10 tips om DNA-speekselmonsters te optimaliseren, gebaseerd op miljoenen monsters

sep 10, 2021
admin

Als specialisten op het gebied van het afnemen van speekselmonsters begrijpen wij dat het hebben van DNA-speekselmonsters die zijn geoptimaliseerd om de best mogelijke resultaten te garanderen, van cruciaal belang is voor uw onderzoek.

Het hoge rendement en de hoge kwaliteit van het DNA uit speeksel stelt onze klanten in staat om meer studies uit te voeren en meer gegevens te genereren, waardoor hun onderzoek wordt versneld. Bovendien, het hebben van niet-invasieve collectie opties zoals Oragene bieden onderzoekers en deelnemers met een collectie methode die ze eigenlijk willen.

We dachten dat het nuttig zou zijn om bewezen tips en trucs voor het optimaliseren van uw monsters te markeren. We weten wat er nodig is om geweldige resultaten uit speekselmonsters te krijgen en we hebben jarenlange ervaring om dat te ondersteunen.

We hebben onze top 10 manieren samengesteld om DNA-speekselmonsters te optimaliseren die kunnen bijdragen aan uw succes. Terwijl u leest, vraag uzelf af of een van deze tips nuttig kan zijn in uw lab. En als u aanvullende tips hebt om te delen, laat het ons weten op Twitter, Linkedin of op onze Facebook-pagina.

Optimalisatie op basis van collectie

  1. Het is belangrijk om de collectie-instructies nauwkeurig op te volgen. Zorg ervoor dat de proefpersonen de vereiste hoeveelheid speeksel afgeven en niet eten/drinken/roken/kauwgom kauwen gedurende 30 minuten voor het afgeven van een monster. Het niet opvolgen van deze aanbevelingen kan resulteren in een verminderde DNA-opbrengst.
  2. Bij spugen tellen belletjes niet. Zorg ervoor dat het vloeibare speeksel zich op de ‘Fill To’-lijn bevindt; eventuele aanwezige bubbels moeten zich boven de lijn bevinden. Dit zal ervoor zorgen dat de optimale hoeveelheid speeksel wordt verzameld. Als u minder speeksel verzamelt, heeft dat geen invloed op de kwaliteit, maar de DNA-opbrengst zal evenredig afnemen.
  3. De DNA-opbrengst zal variëren tussen donoren. Het is belangrijk om monsters van verschillende donoren te testen om een nauwkeurig beeld te krijgen van de opbrengsten die u kunt verwachten.
  4. Voor donoren die moeite hebben met het spugen van 2 ml, kan de speekselvloed vaak worden gestimuleerd door over de wangen te wrijven, net achter de achterste tanden. U kunt de speekselproductie ook stimuleren met een snufje suiker op de tong. Je hebt maar een heel klein beetje nodig; net genoeg dat de persoon het kan proeven. Een druppel citroensap werkt ook.
  5. Soms kan het moeilijk zijn om te spugen bij iemand die niet op commando kan spugen, zoals een jong kind. Met behulp van een afnameset die is ontworpen voor niet-spuwers, zoals Oragene assisted collection (OG-675) of ORAcollect voor pediatrie (OC-175), wordt het afnemen van monsters gemakkelijker voor zowel u als de donor en bent u er zeker van dat u voldoende DNA verzamelt.

Optimalisatie op basis van verwerking

  1. De incubatiestap bij 50°C moet in het oorspronkelijke monsterbuisje worden uitgevoerd, voordat een aliquot voor DNA-extractie wordt genomen. De incubatie hoeft slechts eenmaal te worden uitgevoerd; u hoeft deze stap niet te herhalen bij het extraheren van DNA uit volgende aliquots.
  2. Tenzij specifieke stappen worden ondernomen om RNA te verwijderen, zal RNA co-purificeren met DNA. Wij raden aan uw DNA te kwantificeren door fluorescentie (bijv. Picogreen), aangezien UV-absorptie de hoeveelheid DNA kan overschatten.
  3. Als uw downstream-toepassing hoge concentraties DNA vereist, kunt u de concentratie verhogen door de hoeveelheid buffer die wordt gebruikt om de DNA-pellet op te lossen, te verlagen van 100 µL naar 50 µL. Het is altijd gemakkelijker om het DNA later te verdunnen in plaats van het te moeten concentreren.
  4. Oragene/saliva monsters zijn jarenlang stabiel bij kamertemperatuur. Als u ze niet meteen kunt extraheren, hoeft u ze niet te koelen of in te vriezen; laat ze gewoon op de bank liggen.
  5. Zorg ervoor dat het DNA na extractie voldoende tijd heeft om op te lossen. DNA dat met de prepIT-L2P-methode uit Oragene/salivamonsters is geëxtraheerd, heeft een zeer hoog molecuulgewicht en zal daarom tijd nodig hebben om volledig op te lossen. Na extractie raden wij aan het monster een nacht bij kamertemperatuur te laten staan om het DNA volledig te laten oplossen. Als het DNA niet volledig oplost, kan dit de nauwkeurigheid van de kwantificering beïnvloeden.

Dit zijn onze top 10 manieren om DNA-monsters te optimaliseren. Heeft u iets toe te voegen aan de lijst? Laat dan een reactie achter en laat het ons weten.

Klik op de aanvraag kits knop hieronder als u geïnteresseerd bent in het aanvragen van gratis Oragene proefkits, of u kunt ons e-mailen op [email protected].

Gerelateerde Blogs:

Hoe grootschalige DNA-monsterafname voor genetisch onderzoek uit te voeren – 10 essentiële overwegingen

8 feiten die de meeste mensen niet weten over DNA uit speeksel

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.