În 1988, Brennaman și Nuxhall au apărut în fața președintelui Ligii Naționale, Bart Giamatti, la biroul NL, în New York, în ceea ce privește acuzațiile că Brennaman a incitat mulțimea să provoace o întârziere a jocului după o altercație între managerul Reds Pete Rose și arbitrul Dave Pallone. După ce Rose a fost expulzat din meci și Brennaman l-a criticat pe Pallone în timpul transmisiunii radiofonice în direct, fanii au împrăștiat moloz pe teren, ceea ce a dus la o întârziere a jocului. Brennaman a avut de spus următoarele în legătură cu incidentul:

„Încă susțin că am avut dreptate”, a spus Brennaman. „Nu îmi voi cere niciodată scuze pentru asta. Ne-au acuzat de incitare la revoltă. Nu cred că am făcut-o atunci și nu cred că am făcut-o nici acum.”

La 12 iunie 2007, Brennaman și-a cerut scuze în direct în timpul emisiunii Cincinnati Reds Radio Network pentru un comentariu pe care îl făcuse recent, comparând o excursie viitoare cu Marșul Morții din Bataan. Reds, care la acel moment deținea cel mai slab record din Liga Națională, urma să se confrunte cu Oakland Athletics, Seattle Mariners și Philadelphia Phillies în această deplasare.

La 17 aprilie 2008, în timpul părții superioare a reprizei a opta a unui meci dintre Chicago Cubs și Cincinnati Reds pe Wrigley Field din Chicago, Brennaman a făcut comentarii despre fanii Cubs și echipa Cubs. Acest lucru a avut loc după ce jucătorul de atunci al celor de la Red, Adam Dunn, a conectat pentru un home run. Fanii Cubs obișnuiesc să arunce mingea jucătorului advers înapoi pe teren. În acest caz, terenul a fost împânzit de mai multe mingi aruncate de fani pe teren, ceea ce a dus la o întârziere a meciului în timp ce echipa de pe teren a recuperat resturile. Declarațiile lui Brennaman au fost difuzate în timpul transmisiunii meciului de către Reds Radio Network.

„Acesta este genul de lucru, sincer, chiar acum, care te face să vrei să vezi echipa Chicago Cubs pierzând. Dintre toți fanii de baseball, și nu pot să atest în ceea ce-i privește pe Yankees sau Red Sox, pentru că nu-i vedem cu un anumit grad de regularitate decât dacă este vorba de un joc interligă, dar de departe cei mai odioși fani din baseball, din această ligă, sunt cei care urmăresc această echipă de aici. Aruncarea a 15 sau 18 mingi pe teren, nu există absolut nicio scuză pentru asta, iar acest lucru este atât de tipic pentru fanii Chicago Cubs. Este de necrezut.”
„Pur și simplu îi încurajezi împotriva lor. Știi, am spus toată iarna că au vorbit despre faptul că această echipă va câștiga divizia, iar comentariul meu este că nu o vor câștiga, pentru că, la sfârșitul zilei, ei sunt tot Chicago Cubs și vor găsi o modalitate de a da totul peste cap.”

La 18 aprilie 2008, Brennaman a apărut într-un interviu la postul de radio sportiv WMVP-AM 1000 din Chicago, în care și-a întărit poziția față de fanii Cubs, și i-a comparat pe fanii Chicago Cubs cu fanii rivalilor de la St. Louis Cardinals.

„Dacă nu pot înțelege că ceea ce s-a întâmplat miercuri seară a fost complet exagerat, atunci îmi pare rău”, a spus Brennaman. „Am spus cât de greu este să fii suporter al celor de la Cubs. Cred că o mulțime de oameni simt la fel ca mine, dar nu vor să articuleze acest lucru. Nu mi-e frică să spun ceea ce cred.”
” Fanii lui Cardinals sunt, fără îndoială, cei mai buni din baseball. Ei respectă jocul. Nu se duc la meci pentru a face lucruri stupide.”
„Cubs au niște fani de baseball grozavi. Dar cei care se comportă ca niște idioți (îl strică) pentru oameni ca mine.”

La 5 februarie 2010, Brennaman a fost mustrat pentru că a comentat că președintele Universității Marshall trebuie să fie „poponar” pentru softball la banchetul de baseball și strângerea de fonduri al universității. Brennaman a declarat: „Probabil că aș fi putut alege mai bine cuvintele, dar în niciun caz nu reflectă în vreun fel opinia mea despre homosexuali. Este doar un comentariu pe care l-am făcut despre președintele universității.”

.