PMC
Salmoneloza este o cauză majoră de îmbolnăvire bacteriană enterică atât la om, cât și la animale. În fiecare an, se estimează că în Statele Unite ale Americii apar aproximativ 1,4 milioane de cazuri de salmoneloză la om (15). În aproximativ 35 000 dintre aceste cazuri, izolatele de Salmonella sunt serotipate de laboratoarele de sănătate publică, iar rezultatele sunt transmise electronic către Centrele pentru controlul și prevenirea bolilor (CDC). Aceste informații sunt utilizate de departamentele de sănătate locale și de stat și de CDC pentru a monitoriza tendințele locale, regionale și naționale în ceea ce privește salmoneloza umană și pentru a identifica posibilele focare de salmoneloză (1, 5). În ultimii 25 de ani, Sistemul național de supraveghere a salmonellei a furnizat informații valoroase cu privire la incidența salmonelozei umane în Statele Unite și la tendințele privind serotipurile specifice. Algoritmul de detectare a focarelor de Salmonella implementat recent, un alt instrument valoros pentru recunoașterea focarelor (11), permite utilizatorilor să detecteze creșteri ale numărului de infecții umane datorate unor serotipuri specifice de Salmonella. Activitățile de supraveghere a Salmonella depind de acuratețea identificării serotipurilor și sunt facilitate de o nomenclatură standardizată. Laboratorul național de referință pentru Salmonella din cadrul CDC asistă laboratoarele de sănătate publică din Statele Unite în identificarea serotipurilor prin furnizarea de manuale de proceduri, ateliere de formare, actualizări și asistență pentru identificarea izolatelor problematice.
În prezent, există 2 463 de serotipuri (serovari) de Salmonella (18). Formulele antigenice ale serotipurilor de Salmonella sunt definite și menținute de către Centrul de colaborare al Organizației Mondiale a Sănătății (OMS) pentru referință și cercetare privind Salmonella de la Institutul Pasteur, Paris, Franța (Centrul de colaborare al OMS), iar noile serotipuri sunt enumerate în actualizările anuale ale schemei Kauffmann-White (18, 19).
Nomenclatura Salmonella este complexă, iar oamenii de știință folosesc diferite sisteme pentru a se referi la acest gen și a comunica despre el. Cu toate acestea, uniformitatea în nomenclatura Salmonella este necesară pentru comunicarea între oamenii de știință, oficialii din domeniul sănătății și public. Din păcate, utilizarea actuală combină adesea mai multe sisteme de nomenclatură care împart în mod inconsecvent genul în specii, subspecii, subgenuri, grupuri, subgrupuri și serotipuri (serovari), ceea ce provoacă confuzie. CDC primește multe solicitări privind nomenclatura adecvată a Salmonella pentru raportarea rezultatelor și pentru utilizarea în publicațiile științifice.
Nomenclatura pentru genul Salmonella a evoluat de la conceptul inițial de un serotip-o specie propus de Kauffmann (12) pe baza identificării serologice a antigenelor O (somatic) și H (flagelar). Fiecare serotip a fost considerat o specie separată (de exemplu, S. paratyphi A, S. newport și S. enteritidis); acest concept, dacă ar fi folosit astăzi, ar duce la 2 463 de specii de Salmonella. Alte propuneri taxonomice s-au bazat pe rolul clinic al unei tulpini, pe caracteristicile biochimice care împart serotipurile în subgenuri și, în cele din urmă, pe înrudirea genomică. Propunerile de modificare a nomenclaturii genului au fost rezumate anterior (8, 9, 14).
Dezvoltarea definitorie în taxonomia Salmonella a avut loc în 1973, când Crosa et al. (6) au demonstrat prin hibridare ADN-ADN că toate serotipurile și subgenurile I, II și IV de Salmonella și toate serotipurile de „Arizona” erau înrudite la nivel de specie; astfel, ele aparțineau unei singure specii. Singura excepție, descrisă ulterior, este S. bongori, cunoscută anterior ca subspecia V, care, prin hibridizare ADN-ADN, este o specie distinctă (21). Având în vedere că S. choleraesuis a apărut pe Lista aprobată a denumirilor bacteriene (23) ca specie tip de Salmonella, aceasta a avut prioritate ca denumire de specie. Cu toate acestea, denumirea „choleraesuis” se referă atât la o specie, cât și la un serotip, ceea ce provoacă confuzie. În plus, serotipul Choleraesuis nu este reprezentativ pentru majoritatea serotipurilor, deoarece este distinct din punct de vedere biochimic, fiind negativ la arabinoză și trehaloză (4, 13).
În 1986, Subcomitetul pentru Enterobacteriaceae al Comitetului Internațional de Bacteriologie Sistematică din cadrul celui de-al XIV-lea Congres Internațional de Microbiologie a recomandat în unanimitate ca specia tip pentru Salmonella să fie schimbată în S. enterica (17), un nume inventat de Kauffmann și Edwards în 1952 (13), deoarece niciun serotip nu împărtășește acest nume. În 1987, Le Minor și Popoff de la Centrul de colaborare al OMS au făcut o propunere oficială sub forma unei „cereri de aviz” către Comisia juridică a Comitetului internațional de bacteriologie sistematică (14). Recomandarea a fost adoptată de CDC, de Ewing în 1986 în ediția a 4-a a lucrării „Edward’s and Ewing’s Identification of Enterobactericeae” (8), precum și de alte laboratoare (16).
Cu toate acestea, cererea a fost respinsă de către Comisia juridică. Deși Comisia Judiciară a fost în general în favoarea S. enterica ca specie tip de Salmonella, membrii săi au considerat că statutul serotipului Salmonella Typhi, agentul cauzal al febrei tifoide, nu a fost abordat în mod adecvat în această cerere de aviz. Aceștia au fost îngrijorați de faptul că, în cazul în care S. enterica ar fi adoptată ca specie tip, Salmonella serotype Typhi ar fi denumită S. enterica subsp. enterica serotype Typhi și ar putea fi omisă sau trecută cu vederea de către medici în același mod în care S. choleraesuis subsp. choleraesuis serotype Typhi ar putea fi trecută cu vederea. Din acest punct de vedere, nu s-ar câștiga nimic prin schimbarea denumirii speciei tip. Prin urmare, Comisia juridică a hotărât ca S. choleraesuis să fie menținută ca specie tip legitimă în așteptarea unei cereri modificate de aviz (24). Pentru a se conforma acestei hotărâri, în 1999 Euzéby (7) a făcut o cerere modificată, care este în curs de soluționare, pentru a adopta S. enterica ca specie tip de Salmonella, păstrând în același timp specia „S. typhi” ca o excepție.
În 1987, Le Minor și Popoff (14) au propus, de asemenea, ca cele șapte subgenuri de Salmonella să fie denumite subspecii (subspecii I, II, IIIa, IIIb, IV, V și VI). Subgenul III a fost împărțit în IIIa și IIIb în funcție de înrudirea genomică și de reacțiile biochimice. Subspecia IIIa (S. enterica subsp. arizonae) include serotipurile monofazice „Arizona”, iar subspecia IIIb (S. enterica subsp. diarizonae) conține serotipurile difazice. Toate serotipurile „Arizona” au fost încorporate în schema Kauffmann-White de către Rohde în 1979 (22).
.