10 Tipps zur Optimierung von DNA-Speichelproben, basierend auf Millionen von Proben
Als Spezialisten auf dem Gebiet der Speichelprobenentnahme wissen wir, dass optimierte Speichel-DNA-Proben zur Gewährleistung bestmöglicher Ergebnisse für Ihre Forschungsstudie von entscheidender Bedeutung sind.
Die hohe Ausbeute und die hohe Qualität der DNA aus Speichel ermöglichen es unseren Kunden, mehr Studien durchzuführen und mehr Daten zu generieren, wodurch ihre Forschung beschleunigt wird. Darüber hinaus bieten nicht-invasive Entnahmeoptionen wie Oragene den Forschern und Teilnehmern eine Entnahmemethode, die sie tatsächlich mögen.
Wir dachten, es wäre hilfreich, bewährte Tipps und Tricks zur Optimierung Ihrer Proben hervorzuheben. Wir wissen, was nötig ist, um großartige Ergebnisse aus Speichelproben zu erhalten, und wir haben jahrelange Erfahrung, um dies zu bestätigen.
Wir haben unsere 10 besten Möglichkeiten zur Optimierung von DNA-Speichelproben zusammengestellt, die zu Ihrem Erfolg beitragen können. Fragen Sie sich beim Lesen, ob einer dieser Tipps auch für Ihr Labor nützlich sein könnte. Und wenn Sie weitere Tipps haben, lassen Sie es uns auf Twitter, Linkedin oder auf unserer Facebook-Seite wissen.
Erhebungsbasierte Optimierung
- Es ist wichtig, die Anweisungen zur Erhebung genau zu befolgen. Stellen Sie sicher, dass die Probanden die erforderliche Speichelmenge abgeben und 30 Minuten vor der Probenabgabe nicht essen/trinken/rauchen/kaugummi kauen. Die Nichtbeachtung dieser Empfehlungen kann zu einer verminderten DNA-Ausbeute führen.
- Beim Spucken zählen Blasen nicht. Vergewissern Sie sich, dass der flüssige Speichel an der „Fill To“-Linie steht; eventuell vorhandene Blasen sollten oberhalb der Linie liegen. So wird sichergestellt, dass die optimale Speichelmenge gesammelt wird. Wenn Sie weniger Speichel sammeln, wird die Qualität nicht beeinträchtigt, aber die DNA-Ausbeute verringert sich entsprechend.
- Die DNA-Ausbeute ist von Spender zu Spender unterschiedlich. Es ist wichtig, Proben von verschiedenen Spendern zu testen, um sich ein genaues Bild von der zu erwartenden Ausbeute zu machen.
- Bei Spendern, die Schwierigkeiten haben, 2 ml auszuspucken, kann der Speichelfluss oft durch Reiben der Wangen direkt hinter den Backenzähnen angeregt werden. Sie können die Speichelproduktion auch anregen, indem Sie eine Prise Zucker auf die Zunge geben. Sie brauchen nur eine winzige Menge, gerade so viel, dass die Person sie schmecken kann. Ein Tropfen Zitronensaft funktioniert ebenfalls.
- Manchmal kann es schwierig sein, bei einer Person zu sammeln, die nicht auf Kommando spucken kann, z. B. bei einem kleinen Kind. Die Verwendung eines Entnahmekits für Personen, die nicht spucken können, wie z. B. Oragene assisted collection (OG-675) oder ORAcollect for pediatrics (OC-175), erleichtert Ihnen und dem Spender die Probenentnahme und stellt sicher, dass Sie genügend DNA sammeln.
Verarbeitungsbasierte Optimierung
- Der 50°C-Inkubationsschritt muss im ursprünglichen Probenröhrchen durchgeführt werden, bevor ein Aliquot zur DNA-Extraktion entnommen wird. Die Inkubation muss nur einmal durchgeführt werden; Sie brauchen diesen Schritt nicht zu wiederholen, wenn Sie DNA aus nachfolgenden Aliquoten extrahieren.
- Wenn keine besonderen Maßnahmen zur Entfernung von RNA ergriffen werden, wird die RNA zusammen mit der DNA aufgereinigt. Wir empfehlen, die DNA mittels Fluoreszenz (z. B. Picogreen) zu quantifizieren, da die UV-Absorption die DNA-Menge überschätzen kann.
- Wenn Ihre nachgeschaltete Anwendung hohe DNA-Konzentrationen erfordert, können Sie die Konzentration erhöhen, indem Sie die Menge des Puffers, der zum Auflösen des DNA-Pellets verwendet wird, von 100 µL auf 50 µL reduzieren. Es ist immer einfacher, die DNA später zu verdünnen, als sie aufkonzentrieren zu müssen.
- Oragen-/Speichelproben sind bei Raumtemperatur über Jahre hinweg stabil. Wenn du sie nicht sofort extrahieren kannst, brauchst du sie nicht zu kühlen oder einzufrieren, sondern kannst sie einfach auf dem Tisch liegen lassen.
- Achte darauf, dass die DNA nach der Extraktion genügend Zeit hat, sich aufzulösen. DNA, die mit der prepIT-L2P-Methode aus Oragene-/Speichelproben extrahiert wurde, hat ein extrem hohes Molekulargewicht und benötigt daher Zeit, um sich vollständig aufzulösen. Wir empfehlen, die Probe nach der Extraktion über Nacht bei Raumtemperatur stehen zu lassen, damit sich die DNA vollständig auflösen kann. Wenn sich die DNA nicht vollständig auflöst, kann die Genauigkeit der Quantifizierung beeinträchtigt werden.
Das sind unsere 10 besten Methoden zur Optimierung von DNA-Proben. Haben Sie der Liste etwas hinzuzufügen? Bitte hinterlassen Sie einen Kommentar und lassen Sie es uns wissen.
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