Druhy Achromobacter a Alcaligenes

Taxonomické označení druhů Achromobacter a Alcaligenes je obzvláště matoucí. Achromobacter xylosoxidans byl přejmenován na Alcaligenes xylosoxidans subsp. xylosoxydans, ale analýza sekvence 16S rRNA a studie obsahu guaninu a cytozinu podporují zařazení tohoto organismu zpět do rodu Achromobacter.88 Další druhy rodu Alcaligenes, A. ruhlandii, A. piechaudii a A. denitrificans, byly rovněž převedeny do Achromobacter. Organismy dříve považované za Achromobacter skupiny A, C a D (a předtím CDC skupiny Vd-1 a Vd-2) se nyní nazývají Ochrobactrum anthropi a jsou považovány za samostatné. Druhy Achromobacter jsou nefermentující gramnegativní bacily vyskytující se v půdě a vodě, včetně bazénů, studniční vody, dialyzačních roztoků a roztoků chlorhexidinu. Příležitostně mohou být získány z respiračního a gastrointestinálního traktu, především u osob přicházejících do styku se zdravotní péčí. K infekci dochází, když se dostanou do ran nebo kolonizují osoby s oslabenou obranyschopností hostitele. Mezi klinicky významné druhy patří asacharidové druhy A. dentrificans, A. piechaudii a Alcaligenes faecalis (tento organismus zůstává v rodě Alcaligenes); sacharolytický druh A. xylosoxidans a bezejmenný Achromobacter skupiny F. Ačkoli je někdy považován za kontaminant, byl Achromobacter skupiny B (nyní klasifikovaný spolu s Achromobacterem skupiny E jako Pannonibacter phragmitetus) získán z krve pacientů s klinickou sepsí a endokarditidou.89

A. xylosoxidans je z těchto organismů klinicky nejdůležitější. Pravděpodobně je součástí endogenní mikrobioty ucha a gastrointestinálního traktu a je běžným kontaminantem tekutin.90 Tento organismus se podílel na propuknutí nozokomiální infekce spojené s kontaminovanými roztoky (např. intravenózní tekutiny, hemodialyzační tekutina, irigační tekutiny, ústní vody), tlakovými převodníky, inkubátory a zvlhčovači a kontaminovanými mýdly a dezinfekčními prostředky.91 V jednom případě bakteriémie byla zdrojem infekce kontaminace vody ze studny.92 Klinické onemocnění způsobené A. xylosoxidans zahrnovalo izoláty z krve, peritoneálních a pleurálních tekutin, moči, respiračních sekretů a exsudátů z ran. Bakteriémie, často související s intravaskulárními katétry, je nejčastěji hlášenou infekcí a u pacientů se základními malignitami je často polymikrobiální.93,94 Byla hlášena sepse žlučových cest, meningitida (někdy s převahou lymfocytů v mozkomíšním moku), pneumonie (nozokomiální i komunitní), peritonitida (včetně spontánní bakteriální peritonitidy a peritonitidy u pacientů na kontinuální ambulantní peritoneální dialýze), infekce močových cest, konjunktivitida, osteomyelitida, infekce protetického kolene, infekce síťky, infikovaná nekrotizující pankreatitida a endokarditida protetické chlopně.90,91-99 Pacienti jsou často v imunosuprimovaném stavu, například v důsledku nádorového onemocnění nebo infekce HIV, ale ne vždy tomu tak je, zejména v případě nozokomiálních epidemií.94,98 A. xylosoxidans i další druhy Achromobacter byly stále častěji získávány z respiračních sekretů osob s cystickou fibrózou.99 Kolonizace byla spojena s exacerbací respiračních symptomů, pravděpodobně v důsledku zhoršení zánětlivé reakce způsobené lipopolysacharidem (LPS) a cytotoxickým faktorem produkovaným Achromobacterem.99,100 Několik studií případů a kontrol neprokázalo rychlejší zhoršení klinického stavu nebo stavu plicních funkcí u pacientů s cystickou fibrózou chronicky kolonizovaných druhy Achromobacter nebo Alcaligenes, s výjimkou podskupiny pacientů s rychlým nárůstem specifických precipitačních protilátek proti A. xylosoxidans.101 Zotavení u novorozenecké infekce může být důsledkem perinatálního přenosu od matky.102

A. denitrificans byl získán jako jediný patogen z krve, mozkomíšního moku a jiných normálně sterilních tělních tekutin, jakož i z ledvinového abscesu a ve smíšené kultuře z míst obvykle obsahujících normální mikrobiotu.103 Jen málo nedávných publikací se zabývalo patogenní úlohou těchto organismů. Předpokládá se, že A. piechaudii způsobuje chronickou otitidu u pacienta s diabetem104 a byl také získán z krve u pacienta s hematologickou malignitou a infikovaným Hickmanovým katétrem, který měl opakované bakteriémie.105

Alcaligenes faecalis lze získat v různých klinických situacích. Většina izolátů A. faecalis z krve nebo respiračních sekretů souvisí s kontaminací nemocničního vybavení nebo tekutin tímto organismem s následnou kolonizací nebo infekcí člověka. Dalším častým místem výskytu je moč, ačkoli jen zřídka způsobuje symptomatickou infekci močových cest. Byl také získán z rohovkových vředů, ušních výpotků, drénů z ran, peritoneální tekutiny a výkalů.106-108 Z žádného z těchto míst se vzácně získává v čisté kultuře.

Fylogeneticky a biochemicky jsou Alcaligenes a Achromobacter úzce příbuzné s rodem Bordetella. Druhy Achromobacter dobře rostou na standardních mikrobiologických médiích, včetně MacConkey agaru. Vytvářejí ploché, rozprostřené a drsné kolonie a mají peritrichní bičíky, což je odlišuje od pseudomonád. Většina kmenů roste také na selektivním agaru Burkholderia cepacia. Tyto organismy jsou oxidáza pozitivní a kataláza pozitivní a oxidují glukózu za vzniku kyseliny, ale jsou ureáza negativní a indol negativní. A. xylosoxidans, jak napovídá druhové jméno, snadno oxiduje xylózu, čímž se liší od ostatních druhů rodu. Rozlišení organismů a potvrzení identifikace je ztíženo jejich nedostatečnou reaktivitou v mnoha biochemických nebo asimilačních testech. Hmotnostní spektrometrie MALDI-TOF nabízí přesnou identifikaci této skupiny organismů a bude hrát stále větší roli, jak se tato technologie bude více využívat.

Izolát A. xylosoxidans může být snadno zaměněn za kmen Pseudomonas, který není P. aeruginosa, nebo za kmen komplexu B. cepacia, ale neobvyklý vzorec citlivosti naznačuje správnou identitu. A. faecalis produkuje charakteristický nasládlý zápach připomínající zápach zelených jablek. Piperacilin-tazobaktam a karbapenemy jsou účinné in vitro a byly by vhodnou počáteční terapií u závažných infekcí vyvolaných A. xylosoxidans, zatímco trimethoprim-sulfametoxazol lze použít u infekcí močových cest a jiných infekcí nevyžadujících parenterální terapii. Ceftazidim má rovněž aktivitu, ačkoli kmeny jsou obecně rezistentní k ostatním cefalosporinům, úzkospektrým penicilínům, aztreonamu a aminoglykosidům. Citlivost na fluorochinolony je různá. Vysoké koncentrace kolistinu inhibují většinu kmenů. U kmenů izolovaných od pacientů s cystickou fibrózou byla zaznamenána vysoká míra rezistence k ciprofloxacinu a aminoglykosidům. Mechanismy rezistence zahrnují konstitutivní oxacilinázu a získané β-laktamázy, jakož i multidrug efflux pumpy.109 Přítomnost metallo-β-laktamázových genů typu IMP, VIM nebo TMB nesených na přenosných integronech třídy 1 může vyvolat rezistenci ke karbapenemům a představuje potenciál pro horizontální přenos.110,111

Kmeny A. faecalis jsou obvykle citlivé na trimethoprim-sulfametoxazol, ureidopeniciliny, karbapenemy a na rozdíl od druhů rodu Achromobacter na většinu cefalosporinů.107 Výsledky se liší u aztreonamu, fluorochinolonů a aminoglykosidů, častá je rezistence na gentamicin.107 U A. faecalis byla také popsána produkce β-laktamáz s rozšířeným spektrem.