième ex aequo et en février de la même année, il remporte le FBR Open, devenant ainsi le golfeur le plus rapide à atteindre 1 000 000 $ de gains en carrière sur le PGA Tour. Il s’agissait de son cinquième tournoi en tant que professionnel et de son quatrième sur le PGA Tour.

Après cette victoire, sa forme est retombée, et cela a continué en 2007 où il n’a fait que 2 top 10 et a terminé l’année à la 118e place sur la money list.

Le 3 février 2008, Holmes a remporté le FBR Open pour la deuxième victoire de sa carrière sur le Tour et a également capturé le titre du tournoi pour la deuxième fois en trois ans. Commençant le tour final avec une avance de quatre coups, au 18e tee, il était à un coup de Phil Mickelson. Holmes a fait un birdi au 18e pour forcer un play-off et a ensuite battu Mickelson sur le premier trou du play-off (le 18e) en faisant un putt de six pieds pour le birdie après un drive de 359 yards. Cette victoire a permis à Holmes de se hisser à la 62e place du classement officiel mondial de golf. En 2008, Holmes atteint la 42e place de l’OWGR, un sommet dans sa carrière.

Style de jeu

Holmes, tout comme ses collègues recrues de 2006 tels que Camilo Villegas et Bubba Watson, est connu pour frapper la balle sur de longues distances, dépassant les 300 yards (312,7 yards, le classant numéro 2 en distance de drive, à seulement 6 yards du leader, Watson). Il joue donc les parcours en frappant régulièrement son driver aussi loin qu’il le peut, ce qui n’est pas sans rappeler la philosophie « Grip it and Rip It » de John Daly, et en utilisant son avantage en termes de distance pour se rapprocher du green et se mettre en position de jouer un wedge ou un fer court vers le green. Bien que le style de jeu ne soit pas nouveau, de nombreux critiques se sont plaints du fait que le style de J.B. Holmes a donné naissance à une nouvelle vague de golfeurs qui se consacrent à frapper la balle aussi loin qu’ils le peuvent, aidés par les nouveaux équipements de golf offerts par les sociétés de clubs de golf, et à hacher la balle hors du rough sur le green, éliminant ainsi efficacement l’effet égalisateur que le sport du golf offre habituellement aux frappeurs plus courts et précis.

Ryder Cup 2008

Lors de la Ryder Cup 2008, Holmes a battu l’Européen Søren Hansen 2&1 lors des matchs de simple du dimanche pour amener les États-Unis à un point de la victoire dans la Ryder Cup. Jim Furyk a ensuite battu Miguel Ángel Jiménez au 17e trou pour remporter la Ryder Cup. Holmes et un autre coéquipier de la Ryder Cup, Kenny Perry, ont été nommés Kentuckians of the Year pour 2008 par le magazine Kentucky Monthly.

Chirurgie du cerveau

Après avoir tiré 80 au premier tour, Holmes s’est retiré du PGA Championship 2011 en août. Il faisait face à des symptômes de vertige depuis plusieurs mois et a finalement été diagnostiqué avec des défauts structurels dans le cervelet connus sous le nom de malformations de Chiari. Il a subi une opération du cerveau le 1er septembre 2011, et environ un mois plus tard, les médecins ont découvert que Holmes était allergique à l’adhésif utilisé sur la plaque de titane palmée à la base de son crâne. Il a été transporté par avion de sa maison du Kentucky à Johns Hopkins à Baltimore pour une autre opération. Holmes est revenu sur le PGA Tour fin janvier 2012 au Farmers Insurance Open.

2012-15 : Récupération et retour

Après l’opération du cerveau, Holmes a joué dans 26 événements en 2012. Des blessures au coude et à la cheville l’ont limité à six événements du PGA Tour en 2013 et il n’a plus joué jusqu’au Dunlop Phoenix Tournament sur le Japan Golf Tour. Holmes a satisfait à son extension médicale grâce à des gains lors du Zurich Classic de la Nouvelle-Orléans de 2014, terminant T11. Il lui faudrait un T63 au Wells Fargo Championship pour obtenir une entrée au Players Championship 2014 via des points FedEx Cup. Holmes obtiendrait sa première victoire en six ans, retrouverait son statut de Tour jusqu’à la saison 2015-2016, et passerait de la 242e à la 68e place au classement officiel mondial de golf. Cette victoire a également permis à Holmes de participer au championnat PGA 2014 au Valhalla Golf Club de Louisville, dans le Kentucky.

En février 2015, Holmes s’est incliné lors d’un playoff à quatre en mort subite au Farmers Insurance Open. Il détenait une co-maîtrise après l’étape de 54 trous avec Harris English, mais n’a pu réaliser qu’un dernier tour à égalité pour participer au playoff. Au premier trou du playoff, Holmes a réalisé un birdie pour passer au deuxième trou du playoff avec Jason Day, après que English et Scott Stallings aient été éliminés avec des pars. Sur le deuxième trou de playoff par-three, Holmes a volé le vert et n’a pas pu descendre en deux depuis le rough arrière, laissant Day avec deux putts de 15 pieds pour la victoire.

Lors du premier tour du WGC-Cadillac Championship, Holmes a tiré un 62 pour un total de 10-under-par pour mener par quatre coups après le premier jour. Son tour comprenait huit birdies et un eagle pour égaler le record du tournoi. Holmes a conservé son avance après le deuxième tour, malgré un 73 à un au-dessus du niveau de la normale. Il menait de deux coups avant le week-end et a pris cinq coups d’avance après un 70 au troisième tour, avec notamment un trou d’un coup au quatrième trou par-3. Cependant, son avance s’est envolée au sixième trou du dernier tour, après qu’il ait fait trois bogeys sur ses six premiers trous. Holmes a joué le reste de son tour dans un score égal à celui de son adversaire et a tiré un 75 pour terminer à une place du vainqueur Dustin Johnson. Sa deuxième place a fait passer Holmes au 19e rang mondial, son meilleur classement à ce jour.

2018

En janvier 2018, Holmes a été critiqué par ses collègues pros sur les médias sociaux après avoir pris quatre minutes et dix secondes sur son deuxième coup au 18e trou lors du tour final du Farmers Insurance Open. Holmes avait besoin d’un eagle pour se lancer dans un playoff, mais il s’est finalement couché. Holmes a ensuite déclaré qu’il était « choqué » par la réaction négative à l’incident, des commentaires qui ont déclenché une autre réaction négative. Son collègue professionnel Justin Thomas a cependant défendu Holmes, affirmant qu’il aurait fait exactement la même chose s’il avait été dans sa position.

2019

Le 17 février 2019, Holmes a remporté le Genesis Open, sa cinquième victoire sur le PGA Tour et sa première en près de quatre ans. Holmes a comblé un déficit de quatre coups lors du dernier tour pour terminer avec un coup d’avance sur le leader Justin Thomas, au terme d’une dernière journée marathon de 34 trous. Le moment charnière se produisant au 13e trou lors du dernier tour, lorsque Holmes a troué un putt de par de 12 pieds et que Thomas a manqué deux putts courts, ce qui a entraîné un double bogey.

Holmes a partagé la tête des 36 trous de l’Open Championship 2019 à Royal Portrush avec l’Irlandais Shane Lowry. Holmes a tiré des tours d’ouverture de 66-68 pour un total de huit sous. Cependant, il n’a pas été en mesure de le faire le week-end, en tirant 69-87 pour tomber à égalité au 67e rang.