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サルモネラ症は、ヒトおよび動物における細菌性腸疾患の主要な原因である。 毎年、米国では140万件のサルモネラ症がヒトの間で発生していると推定されている(15)。 このうち約 35,000 例では、公衆衛生研究所でサルモネラ菌の血清型判定が行われ、その結果が疾病管理予防センター (CDC) に電子的に送信される。 この情報は、地方および州の保健所と CDC によって、ヒトのサルモネラ症に関する地方、地域、国の傾向を監視し、サルモネラ症の発生の可能性を特定するために使用されます (1, 5)。 過去 25 年間にわたり、全米サルモネラ監視システムは、米国におけるヒトサルモネラ症の発生率および特定の血清型の傾向について貴重な情報を提供してきた。 最近導入された Salmonella Outbreak Detection Algorithm は、アウトブレイクを認識するためのもう一つの貴重なツールで (11)、ユーザーは特定のサルモネラ血清型によるヒト感染症の増加を検出することができる。 サルモネラ菌のサーベイランス活動は、血清型の正確な同定に依存しており、標準化された命名法によって促進される。 CDCのNational Salmonella Reference Laboratoryは、手順書、トレーニングワークショップ、アップデート、および問題分離株の同定に関する支援を通じて、米国内の公衆衛生検査室を血清型同定で支援している
Salmonellaの血清型(serovars)は現在2,463ある(18)。 サルモネラの血清型の抗原型は、フランス・パリのパスツール研究所にある世界保健機関(WHO)サルモネラ研究協力センター(WHO Collaborating Centre)によって定義・管理されており、新しい血清型はカウフマン-ホワイトスキームの年次更新に掲載されている(18, 19)。 しかし、サルモネラ菌の命名法の統一は、科学者、保健当局、および一般市民の間のコミュニケーションに必要である。 残念ながら、現在の使用方法では、属を種、亜種、亜属、グループ、サブグループ、血清型(セロバー)に一貫性のない複数の命名体系を組み合わせていることが多く、これが混乱の原因となっています。
サルモネラ属の命名法は、O(体細胞)抗原とH(鞭毛)抗原の血清学的同定に基づいてKauffmann(12)が提案した最初の1血清型1種の概念から発展してきたものである。 各血清型は別種とされた(例えば、S. paratyphi A, S. newport, S. enteritidis)。この概念を今日用いると、サルモネラの種は2,463種となる。 他の分類学上の提案は、株の臨床的役割、血清型を亜属に分ける生化学的特徴、そして最終的にはゲノム上の近縁性に基づいている。 1973年、Crosaら(6)はDNA-DNAハイブリダイゼーションにより、Salmonellaのすべての血清型およびI、II、IV亜属と、Arizonaのすべての血清型が種レベルで関連しており、単一種に属することを証明し、Salmonella分類学に決定的な展開をもたらすこととなった。 ただし、S. bongoriだけは例外で、以前は亜種Vと呼ばれていたが、DNA-DNAハイブリダイゼーションにより、別種となった(21)。 S. choleraesuis はサルモネラのタイプ種として Approved List of Bacterial Names (23) に掲載されているため、種名として優先された。 しかし、”choleraesuis “という名称は、種と血清型の両方を指すため、混乱を招いている。 また、血清型Choleraesuisはアラビノースとトレハロース陰性で生化学的に区別されるため、大多数の血清型を代表するものではない(4, 13)。
1986年、第14回国際微生物学会議において、国際系統別細菌学委員会の腸内細菌科小委員会は、Salmonellaの型式を、1952年にKauffmann and Edwardsによって作られたS. enterica (17) という名前(この名前を持つ血清型はないため)に変更することを満場一致で勧告した (13). 1987年、WHO協力センターのLe MinorとPopoffは、国際系統別細菌学委員会の司法委員会に「意見募集」として正式に提案した(14)。 この勧告はCDCやEwingが1986年に第4版のEdward’s and Ewing’s Identification of Enterobactericeae(8)で採用し、他の研究室でも採用された(16)
それにもかかわらず、この要求は司法委員会によって否定された。 司法委員会は一般的にS. Entericaをサルモネラのタイプ種として支持したが、そのメンバーは腸チフスの原因菌であるSalmonella serotype Typhiの状態がこの意見要請で適切に扱われていないと考えていた。 S. Entericaを型別種として採用した場合、Salmonella serotype TyphiはS. Enterica subsp. このような観点からは、型式名称を変更しても何も得るものはない。 そこで司法委員会は、S. choleraesuisを正当な型式種として、意見書の修正請求を保留することを決定した(24)。 この裁定に従うため、1999年にEuzéby (7)は、S. entericaをSalmonellaの型式種として採用し、例外的に「S. typhi」という種を保持するという修正要求を行い、保留されている。
1987年にLe Minor and Popoff (14) もSalmonellaの7亜属を亜種(亜種 I, II, IIIa, IIIb, IV, V, and VI)と呼ぶことを提案した。 III亜属はゲノムの関連性と生化学反応によってIIIaとIIIbに分けられた。 IIIa亜属(S. enterica subsp. arizonae)には一相性のArizona血清型が、IIIb亜属(S. enterica subsp. diarizonae)には二相性の血清型が含まれる。 Arizona “血清型は1979年にRohdeによってKauffmann-Whiteスキームに組み込まれた(22).
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