V roce 1964 se do vysílání na 39. kanálu přihlásila W39AA, překladatel televize WBGU-TV v Bowling Green ve státě Ohio. Před rokem 1974 bylo Fort Wayne jedinou oblastí v Indianě bez přístupu k programům PBS i v kabelové televizi (bylo běžnou praxí, že PBS nabízela programy komerčním stanicím na trzích bez členských stanic PBS, ale dosud se neobjevily žádné důkazy týkající se přenosu programů této sítě ve Fort Wayne); pokrytí W39AA bylo obecně omezeno na nejbližší okolí Fort Wayne, protože jeho pokrytí nebylo dostatečně silné, aby pokrylo celý trh. Tato stanice s malým výkonem byla pouze náhradní, protože kanál 39 byl ve Fort Wayne přidělen jako vzdělávací kanál s plným výkonem. Počátkem 80. let se stanice stala translátorem stanice PBS WFYI z Indianapolisu.

Dne 12. března 1985 získala místní veřejnoprávní televizní skupina od FCC slot 39. kanálu a udělila stanici licenci pod volacími písmeny WFWA; WFWA se přihlásila do vysílání 5. prosince 1986, čímž severovýchodní Indiana poprvé v historii získala vlastní stanici PBS.

V roce 2003 se WFWA stala první televizní stanicí na trhu Fort Wayne, která vysílala digitální signál a původně přenášela národní HDTV kanál PBS na samostatném subkanálu od běžného programu; problémy s financováním později způsobily, že národní HD kanál byl stažen a všechny programy zůstaly několik let ve standardním rozlišení. Bylo oznámeno, že hlavní kanál WFWA 39.1 bude vysílat ve vysokém rozlišení na plný úvazek někdy v létě 2010. Během přestávky na sliby v létě 2010 generální ředitel Bruce Haines oznámil, že ke změně dojde 4. července 2010 v 19:30. Díky pokrokům v kompresi videa byla stanice schopna upgradovat svůj hlavní kanál na HD, aniž by obětovala kvalitu obrazu svých dalších tří subkanálů SD.

V květnu 2013 stanice oznámila sbírku finančních prostředků na modernizaci své infrastruktury v příštích třech letech, včetně posílení signálu, nákupu zařízení pro vzdálenou produkci a vylepšení hlavního řízení stanice.

.