1964年、オハイオ州ボウリンググリーンのWBGU-TVのトランスレーターであるW39AAがチャンネル39で放送にサインインした。 1974年以前、フォートウェインはインディアナ州で唯一、ケーブルでもPBSの番組にアクセスできない地域だった（PBSはPBS加盟局のない市場の商業局に番組を提供するのが標準的なやり方だったが、フォートウェインでの同ネットワークの番組放送に関する証拠はまだない）。W39AAは市場全体をカバーするほど強力ではないため、放送範囲はおおむねフォートウェイン近辺に限定されることになった。 フォートウェインではチャンネル39がフルパワーの教育チャンネルとして割り当てられていたため、この低出力のリピータ局は単なるプレースホルダに過ぎなかった。 1980年代初頭には、インディアナポリスのPBS局WFYIのトランスレータとなった。

1985年3月12日、地元の公共テレビグループがFCCからチャンネル39のスロットを与えられ、WFWAのコールレターで局のライセンスを取得。WFWAは1986年12月5日に放送開始し、史上初めて北東インディアナに独自のPBS局をもたらすことになった。

2003年、WFWAはフォートウェーン市場で初めてデジタル信号を放送するテレビ局となり、当初は通常の番組とは別のサブチャンネルで全米PBS HDTV放送を流していた。その後、資金難から全米HD放送は終了し、数年間すべての番組は標準画質のままとなった。 WFWAのメインチャンネル39.1は、2010年夏のいずれかの時点でフルタイムのハイビジョン放送を行うと発表されました。 ビデオ圧縮の進歩により、同局は他の3つのSDサブチャンネルの映像品質を犠牲にすることなく、メインチャンネルをHDにアップグレードすることができた。

2013年5月、同局は今後3年間にわたり、信号増強、遠隔制作機器の購入、局のマスターコントロールの改善などインフラをアップグレードする資金調達活動を行うと発表した。