Salmonellos är en viktig orsak till bakteriell enterisk sjukdom hos både människor och djur. Varje år inträffar uppskattningsvis 1,4 miljoner fall av salmonellos bland människor i USA (15). I cirka 35 000 av dessa fall serotypas Salmonellaisolat av folkhälsolaboratorier och resultaten överförs elektroniskt till Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Denna information används av lokala och statliga hälsovårdsmyndigheter och CDC för att övervaka lokala, regionala och nationella trender i salmonellos hos människor och för att identifiera eventuella utbrott av salmonellos (1, 5). Under de senaste 25 åren har det nationella övervakningssystemet för salmonella gett värdefull information om förekomsten av salmonellos hos människor i Förenta staterna och trender för specifika serotyper. Den nyligen införda algoritmen för upptäckt av salmonellautbrott, ett annat värdefullt verktyg för att upptäcka utbrott (11), gör det möjligt för användarna att upptäcka ökningar av infektioner hos människor på grund av specifika salmonellaserotyper. Salmonellaövervakningen är beroende av att serotypidentifieringen är noggrann och underlättas av en standardiserad nomenklatur. National Salmonella Reference Laboratory vid CDC hjälper folkhälsolaboratorier i USA med serotypidentifiering genom att tillhandahålla procedurmanualer, utbildningsworkshops, uppdateringar och hjälp med identifiering av problemisolat.

Det finns för närvarande 2 463 serotyper (serovarer) av Salmonella (18). De antigena formlerna för Salmonellas serotyper definieras och underhålls av Världshälsoorganisationen (WHO) Collaborating Centre for Reference and Research on Salmonella vid Pasteurinstitutet i Paris, Frankrike (WHO Collaborating Centre), och nya serotyper förtecknas i de årliga uppdateringarna av Kauffmann-White-schemat (18, 19).

Salmonellas nomenklatur är komplex och forskare använder olika system för att hänvisa till och kommunicera om detta släkte. En enhetlig Salmonella-nomenklatur är dock nödvändig för kommunikationen mellan forskare, hälsovårdsmyndigheter och allmänheten. Tyvärr kombinerar den nuvarande användningen ofta flera nomenklatorsystem som inkonsekvent delar in släktet i arter, underarter, undersläkten, grupper, undergrupper och serotyper (serovarer), vilket skapar förvirring. CDC får många förfrågningar om lämplig Salmonella-nomenklatur för rapportering av resultat och för användning i vetenskapliga publikationer.

Nomenklaturen för släktet Salmonella har utvecklats från det ursprungliga konceptet med en serotyp och en art som Kauffmann (12) föreslog på grundval av den serologiska identifieringen av O- (somatiskt) och H- (flagellärt) antigen. Varje serotyp betraktades som en separat art (t.ex. S. paratyphi A, S. newport och S. enteritidis). Om detta koncept användes idag skulle det resultera i 2 463 arter av Salmonella. Andra taxonomiska förslag har baserats på stammarnas kliniska roll, på biokemiska egenskaper som delar in serotyperna i undersläkten och slutligen på genomisk släktskap. Förslagen till nomenklaturändringar inom släktet har sammanfattats tidigare (8, 9, 14).

Den avgörande utvecklingen inom Salmonella-taxonomin inträffade 1973 när Crosa et al. (6) med hjälp av DNA-DNA-hybridisering påvisade att alla serotyper och subgenera I, II och IV av Salmonella och alla serotyper av ”Arizona” var besläktade på artnivå; de hörde alltså hemma i en enda art. Det enda undantaget, som senare har beskrivits, är S. bongori, tidigare känd som underart V, som genom DNA-DNA-hybridisering är en distinkt art (21). Eftersom S. choleraesuis förekom på Approved List of Bacterial Names (23) som typart av Salmonella, hade den prioritet som artnamn. Namnet ”choleraesuis” hänvisar dock till både en art och en serotyp, vilket skapar förvirring. Dessutom är serotypen Choleraesuis inte representativ för majoriteten av serotyperna eftersom den är biokemiskt distinkt och är arabinos- och trehalosnegativ (4, 13).

År 1986 rekommenderade Subcommittee of Enterobacteriaceae of the International Committee on Systematic Bacteriology vid XIV International Congress of Microbiology enhälligt att typarten för Salmonella skulle ändras till S. enterica (17), ett namn som myntades av Kauffmann och Edwards 1952 (13), eftersom ingen serotyp delar detta namn. År 1987 lade Le Minor och Popoff från WHO:s samarbetscentrum formellt fram ett förslag i form av en ”begäran om yttrande” till den rättsliga kommissionen inom International Committee of Systematic Bacteriology (14). Rekommendationen antogs av CDC, av Ewing 1986 i den fjärde upplagan av Edward’s and Ewing’s Identification of Enterobactericeae (8) och av andra laboratorier (16).

Däremot avslogs begäran av Judicial Commission. Även om den rättsliga kommissionen generellt sett var för S. enterica som typart för Salmonella, ansåg dess medlemmar att statusen för Salmonella serotype Typhi, som är orsak till tyfus, inte behandlades på ett adekvat sätt i denna begäran om ett yttrande. De var oroliga för att om S. enterica antogs som typart skulle Salmonella serotype Typhi kallas S. enterica subsp. enterica serotype Typhi och skulle kunna missas eller förbises av läkare på samma sätt som S. choleraesuis subsp. choleraesuis serotype Typhi skulle kunna förbises. Ur detta perspektiv skulle man inte vinna något på att ändra namnet på typarten. Den rättsliga kommissionen beslutade därför att S. choleraesuis skulle behållas som den legitima typarten i väntan på en ändrad begäran om yttrande (24). För att följa detta beslut lämnade Euzéby (7) 1999 in en ändrad begäran, som fortfarande är under behandling, om att anta S. enterica som typart för Salmonella samtidigt som arten ”S. typhi” bibehålls som ett undantag.

1987 föreslog Le Minor och Popoff (14) också att de sju undersläktena av Salmonella skulle benämnas som underarter (subspecies I, II, IIIa, IIIb, IV, V och VI). Undergenus III delades in i IIIa och IIIb genom genomisk släktskap och biokemiska reaktioner. Underart IIIa (S. enterica subsp. arizonae) omfattar de monofasiska ”Arizona”-serotyperna och underart IIIb (S. enterica subsp. diarizonae) omfattar de difasiska serotyperna. Alla ”Arizona”-serotyper hade införlivats i Kauffmann-White-schemat av Rohde 1979 (22).