Sylkinäytteiden keruun asiantuntijoina ymmärrämme, että syljen DNA-näytteet, jotka on optimoitu parhaiden mahdollisten tulosten varmistamiseksi, ovat ratkaisevan tärkeitä tutkimustesi kannalta.

Syljestä saatavan DNA:n suuri saanto ja korkea laatu mahdollistavat asiakkaidemme useampien tutkimusten tekemisen ja suuremman määrän dataa tuottamisen, mikä kiihdyttää heidän tutkimustaan. Lisäksi Oragenen kaltaiset ei-invasiiviset keräysvaihtoehdot tarjoavat tutkijoille ja osallistujille keräysmenetelmän, josta he todella pitävät.

Ajattelimme, että olisi hyödyllistä tuoda esiin hyväksi havaittuja vinkkejä ja niksejä näytteiden optimoimiseksi. Tiedämme, mitä tarvitaan hyvien tulosten saamiseksi sylkinäytteistä, ja meillä on vuosien kokemus sen tueksi.

Olemme koonneet 10 tärkeintä tapaa optimoida DNA-sylkinäytteitä, jotka voivat edistää menestystäsi. Kun luet, kysy itseltäsi, voisiko jokin näistä vinkeistä olla hyödyllinen laboratoriossasi. Ja jos sinulla on muita vinkkejä jaettavaksi, kerro niistä meille Twitterissä, Linkedinissä tai Facebook-sivullamme.

Keräykseen perustuva optimointi

1. On tärkeää noudattaa keräysohjeita tarkasti. Varmista, että koehenkilöt antavat vaaditun määrän sylkeä eivätkä syö/juo/polta/pura/pureskele purukumia 30 minuuttiin ennen näytteen antamista. Näiden suositusten noudattamatta jättäminen voi johtaa DNA:n saannin vähenemiseen.
2. Syljettäessä kuplia ei lasketa. Varmista, että nestemäinen sylki on ”Fill To” -viivan kohdalla; mahdollisten kuplien tulisi olla viivan yläpuolella. Näin varmistetaan, että optimaalinen määrä sylkeä kerätään. Jos keräät vähemmän sylkeä, se ei vaikuta laatuun, mutta DNA:n saanto pienenee samassa suhteessa.
3. DNA:n saanto vaihtelee luovuttajien välillä. On tärkeää testata näytteitä eri luovuttajilta, jotta saat tarkan kuvan odotettavissa olevasta tuotoksesta.
4. Luovuttajille, joilla on vaikeuksia sylkeä 2 ml:aa, syljen virtausta voidaan usein stimuloida hieromalla poskia juuri takahampaiden takana. Syljeneritystä voi myös stimuloida käyttämällä ripaus sokeria kielellä. Tarvitaan vain pieni määrä; juuri sen verran, että henkilö voi maistaa sen. Myös tippa sitruunamehua toimii.
5. Joskus voi olla vaikeaa kerätä sylkeä henkilöltä, joka ei pysty sylkemään käskystä, kuten nuoremmalta lapselta. Käyttämällä ei-sylkijöille suunniteltua näytteenottopakkausta, kuten Oragene assisted collection (OG-675) tai ORAcollect for pediatrics (OC-175), näytteenotto on helpompaa sekä sinulle että luovuttajalle ja varmistat, että keräät riittävästi DNA:ta.

Käsittelyyn perustuva optimointi

1. 50 °C:n inkubaatiovaihe on suoritettava alkuperäisessä näyteputkessa, ennen kuin otetaan aliquot DNA:n uuttamista varten. Inkubaatio on tehtävä vain kerran; tätä vaihetta ei tarvitse toistaa, kun DNA:ta uutetaan seuraavista aliquoteista.
2. Ellei RNA:n poistamiseksi toteuteta erityisiä toimenpiteitä, RNA puhdistuu yhdessä DNA:n kanssa. Suosittelemme DNA:n kvantifiointia fluoresenssin avulla (esim. Picogreen), koska UV-absorbanssi saattaa yliarvioida DNA:n määrän.
3. Jos jatkokäyttösovelluksesi vaatii korkeita DNA-konsentraatioita, voit lisätä konsentraatiota vähentämällä DNA-pelletin liuottamiseen käytettävän puskurin määrää 100 µl:stä 50 µl:aan. On aina helpompaa laimentaa DNA:ta myöhemmin kuin konsentroida sitä.
4. Oraani-/sylkinäytteet säilyvät huoneenlämmössä vuosia. Jos et voi uuttaa niitä heti, niitä ei tarvitse jäähdyttää tai pakastaa; jätä ne vain pöydälle.
5. Varmista, että DNA:lle jää riittävästi aikaa liueta uuton jälkeen. Oragene-/sylkinäytteistä prepIT-L2P-menetelmällä uutettu DNA on erittäin suuren molekyylipainon omaavaa, joten sen täydellinen liukeneminen vie aikaa. Suosittelemme, että näytteen annetaan uuton jälkeen olla huoneenlämmössä yön yli, jotta DNA liukenee kokonaan. Jos DNA ei liukene kokonaan, se voi vaikuttaa kvantifioinnin tarkkuuteen.

Nämä ovat 10 tärkeintä tapaa optimoida DNA-näytteet. Onko sinulla jotain lisättävää luetteloon? Jätä kommentti ja kerro meille.

Klikkaa alla olevaa Request kits -painiketta, jos olet kiinnostunut pyytämään ilmaisia Oragene-kokeilupakkauksia, tai voit lähettää meille sähköpostia osoitteeseen [email protected].

Seuraavat blogit:

Miten toteutetaan laajamittainen DNA-näytteiden keräys geneettistä tutkimusta varten – 10 olennaista näkökohtaa

8 faktaa, joita suurin osa ihmisistä ei tiedä DNA:sta, joka kerätään syljestä,

>