Rethinking Clinical Trials

mei 5, 2021
admin

Using the RxNorm System

Contributor
  • Michelle Smerek (Duke Clinical Research Institute, Durham, NC)
Contributing Editor
  • Jonathan McCall, MS

Tools for Research
De RxNorm van de National Library of Medicine is een gratis, openbaar toegankelijke bron die “genormaliseerde” namen biedt voor merknamen en generieke geneesmiddelen en voor elke entiteit een unieke identificatiecode geeft waarmee een bepaald geneesmiddel duidelijk kan worden geïdentificeerd. In dit onderzoeksinstrument bieden we een overzicht van RxNorm en verkennen we de toepassing van een aantal van de bijbehorende tools in de onderzoekssetting.

In deze tool:

  • Background
  • RxNav Browser
  • Concept Unique Identifier (RxCUI)
  • RxNorm Tool Users
  • RxNorm-Associated Tools
  • RxMix: Voorbeeld Query
  • Aanvullende informatie

Achtergrond

RxNorm is een nationaal initiatief dat is opgezet door de National Library of Medicine (NLM). Het doel ervan is te voorzien in één enkel systeem voor het ondubbelzinnig identificeren van merknaam- en generieke geneesmiddelen. RxNorm is ontstaan als antwoord op de wildgroei aan medicijnidentificatie- en classificatiesystemen onder ziekenhuizen, klinieken, apotheken, gezondheidssystemen, fabrikanten en betalers – die allemaal een reeks verschillende namen voor hetzelfde medicijn kunnen gebruiken, waardoor het moeilijk is om zinvolle informatie te extraheren en te communiceren tussen verschillende systemen en databases.

RxNorm, dat gratis is en volledig open voor publieke toegang, biedt een “genormaliseerde” naam voor elk merknaam- of generiek medicijn, plus een unieke identificatiecode die het mogelijk maakt om een bepaald medicijn duidelijk te identificeren. RxNorm bevat alleen informatie over geneesmiddelen; voedingssupplementen, medische hulpmiddelen, radioactieve stoffen of voedingsmiddelen zijn er niet in opgenomen. RxNorm maakt deel uit van het Unified Medical Language System (UMLS) van de National Library of Medicine.

Aantekening: De interne gegevens van tabel “12” zijn beschadigd!

RxNorm is vooral belangrijk omdat het de uitwisseling van informatie over medicijnen in elektronische medische dossiers (EHR’s) mogelijk maakt. In feite heeft het Office of the National Coordinator het gebruik van RxNorm aangewezen als een criterium voor EHR-certificering van interoperabiliteit en Stage 2 Meaningful Use.

De RxNav-browser

Een methode voor interactie met de inhoud binnen RxNorm is de RxNav-browser, die kan worden gebruikt om te zoeken naar verschillende geneesmiddelenkenmerken in meerdere classificatiesystemen.

Concept Unique Identifier (RxCUI)

Een belangrijk onderdeel van RxNorm is de Concept Unique Identifier (RxCUI). De RxCUI is een unieke, ondubbelzinnige identificator die in RxNorm wordt toegewezen aan een individuele geneesmiddelenentiteit en die wordt gebruikt om te verwijzen naar alles wat met dat geneesmiddel in verband wordt gebracht.

Screenopname met een voorbeeld van een eenvoudig .txt-bestand met een lijst van RxCUI's die kunnen worden geüpload.
Een voorbeeld van een eenvoudig .txt-bestand met een lijst van RxCUI’s om te uploaden.

De RxCUI wordt gebruikt om een entiteit in RxNorm te koppelen aan elke andere entiteit waaraan deze is gerelateerd, zoals naam aan ingrediënt aan klasse.

Dit diagram geeft de relaties weer tussen enkele van de meest fundamentele RxNorm-concepten: naam van het geneesmiddel, ingrediënt van het geneesmiddel en klasse van het geneesmiddel. Geneesmiddelennamen zijn gekoppeld aan de ingrediënten die ze bevatten, en het zijn deze ingrediënten die worden gegroepeerd in klassen.
Dit diagram geeft de relaties weer tussen enkele fundamentele RxNorm-concepten: geneesmiddelnaam, geneesmiddelingrediënt en geneesmiddelklasse. Geneesmiddelnamen zijn gekoppeld aan de bestanddelen van het geneesmiddel die ze bevatten, en deze bestanddelen worden gegroepeerd in klassen.

RxNorm-gebruikers

RxNorm is ontworpen voor gebruik door onderzoekers, statistici, gegevensbeheerders en ander personeel voor klinisch onderzoek.

RxNorm-gerelateerde hulpmiddelen

RxClass

RxClass is een webapplicatie waarmee gebruikers hiërarchieën van geneesmiddelklassen kunnen verkennen en er doorheen kunnen navigeren om RxNorm-geneesmiddelen te vinden die bij elke klasse horen. RxClass koppelt geneesmiddelklassen zoals beschreven door een aantal verschillende bronnen (waaronder ATC, MeSH, NDF-RT en FDA/SPL) aan hun RxNorm geneesmiddelelementen, waaronder ingrediënten, precieze ingrediënten en meervoudige ingrediënten.
De tool stelt gebruikers ook in staat om te zoeken op klassenaam of identifier om de relevante RxNorm geneesmiddelleden te vinden of om te zoeken op RxNorm geneesmiddelnaam of identifier om de klassen te vinden waartoe het RxNorm geneesmiddel behoort.

Schermopname met een voorbeeld van de weergave van de resultaten van de RxClass-tool voor "bètablokkeermiddelen."
Schermopname met een voorbeeld van de weergave van de resultaten van de RxClass-tool voor “bètablokkeermiddelen.”

RxMix

RxMix is een webtoepassing waarmee gebruikers programma’s kunnen maken voor het verkennen van RxNorm-functies die beschikbaar zijn via de RxNorm Application Programming Interface (API), met behulp van een grafische gebruikersinterface (GUI) waarmee het niet nodig is om computerprogrammeercode te schrijven. RxMix biedt gebruikers de mogelijkheid om programma’s direct of in batch te testen en uit te voeren, waarbij de resulterende bestanden automatisch naar de gebruiker worden gemaild.

Screenopname van RxMix-gebruikersinterface. Gekoppeld aan de website van RxMix.
RxMix-gebruikersinterface. Beschikbaar op: https://mor.nlm.nih.gov/RxMix/.

RxMix: Example Query

Het onderstaande schema toont een voorbeeld van een datamanager-query die een gebruiker met behulp van de RxMix-tool zou kunnen uitvoeren. In deze situatie heeft de gebruiker een lijst met RxCUI’s en wil hij weten tot welke klasse of klassen deze RxCUI’s behoren:

Schema van een voorbeeldquery voor datamanager in RxMix
Voorbeeldquery in RxMix

In de eerste stap (1) opent de gebruiker RxMix en selecteert hij de functie “getClassByRxNormDrugID” uit het menu dat beschikbaar is onder “Build.”

Screen capture toont de selectie van de functie "getClassByRxNormDrugID" uit het menu "Build".
RxMix query – stap 1.

Naar aanleiding hiervan selecteert de gebruiker de te gebruiken bron van geneesmiddelklasse-relaties (2). Afhankelijk van de geselecteerde geneesmiddelklassebron kan de gebruiker vervolgens het TYPE geneesmiddelklasse-relatie moeten kiezen waarvoor een query moet worden uitgevoerd (3). De bron NDFRT (hieronder afgebeeld) biedt verschillende relatietypen, waaronder: “heeft werkingsmechanisme”, “kan diagnose stellen”, “kan behandelen”, “kan voorkomen” en “heeft fysiologisch effect”.

Screen capture met stap 2 - selecteren van bron van geneesmiddelklasse relaties
RxMix query – stappen 2 en 3.

De gebruiker voegt vervolgens de geselecteerde parameters toe aan de workflow en selecteert de batchmodus (4); voert het e-mailadres in voor de levering van het bestand (5); voert de RxCUI’s in of uploadt deze (6); en selecteert de gewenste velden die in het uitvoerbestand moeten worden opgenomen en het gewenste bestandsformaat (tabel, xml, json, tekst) (7).

RxMix-query - stap 4
RxMix-query – stappen 4-7

De resulterende query-uitvoer wordt vervolgens weergegeven:

Screen-opname met uitvoer in tabelindeling voor RxMix-query
Voorbeeld query-uitvoer voor RxMix (tabeluitvoer).

Aanvullende informatie

Aanvullende richtlijnen voor het gebruik van RxNav, waaronder video-tutorials voor RxMix, zijn beschikbaar op de website van RxNav.

Deze inhoud is oorspronkelijk ontwikkeld als onderdeel van een speciale onderwerpbeoordeling voor het National Patient-Centered Clinical Research Network( PCORnet), en gepresenteerd tijdens de PCORnet Common Data Model (CDM) v3.0 Stakeholder meetings op 28 en 29 april 2015.

Deze onderzoekstool is oorspronkelijk gepubliceerd op 26 oktober 2015

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.