Penisen är det manliga könsorganet och består av rot, kropp och ollon (Fig. 8-19). Penisens crura utgörs av två corpora cavernosa och bulben, som är den kaudala expansionen av corpus spongiosum, utgör penisroten. Penisens crura är fixerad vid ischiasbågen och täcks av m. ischiocavernosus, medan penisbulben täcks av m. bulbospongiosum (fig. 8-19). Peniskroppen är belägen mellan roten och ollonet. Hos musen har peniskroppen en böjning som gör att penisens glans är riktad kaudalt när den inte är upprest. Under erektion är glansens riktning omvänd (fig. 8-19). Peniskroppen består av en enda corpus cavernosum och corpus spongiosum, som omger urinröret. Corpus cavernosum har två spår, ett dorsalt spår, som innehåller penisens blodkärl, och ett ventralt spår, där corpus spongiosum finns (fig. 8-20). Både corpus cavernosum och corpus spongiosum utgörs av kärlhålor omgivna av bindväv (fig. 8-20 och 8-26). Det tredimensionella arrangemanget av kollagenfibrerna i corpus cavernosums trabekel varierar beroende på vilket område som undersöks och kan lätt observeras med hjälp av polariserat ljus (fig. 8-20).