Als je nog nooit van een vliegtuig of een koelkast had gehoord, zou je dan denken dat het een wonder was toen er een arriveerde? Toen het Amerikaanse leger tijdens de Tweede Wereldoorlog landde op een afgelegen eiland in de Stille Zuidzee, waren de eilandbewoners verbaasd over de fantastische vracht van Amerika – vliegtuigen, vrachtwagens, koelkasten, ingeblikt voedsel. Ze dachten dat zulke goederen alleen van de Goden konden komen. Onder leiding van de mysterieuze profeet John, werd een religie geboren, de John Frum Beweging, ook bekend als een Cargo Cult.
De John Frum Beweging bestaat nog steeds in één dorp op de eilanden van Vanuatu; de leiders gaan nog steeds met de geest van John spreken in heilige grotten en gelovigen zingen elke vrijdagavond liederen over hem. Hoewel de VS het eiland Tanna vergeten zijn, wappert de Amerikaanse vlag hoog boven het dorp Lamakara en marcheren jonge mannen in formatie, Amerikaanse soldaten imiterend. Lamakara is het laatste bolwerk van de John Frum-beweging, maar wordt vandaag de dag geteisterd door druk van buitenaf en interne conflicten. Waiting for John verkent deze bijzondere religie vanuit het perspectief van het laatste dorp van gelovigen, terwijl ze worstelen om hun manier van leven te behouden. Tijdens het proces stelt deze film de vraag: waar komen profeten vandaan? En wat doet mensen geloven?