Penis je mužský kopulační orgán a skládá se z kořene, těla a žaludu (obr. 8-19). Crura penisu je tvořena dvěma corpora cavernosa a bulbus, který je kaudálním rozšířením corpus spongiosum, tvoří kořen penisu. Crura penisu je fixována v ischiatickém oblouku a je kryta m. ischiocavernosus, zatímco bulbus penisu je kryt m. bulbospongiosum (obr. 8-19). Tělo penisu se nachází mezi kořenem a žaludem. U myši má tělo penisu flexi, která způsobuje, že v neztopořeném stavu směřuje žalud penisu kaudálně. Při erekci je směr žaludu obrácený (obr. 8-19). Tělo penisu se skládá z jednoho corpus cavernosum a corpus spongiosum, které obklopuje močovou trubici. Corpus cavernosum má dvě rýhy, dorzální rýhu, která obsahuje cévy penisu, a ventrální rýhu, kde se nachází corpus spongiosum (obr. 8-20). Jak corpus cavernosum, tak corpus spongiosum jsou tvořeny cévními dutinami obklopenými vazivovou tkání (obr. 8-20 a 8-26). Trojrozměrné uspořádání kolagenních vláken v trabekulách corpus cavernosum se liší v závislosti na vyšetřované oblasti a lze je snadno pozorovat pomocí polarizovaného světla (obr. 8-20).