Specii Achromobacter și Alcaligenes

Desemnările taxonomice pentru speciile Achromobacter și Alcaligenes au fost deosebit de confuze. Achromobacter xylosoxidans a fost redenumit Alcaligenes xylosoxidans subsp. xylosoxydans, dar analiza secvenței ARNr 16S și studiile privind conținutul de guanină-citozină susțin plasarea acestui organism înapoi în genul Achromobacter.88 Alte specii de Alcaligenes, A. ruhlandii, A. piechaudii și A. denitrificans, au fost, de asemenea, transferate la Achromobacter. Organismele considerate anterior grupele Achromobacter A, C și D (și, înainte de aceasta, grupele CDC Vd-1 și Vd-2) sunt acum denumite Ochrobactrum anthropi și sunt considerate separat. Speciile Achromobacter sunt bacili gram-negativi nefermentanți care se găsesc în sol și în apă, inclusiv în piscine, apă de fântână, soluții de dializă și soluții de clorhexidină. Aceștia pot fi recuperați ocazional din tractul respirator și gastrointestinal, în principal la persoanele care au avut contact cu personalul medical. Infecția rezultă atunci când sunt introduși în răni sau colonizează persoanele cu apărarea gazdei compromisă. Printre speciile relevante din punct de vedere clinic se numără speciile asacarolitice A. dentrificans, A. piechaudii și Alcaligenes faecalis (acest organism rămâne în genul Alcaligenes); specia zaharolitică A. xylosoxidans; și grupul Achromobacter F fără nume. Deși uneori este considerat un contaminant, grupul Achromobacter B (în prezent clasificat împreună cu grupul Achromobacter E ca Pannonibacter phragmitetus) a fost recuperat din sângele pacienților cu sepsis clinic și endocardită.89

A. xylosoxidans este cel mai important din punct de vedere clinic dintre aceste organisme. Probabil că face parte din microbiota endogenă a urechii și a tractului gastrointestinal și este un contaminant comun al fluidelor.90 Organismul a fost implicat în focare de infecții nosocomiale asociate cu soluții contaminate (de exemplu, lichide intravenoase, lichide de hemodializă, lichide de irigare, apă de gură), traductoare de presiune, incubatoare și umidificatoare, precum și săpunuri și dezinfectanți contaminați.91 Contaminarea apei de fântână a fost sursa de infecție într-un caz de bacteriemie.92 Boala clinică cauzată de A. xylosoxidans a implicat izolate din sânge, lichide peritoneale și pleurale, urină, secreții respiratorii și exsudate de rană. Bacteriemia, adesea legată de cateterele intravasculare, este cea mai frecvent raportată infecție și este frecvent polimicrobiană la pacienții cu tumori maligne subiacente.93,94 Au fost raportate sepsisul tractului biliar, meningita (uneori cu predominanță limfocitară în lichidul cefalorahidian), pneumonia (nosocomială și dobândită în comunitate), peritonita (inclusiv peritonita bacteriană spontană și peritonita la pacienții aflați în dializă peritoneală ambulatorie continuă), infecția tractului urinar, conjunctivita, osteomielita, infecția protetică a genunchiului, infecția plasei, pancreatita necrozantă infectată și endocardita valvei protetice.90,91-99 Pacienții au adesea o stare de imunodepresie, cum ar fi cancerul sau infecția cu HIV, dar acest lucru nu este întotdeauna cazul, în special în focarele nosocomiale.94,98 A. xylosoxidans, precum și alte specii de Achromobacter au fost recuperate cu o frecvență din ce în ce mai mare din secrețiile respiratorii ale persoanelor cu fibroză chistică.99 Colonizarea a fost asociată cu o exacerbare a simptomelor respiratorii, posibil ca urmare a exacerbării răspunsului inflamator cauzat de lipopolizaharide (LPS) și de un factor citotoxic produs de Achromobacter.99,100 Mai multe studii caz-control nu au arătat o deteriorare mai rapidă a stării clinice sau a funcției pulmonare în rândul pacienților cu fibroză chistică colonizați cronic cu specii de Achromobacter sau Alcaligenes, cu excepția unui subgrup de pacienți cu o creștere rapidă a anticorpilor precipitanți specifici pentru A. xylosoxidans.101 Recuperarea în cazul infecției neonatale poate rezulta din transferul perinatal de la mamă.102

A. denitrificans a fost recuperat ca un singur agent patogen din sânge, lichid cefalorahidian și alte lichide corporale în mod normal sterile, precum și dintr-un abces renal și în culturi mixte din locuri care conțin de obicei microbiota normală.103 Puține publicații recente au abordat rolul patogen al acestor organisme. S-a crezut că A. piechaudii a provocat otită cronică la un pacient diabetic104 și a fost, de asemenea, recuperat din sânge la un pacient cu o afecțiune hematologică malignă și un cateter Hickman infectat, care a avut bacteriemie recurentă.105

Alcaligenes faecalis poate fi recuperat într-o varietate de medii clinice. Cele mai multe izolări de A. faecalis din sânge sau secreții respiratorii sunt legate de contaminarea echipamentelor sau fluidelor spitalicești cu acest organism, cu colonizarea sau infecția umană rezultată. Urina este celălalt loc comun de recuperare, deși rareori provoacă infecții simptomatice ale tractului urinar. De asemenea, a fost recuperat din ulcerele corneene, secrețiile urechilor, drenajul rănilor, lichidul peritoneal și fecalele.106-108 Rareori este recuperat în cultură pură din oricare dintre aceste locuri.

Filogenetic și biochimic, Alcaligenes și Achromobacter sunt strâns înrudite cu genul Bordetella. Speciile Achromobacter se dezvoltă bine pe medii microbiologice standard, inclusiv pe agar MacConkey. Acestea produc colonii plate, întinse și aspre și au flageli peritricioși, caracteristici care ajută la distingerea lor de pseudomonade. Majoritatea tulpinilor se dezvoltă, de asemenea, pe agar selectiv Burkholderia cepacia. Organismele sunt oxidaze pozitive și catalaze pozitive și oxidează glucoza pentru a produce acid, dar sunt urează negative și indol negative. După cum indică și numele speciei, A. xylosoxidans oxidează ușor xiloza, ceea ce o deosebește de alte specii din acest gen. Distincția organismelor și confirmarea identificării este îngreunată de lipsa de reactivitate a acestora la multe teste biochimice sau de asimilare. Spectrometria de masă MALDI-TOF oferă o identificare precisă a acestui grup de organisme și va juca un rol din ce în ce mai important pe măsură ce tehnologia va fi utilizată pe scară mai largă.

Un izolat de A. xylosoxidans poate fi ușor confundat cu o tulpină de Pseudomonas care nu este P. aeruginosa sau cu o tulpină din complexul B. cepacia, dar tiparul neobișnuit de sensibilitate sugerează identitatea corectă. A. faecalis produce un miros dulce distinctiv care seamănă cu cel al merelor verzi. Piperacilina-tazobactam și carbapenemele sunt active in vitro și ar fi terapia inițială adecvată pentru infecțiile grave cu A. xylosoxidans, în timp ce trimetoprim-sulfametoxazol poate fi utilizat pentru infecțiile tractului urinar și alte infecții care nu necesită terapie parenterală. Ceftazidima are, de asemenea, activitate, deși tulpinile sunt în general rezistente la alte cefalosporine, la penicilinele cu spectru îngust, la aztreonam și la aminoglicozide. Susceptibilitatea la fluorochinolone este variabilă. Concentrațiile ridicate de colistină inhibă majoritatea tulpinilor. La tulpinile izolate de la pacienții cu fibroză chistică au fost observate rate ridicate de rezistență la ciprofloxacină și la aminoglicozide. Mecanismele de rezistență includ o oxacilinază constitutivă și β-lactamaze dobândite, precum și pompe de eflux multidrog.109 Prezența genelor de metalo-β-lactamază de tip IMP, VIM sau TMB purtate pe integroni transferabili de clasa 1 poate produce rezistență la carbapenem și deține potențialul de transfer orizontal.110,111

Sușetele de A. faecalis sunt de obicei sensibile la trimetoprim-sulfametoxazol, ureidopeniciline, carbapeneme și, spre deosebire de speciile de Achromobacter, la majoritatea cefalosporinelor.107 Rezultatele variază în cazul aztreonamului, fluorochinolonelor și aminoglicozidelor, rezistența la gentamicină fiind frecventă.107 Producția de β-lactamază cu spectru extins a fost, de asemenea, descrisă la A. faecalis.

.