10 tips til optimering af DNA-spytprøver, baseret på millioner af prøver
Som specialister inden for indsamling af spytprøver forstår vi, at det er afgørende for din forskningsundersøgelse at have DNA-spytprøver, der er optimeret til at sikre de bedst mulige resultater.
Den høje udbyttegrad og kvalitet af DNA fra spyt gør det muligt for vores kunder at udføre flere undersøgelser og generere flere data og dermed fremskynde deres forskning. Derudover giver ikke-invasive indsamlingsmuligheder som Oragene forskerne og deltagerne en indsamlingsmetode, som de faktisk kan lide.
Vi tænkte, at det ville være nyttigt at fremhæve gennemprøvede tips og tricks til optimering af dine prøver. Vi ved, hvad der skal til for at få gode resultater fra spytprøver, og vi har mange års erfaring til at bakke det op.
Vi har samlet vores 10 bedste måder at optimere DNA-spytprøver på, som kan bidrage til din succes. Mens du læser, kan du spørge dig selv, om nogle af disse tips kan være nyttige i dit laboratorium. Og hvis du har yderligere tips at dele, så lad os vide det på Twitter, Linkedin eller på vores Facebook-side.
Optimering baseret på indsamling
- Det er vigtigt at følge indsamlingsvejledningen nøje. Sørg for, at forsøgspersoner afleverer den nødvendige mængde spyt og ikke spiser/drikker/ryger/tygger tyggegummi i 30 minutter, før de afleverer en prøve. Hvis disse anbefalinger ikke følges, kan det resultere i et reduceret DNA-udbytte.
- Når man spytter, tæller bobler ikke med. Sørg for, at det flydende spyt er ved “Fill To”-linjen; eventuelle bobler skal være over linjen. Dette vil sikre, at der opsamles den optimale mængde spyt. Hvis du opsamler mindre spyt, påvirkes kvaliteten ikke, men DNA-udbyttet vil blive reduceret proportionelt.
- DNA-udbyttet varierer fra donor til donor. Det er vigtigt at teste prøver fra forskellige donorer for at få et nøjagtigt billede af det udbytte, du kan forvente.
- For donorer, der har problemer med at spytte 2 ml, kan spytstrømmen ofte stimuleres ved at gnide kinderne, lige bag bag bagtænderne. Du kan også stimulere spytproduktionen ved at bruge en knivspids sukker på tungen. Man behøver kun en lille smule; lige nok til, at personen kan smage det. En dråbe citronsaft virker også.
- Det kan nogle gange være svært at indsamle fra en person, der ikke er i stand til at spytte på kommando, f.eks. et yngre barn. Hvis du bruger et indsamlingssæt, der er beregnet til personer, der ikke spytter, f.eks. Oragene assisteret indsamling (OG-675) eller ORAcollect for pædiatri (OC-175), vil det gøre prøveudtagningen lettere for både dig og donoren og sikre, at du indsamler tilstrækkeligt med DNA.
Procesbaseret optimering
- Inkubationstrinnet ved 50 °C skal udføres i det oprindelige prøverør, inden der udtages en alikvot til DNA-ekstraktion. Inkubationen behøver kun at blive udført én gang; du behøver ikke at gentage dette trin, når du ekstraherer DNA fra efterfølgende alikvotes.
- Medmindre der tages særlige skridt til at fjerne RNA, vil RNA blive sampurificeret med DNA. Vi anbefaler, at du kvantificerer dit DNA ved hjælp af fluorescens (f.eks. Picogreen), da UV-absorption kan overvurdere mængden af DNA.
- Hvis din downstream-applikation kræver høje koncentrationer af DNA, kan du øge koncentrationen ved at reducere mængden af buffer, der anvendes til opløsning af DNA-pelletet fra 100 µL til 50 µL. Det er altid lettere at fortynde DNA’et senere i stedet for at skulle koncentrere det.
- Oragene/saliva-prøver er stabile ved stuetemperatur i årevis. Hvis du ikke kan ekstrahere dem med det samme, er det ikke nødvendigt at nedkøle eller nedfryse dem; lad dem bare ligge på bænken.
- Sørg for tilstrækkelig tid til, at DNA’et opløses efter ekstraktionen. DNA, der er ekstraheret fra Oragene/saliva-prøver ved hjælp af prepIT-L2P-metoden, har en ekstremt høj molekylvægt og vil derfor tage tid om at opløses fuldstændigt. Efter ekstraktionen anbefaler vi, at man lader prøven stå ved stuetemperatur natten over for at give DNA’et mulighed for at opløses helt. Hvis DNA’et ikke opløses fuldstændigt, kan det påvirke nøjagtigheden af kvantificeringen.
Dette er vores 10 bedste måder at optimere DNA-prøver på. Har du noget at tilføje til listen? Efterlad venligst en kommentar, og lad os vide det.
Klik på knappen Anmod om kits nedenfor, hvis du er interesseret i at anmode om gratis Oragene-prøvesæt, eller du kan sende os en e-mail på [email protected].
Relaterede blogs:
Hvordan man udfører DNA-prøveindsamling i stor skala til genetisk forskning – 10 vigtige overvejelser
8 fakta, som de fleste mennesker ikke ved om DNA fra spyt