Bonner är medförfattare till Financial Reckoning Day: Surviving The Soft Depression of The 21st Century och Empire of Debt tillsammans med Addison Wiggin. Han är också medförfattare till Mobs, Messiahs and Markets tillsammans med Lila Rajiva. Den sistnämnda publikationen vann GetAbstract International Book Award 2008. Han har tidigare varit medförfattare till två korta pamfletter tillsammans med den brittiske mediehistorikern John Campbell och den tidigare chefredaktören för The Times, Lord William Rees-Mogg, och han har varit medförfattare till en essäbok tillsammans med den intellektuella historikern Pierre Lemieux.

I sina två finansiella böcker, liksom i The Daily Reckoning, har Bonner hävdat att USA:s finansiella framtid är i fara på grund av olika ekonomiska och demografiska trender, varav inte minst USA:s stora handelsunderskott är en viktig faktor. Han hävdar att USA:s utrikespolitiska bedrifter är liktydiga med upprättandet av ett imperium, och att kostnaderna för att upprätthålla ett sådant imperium kan påskynda USA:s eventuella nedgång. Bonner hävdar i sin senaste bok att pöbel- och massvillfarelser är en del av det mänskliga tillståndet.

Bonner varnade 2015 för att kreditsystemet, som har varit den väsentliga grunden för den amerikanska ekonomin sedan 1950-talet, oundvikligen kommer att misslyckas, vilket kommer att leda till ett katastrofalt misslyckande för banksystemet.