Chronisk infektion med Helicobacter pylori (H. pylori) är en känd riskfaktor för magcancer. Utrotningsgraden av H. pylori-infektion genom den klassiska trippelbehandlingen med PPI och antibiotika är låg. Probiotika är därför ett användbart verktyg för att förbättra utrotningsgraden och minska biverkningarna. Flera studier i djurmodeller visade att Lactobacillus spp. ensamma och i kombination med andra probiotiska stammar har hämmande effekter på tillväxt och undertryckande av inflammatoriska reaktioner vid H. pylori-infektioner. Vissa studier visade dock att Pediococcus-stammar har betydande effekter på undertryckande, överlevnad och utrotning av H. pylori-infektioner. Det föreslås därför att man vid behandling av H. pylori-infektioner tillsammans med de vanliga probiotiska stammarna skulle kunna använda olika Pediococcus-stammar vid sidan av de vanliga probiotiska stammarna. Nya studier visade att Lactobacillus reuteri och Lactobacillus gasseri ensamma med PPI hos människor har en hög eradikeringseffekt på H. pylori-infektioner och det föreslås som probiotisk behandling av patienter i framtida terapeutiska protokoll. När det gäller den probiotiska behandlingsprocessen bör det inte rekommenderas att probiotika skulle kunna användas som en enda behandling för utrotning av H. pylori. Användning av probiotika som ett komplement kommer dock att öka eradikeringen och minska biverkningarna i samband med behandlingen. Det anses allmänt att probiotika skulle kunna förbättra eradikeringen av H. pylori och minska biverkningarna under standardbehandling, men vissa probiotiska bakteriearter skulle kunna vara användbara tillsammans med läkemedelsbehandling. Generellt sett skulle probiotiska kosttillskott kunna öka utrotningsgraden av H. pylori-infektioner och minska biverkningarna av antibiotika.