Amărăciunea compusului ghidează majoritatea aplicațiilor denatoniumului. Benzoatul de denatoniu este utilizat pentru a denatura etanolul astfel încât acesta să nu fie tratat ca o băutură alcoolică în ceea ce privește impozitarea și restricțiile de vânzare. O denumire în special, SD-40B, indică faptul că etanolul a fost denaturat folosind benzoat de denatoniu.

Denatoniul este în mod obișnuit inclus în medicamentele placebo folosite în studiile clinice pentru a imita gustul amar al anumitor medicamente.

Denatoniul descurajează, de asemenea, consumul de alcooli nocivi, cum ar fi metanolul, și de aditivi, cum ar fi etilenglicolul. Denatonium este utilizat în alcoolul de frecat ca ingredient inactiv. De asemenea, este adăugat în multe tipuri de lichide dăunătoare, inclusiv solvenți (cum ar fi dizolvantul de lac de unghii), vopsele, lacuri, articole de toaletă și alte articole de îngrijire personală, lacuri de unghii speciale pentru prevenirea mușcăturii unghiilor și diverse alte produse de uz casnic. Este, de asemenea, adăugat la produse aerosoli mai puțin periculoase (cum ar fi spray-urile de praf de gaz) pentru a descuraja abuzul de inhalare a vaporilor volatili.

În 1995, statul american Oregon a cerut ca benzoatul de denatoniu să fie adăugat la produsele care conțin etilenglicol și metanol cu gust dulce, cum ar fi antigelul și lichidul de spălare a parbrizului, pentru a preveni otrăvirea copiilor și a animalelor. În decembrie 2012, producătorii din SUA au acceptat în mod voluntar să adauge benzoat de denatoniu la antigelurile vândute la nivel național.

Se știe că animalele au sensibilități diferite la efectele denatoniului. Acesta este utilizat în unele repelente pentru animale (în special pentru mamiferele mari, cum ar fi cerbii). A fost folosit pentru a proteja otrăvurile pentru șobolani de consumul uman, deoarece oamenii sunt capabili să detecteze denatoniul la concentrații mult mai mici decât rozătoarele.

Gustul respingător al denatoniului poate fi folosit ca factor de descurajare pe produse care nu sunt concepute pentru consum și/sau sunt dăunătoare la consum. Celebru, cărțile de joc Nintendo Switch sunt acoperite cu benzoat de denatoniu pentru a împiedica copiii mici să le consume.