Nieprawidłowości w obrębie stawu skroniowo-żuchwowego (TMJ) nie mogą być wiarygodnie ocenione w badaniu klinicznym. Obrazowanie metodą rezonansu magnetycznego (MRI) może uwidocznić nieprawidłowości w stawie, które nie są widoczne w żadnej innej metodzie obrazowania i dlatego jest najlepszą metodą oceny diagnostycznej stanu stawu skroniowo-żuchwowego. U pacjentów z chorobą zwyrodnieniową stawów skroniowo-żuchwowych (TMD) kierowanych na diagnostykę obrazową dominującym objawem w stawie skroniowo-żuchwowym jest wewnętrzne rozchwianie związane z przemieszczeniem krążka międzykręgowego. Stwierdzenie to jest znacznie częstsze niż u bezobjawowych ochotników i występuje nawet u 80% pacjentów kolejno kierowanych na badania obrazowe stawu skroniowo-żuchwowego. Co więcej, niektóre rodzaje przemieszczenia krążka wydają się występować prawie wyłącznie u pacjentów z TMD, a mianowicie całkowite przemieszczenie krążka, które nie zmniejsza się przy otwieraniu ust. Z przemieszczeniem krążka mogą dodatkowo wiązać się inne nieprawidłowości wewnątrzstawowe, przede wszystkim wysięk w stawie (czyli więcej płynu niż u bezobjawowego ochotnika) oraz nieprawidłowości szpiku kłykci żuchwy (których nie obserwuje się u ochotników). Schorzenia te wydają się być ściśle powiązane. Blisko 15% pacjentów z TMD kierowanych kolejno na MRI stawu skroniowego będzie miało wysięk w stawie, z czego około 30% wykaże nieprawidłowości szpiku kostnego. W chirurgicznie wyselekcjonowanym materiale stawów z udokumentowanymi histologicznie nieprawidłowościami szpiku kostnego prawie 40% wykazywało wysięk stawowy. Przemieszczenie krążka międzykręgowego jest najczęściej obustronne, natomiast wysięk stawowy wydaje się być jednostronny lub z mniejszą ilością płynu w stawie kontralateralnym. Nieprawidłowy szpik kostny jest również w większości przypadków jednostronny. Wielu pacjentów ma jednostronny ból lub większy ból po jednej stronie. W analizie regresji różnica stron zgłaszanego przez pacjenta bólu stawu skroniowo-żuchwowego była dodatnio zależna od wysięku w stawie skroniowo-żuchwowym i nieprawidłowości szpiku kłykciowego, ale ujemnie zależna od nieprawidłowości kości korowej. Spośród stawów z wysiękiem tylko jedna czwarta wykazywała chorobę zwyrodnieniową stawów. Wydaje się więc, że istnieje podgrupa pacjentów z TMD, u których patologia wewnątrzstawowa jest bardziej nasilona niż samo przemieszczenie krążka międzykręgowego, ale w większości przypadków nie występuje choroba zwyrodnieniowa stawów. Należy jednak podkreślić, że pacjenci z wysiękiem w stawie skroniowo-żuchwowym i/lub nieprawidłowym szpikiem kostnym w kłykciu żuchwy wydają się stanowić jedynie niewielką część (mniej niż jedną czwartą) kolejnych pacjentów z ZZSK kierowanych do diagnostyki obrazowej stawów skroniowo-żuchwowych. U większości pacjentów stwierdza się zmiany wewnętrzne związane z przemieszczeniem krążka międzykręgowego, ale bez towarzyszących nieprawidłowości stawowych. U pacjentów z reumatoidalnym zapaleniem stawów i innymi chorobami zwyrodnieniowymi stawów zajęcie stawów skroniowo-żuchwowych może naśladować częściej występujące TMD. Za pomocą MRI można w większości przypadków odróżnić tych pacjentów od tych bez rozrostu błony maziowej.