Georgina arriveert op Grand Central Station met een vermomming van een blonde pruik en een bril. Jenny neemt een foto van Dan en Serena in hetzelfde bed, wat problemen veroorzaakt voor Serena en Nate. Blair probeert Chuck en het Empire State Building te vermijden maar beseft al snel dat het onmogelijk is om weg te blijven en dat ze bij elkaar horen. Maar op het moment dat ze besluit te gaan, breken Dorota’s vliezen en wordt ze met spoed naar het ziekenhuis gebracht. In het ziekenhuis zegt Dorota tegen Blair dat ze haar hart moet volgen en geeft haar haar zegen. Kort daarna verwelkomen Dorota en Vanya hun dochtertje, Anastasia, en kiezen Eleanor en Cyrus als de peetouders van de baby. Buiten het ziekenhuis komt Blair te laat bij het Empire State Building en ontdekt dat Chuck is vertrokken.

Tussenin gaat Jenny naar Chuck’s hotel om met Nate rond te hangen, maar in plaats daarvan vindt ze een verdrietige Chuck die zijn verdriet verdrinkt door dronken te worden. Jenny gaat met hem mee omdat ze ook depressief is en de bodem heeft bereikt. Uiteindelijk hebben de twee seks en Jenny verliest eindelijk haar maagdelijkheid. Vlak nadat ze seks hebben gehad komt Blair binnen en vertelt Chuck dat ze van hem houdt en Jenny sluipt ongemerkt door Blair de slaapkamer uit. Terug in het ziekenhuis bespreken Dan en Serena de gebeurtenissen van de avond ervoor en hun “betekenisloze kus” maar Nate hoort hen, en ondanks alles besluit hij Vanessa de foto te sturen, wat problemen veroorzaakt voor Dan en Vanessa. Later wordt Nate gezien met Serena in het restaurant in Dorota’s ziekenhuis, en hij vergeeft haar, maar ze vertelt hem dat ze uit elkaar moeten gaan, of een pauze nemen voor een tijdje, zodat ze tijd heeft om aan haar karakter te werken. Maar Nate is boos en gekwetst en vertelt haar dat hij klaar is met wachten op haar. Jenny bereikt het ziekenhuis en heeft een emotionele inzinking en wordt getroost door Eric die haar vraagt wat het probleem is en ze bekent dat ze met Chuck naar bed is geweest. Ondertussen zijn Chuck en Blair gelukkiger dan ooit en net als Chuck op het punt staat haar ten huwelijk te vragen komt Dan en slaat hem. Dan confronteert hem ermee en Blair realiseert zich wat er tussen Chuck en Jenny is gebeurd. Ze verbant Jenny uit New York en vertelt Chuck dat hij nooit meer met haar moet praten en dat “deze hele nacht niet gebeurd is”.

Een week later verontschuldigt Nate zich bij Dan voor het sturen van de foto naar Vanessa en vertelt hem dat hij en Serena uit elkaar zijn en een triootje gaan doen omdat hij Chuck’s Black Book heeft meegenomen. Dan belt Serena onmiddellijk daarna, om te ontdekken dat zij en Blair op weg zijn naar Parijs. Net als hij tickets voor Air France bekijkt, komt Georgina binnen en vertelt hem dat ze zwanger is van zijn zoon. Ondertussen wordt Jenny uitgezwaaid door Rufus, Lily en Eric als ze vertrekt naar het huis van haar moeder in Hudson.

Het seizoen eindigt uiteindelijk met Chuck in Praag die erg dronken uit een bar loopt. Hij wordt gegrepen door overvallers die hem beroven. Hij zegt dat ze hem naar een bank moeten brengen en dat hij ze geld zal geven, maar in plaats daarvan halen ze een doosje uit zijn jas met een verlovingsring erin (waaruit blijkt dat Chuck Blair een aanzoek zou doen). Hij zegt hen dat hij hen zal geven wat ze willen, maar geef hem het doosje, en als hij naar het doosje grijpt, schiet één van de overvallers hem neer. Het laatste shot is van Chuck liggend op de grond.