Vlastní hipokampus má čtyři oblasti, které tvoří nervový okruh nazývaný trisynaptický okruh.

CA1Edit

CA1 je první oblastí hipokampálního okruhu, z níž vede hlavní výstupní dráha do vrstvy V entorhinální kůry. Další významný výstup je do subikula.

CA2Edit

CA2 je malá oblast nacházející se mezi CA1 a CA3. Dostává určitý vstup z vrstvy II entorhinální kůry prostřednictvím perforační cesty. Její pyramidové buňky se více podobají buňkám v CA3 než v CA1. Kvůli své malé velikosti je často ignorována.

CA3Edit

CA3 dostává vstup z mozaikovitých vláken granulárních buněk v dentátovém gyru a také z buněk v entorhinální kůře prostřednictvím perforační dráhy. Dráha mozaikových vláken končí ve stratum lucidum. Perforační dráha prochází stratum lacunosum a končí ve stratum moleculare. Existují také vstupy z mediálního septa a z diagonálního pásu Broca, které končí ve stratum radiatum, spolu s komisurálními spojeními z druhé strany hipokampu.

Pyramidové buňky v CA3 vysílají některé axony zpět do hilu dentate gyrus, ale většinou se promítají do oblastí CA2 a CA1 prostřednictvím Schafferových kolaterál. Existuje také značný počet rekurentních spojení, která končí v CA3. Jak rekurentní spojení, tak Schafferovy kolaterály končí přednostně v oblasti septa dorzálním směrem od výchozích buněk. CA3 také vysílá malý soubor výstupních vláken do laterálního septa.

Oblast se konvenčně dělí na tři oddíly. CA3a je část buněčného pásu, která je nejvíce vzdálená od dentátu (a nejblíže k CA1). CA3b je střední část pásu, která je nejblíže fimbrii a spojení fornixů. CA3c je nejblíže k dentátu a zasahuje do hilu. CA3 je celkově považován za „pacemaker“ hipokampu. Zdá se, že velká část synchronní burstingové aktivity spojené s interiktální epileptiformní aktivitou vzniká v CA3. Zdá se, že za to je zodpovědná především jeho excitační kolaterální konektivita. CA3 má jedinečné kolaterály z axonů pyramidových buněk, které se rozsáhle rozvětvují s místními oblastmi a navazují s nimi excitační kontakty. CA3 byla zahrnuta do řady pracovních teorií o paměti a procesech učení v hipokampu. Pomalé oscilační rytmy (pásmo theta; 3-8 Hz) jsou cholinergně řízené vzorce, které závisí na spojení interneuronů a axonů pyramidových buněk prostřednictvím gap junctions, jakož i glutaminergních (excitačních) a GABAergních (inhibičních) synapsí. Ostré vlny EEG, které jsou zde pozorovány, se také podílejí na konsolidaci paměti.

CA4Edit

CA4 se často nazývá hilus nebo hilová oblast, pokud se považuje za součást dentátového gyru. Na rozdíl od pyramidových neuronů v CA1 a CA3 zde neurony zahrnují mozkové buňky, které primárně přijímají vstupy z granulárních buněk v dentátovém gyru ve formě mozkových vláken. Dostávají také malý počet spojení od pyramidových buněk v CA3. Ty se zase promítají zpět do dentátového gyru na vzdálených septotemporálních úrovních

.