Exiguobacterium sp. 12/1が生産する有機酸のアルカリ性廃水中和への有用性

10月 5, 2021
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Abstract

この研究の目的は、Exiguobacterium sp. 12/1 (DSM 21148) 株が生産する有機酸が飲料産業から発生するアルカリ性廃水中和への役割を調査することであった。 本菌はpH12.0の培地で増殖し、pH12.0からpH7.5までのアルカリ性工業廃水を中和することが知られている。 FT-IR分光法を用いて培地中に存在する官能基の種類を調べたところ、カルボニル基とヒドロキシル基に相当するピークが存在し、カルボン酸または関連代謝産物の放出が示唆されました。 RP-HPLC を用いて特定のカルボキシル基を同定したところ、培養上清中にギ酸に最も近い保持時間の単一ピークが存在することが判明した。 異なる炭素源で生成された酸の濃度を時間の関数として調べた。 酸は最終的に同じ濃度で存在したが、酸の生成速度はショ糖を添加した培地の場合が最も高く、次いでフルクトース、グルコースであった。 本菌の代謝産物に関する知見は,飲料業界からのアルカリ性廃水の大規模なバイオレメディエーションに対する本菌の可能性を実現するための第一歩と考えられる

1. はじめに

アルカリ性微生物(pH9以上を生育至適温度とする微生物)は、工業的応用において大きなインパクトを与えている。 生物洗浄剤には、アルカリ性微生物から生産されたアルカリ性セルラーゼやアルカリ性プロテアーゼなどの酵素が含まれています。 例えば、アルカリ性シクロマルトデキストリン・グルカノトランスフェラーゼによるシクロデキストリン、アルカリ性活性マルトヘキサオース生成α-アミラーゼは、食品、化学、医薬産業で利用されています。 アルカリ処理された木材パルプは、アルカリ性細菌が生産するキシラナーゼによって生物学的に漂白されることが報告されている。 藤原らは、アルカリプロテアーゼでX線フィルムのゼラチン質を分解し、銀を回収することを報告している。 このように、アルカリ性細菌は、細胞外酵素やアルカリ性・アルカリ安定性などの生化学的性質から、多くの関心を集めている。 また、その生体エネルギー学的な研究も進んでいるが、細胞内酵素や代謝物などの生理的な研究についてはほとんど知られていない。 中間代謝過程の特徴は、菌の特徴、酵素組成、細胞の代謝段階、代謝工学の可能性などに役立つため、重要である。 アルカリ性細菌が炭水化物を含む培地のpHを強く変動させる能力を利用して、Exiguobacterium sp.12/1株を用いて飲料産業から排出される高アルカリ性廃水の中和を行ったことがある。 Exiguobacterium属はBacillales目に属し、Bacillus属のメンバーも含んでいる。 Exiguobacterium sp.12/1は、pH10で最適に増殖する通性アルカリ性細菌で、アルカリ性廃水をpH12.0からpH7.5まで中和する能力がある。 この細菌は、高アルカリ性の外部培地を中和するために、何らかの酸性の代謝産物を放出すると推測される。 しかし、細胞外培地に放出される代謝産物の種類を明らかにすることは重要である。 ここでは、アルカリ中和のメカニズムとして考えられる有機酸の産生について研究しています。

清涼飲料水産業排水の主な炭素源はスクロース(グルコースとフルクトースを含む二糖類)であり、生物化学的酸素要求量(BOD)の主な要因にもなっている。 清涼飲料水産業廃水の平均BODは600~4500 mg/Lで、これは673~5052 ppmのスクロースに相当する。 単糖で生育する多数の細菌の代謝産物に関する文献調査によると、細菌はこれらの単糖を利用して有機酸を生成している可能性が示唆されている。 このことは、他のアルカリ性Bacillus属の細胞外代謝産物の分析によってさらに裏付けられる 。 これらの研究では、スクロースを炭素源として生産される主な有機酸は酢酸であることが判明した。 蟻酸は嫌気性条件下における好中性細菌の一般的な代謝産物であるが、B. circulans var. alkalophilusは好気性培養においても最大2g/Lの蟻酸を生産している。 その他の揮発性酸であるプロピオン酸、酪酸、イソ酪酸、イソ吉草酸はBacillus alcalophilus ssp. halodurans、B. alcalophilus、Bacillus sp.17-1 株に典型的に見られる。 イソ酪酸とイソ吉草酸は、いくつかの好中球性細菌の培地中に報告されている。 しかし、これらの酸は、プロピオン酸や酪酸と同様に、Clostridium sp.の研究に基づいて、アミノ酸に由来するものと考えられている。 乳酸やピルビン酸は好中性細菌がごく普通に生産するが、バチルスによるコハク酸の生産は稀である。 エタノールは多くの好中性菌のグルコース培養による典型的な生成物であるが、アルカリ性菌では検出されていない。 このように、アルカリ性の増殖条件は中性代謝産物の生産に影響を与える可能性がある。 本研究では、逆相高速液体クロマトグラフィーを用いて、異なる種類の炭素源を含む高pH培地の中和中にExiguobacterium 12/1株が生産する酸の種類と濃度を検討した。 Strain and Culture Conditions

Exiguobacterium sp.12/1の培養液はDSMZから入手し(DSM 21148)、グリセロールストックとして保存していた。 ペプトン、1;酵母エキス、0.5;グルコース、1;K2HPO4、0.1;Na2CO3、1;pH10(最後の3成分は、別々に滅菌した溶液からオートクレーブした培地に添加)を含む(全ての濃度はg/L)アルカリ基礎培地(ABM)を37℃で菌株12/1のルーチン培養に使用した。 IRおよびRP-HPLC分析のために、この細菌は、(すべての濃度をmMで)含む最小塩培地(MSM)中で37℃、200 rpmで培養された。 K2HPO4, 10; MgSO4-7H2O, 1; EDTA二ナトリウム塩, 0.3; ZnSO4-7H2O, 0.01; MnSO4, 0.02; CuSO4-5H2O, 0.004; FeSO4-7H2O, 0.1; NaMoO4-2H2O、0.004; (NH4)2SO4, 5および1% (w/v) の炭水化物:グルコース,フルクトース,スクロースのいずれか(すべての成分は,別途オートクレーブで濃縮したストック溶液から添加した)。 培地の最終pHは1N NaOHで10.5に調整した

2.2. 増殖および培養pHの解析

ABM上の対数期培養液1mLを用い、前培養液(50mL)(1%糖含有MSM)に接種した。 実際の試験培養(500 mL 三角フラスコに250 mLのMSM)は、対数期中期(O.D.〜1.2)の前培養物全体を植菌した。 各培養セットは3本のフラスコから構成されている。 650 nmの吸光度を細菌の増殖の指標とした。 pHは無細胞培養試料を4000×g、20分間遠心分離後、室温で測定した

2.3. FT-IR分析

培養物を60時間培養後に採取し、4000×g、20分間遠心分離を行った。 IR分析には、培養上清を凍結乾燥し、粉砕して粉末状にしたものを使用した。 その後、粉末状の上清と臭化カリウムを混合し、混合物をプレスして錠剤とした。 最後に、FT/IR-4200 spectrometer (JASCO, Tokyo, Japan)を用いて錠剤を分析した。 RP-HPLC分析

異なる時点で培養物を採取し、4000×gで20分間遠心分離した。 HPLC分析では、培養上清を0.22μmのフィルターでろ過し、ろ過した試料10μLをHPLCカラムに注入した。

分析用標準グレードのギ酸、酢酸、コハク酸、プロピオン酸、乳酸、イソ酪酸はSigmaから入手した。 標準溶液(100 mg/mLまたは100 μL/mL)を調製し、4℃で保存し、さらに使用した。 作業用標準液(10 mg/mL または 10 μL/mL)は毎日調製した。 各化合物および試料の緩衝液およびストック液の調製には、Milli-Q water(Millipore社製)を使用した。 ストック溶液、サンプル、バッファーは、セルロースメンブレンフィルターWhatman(0.45μm, Whatman, Clifton, NJ, USA)で濾過した。 溶媒は使用前に真空下で脱気した。

有機酸分析は、Tormo and Izco .の方法に従って行った。 分析は、1525 binary HPLC pump, 717 plus autosampler, and 2487 two channel UV detector set at 210 nm からなる Breeze System (Waters, Mildford, MA, USA) で行い、Breeze ソフトウェアを使用して操作した。 分離はAtlantis dC18 カラム(Waters)250 × 4.6 × 5 μmで実施した。 リン酸でpH2.20に調整した20 mMのNaH2PO4を毎日調製し、0.2 μmの親水性膜(Millipore)で濾過した。 溶媒プログラムは、リン酸でpH2.20に調整した20 mMリン酸バッファー(溶媒A)およびアセトニトリル(溶媒B)中に1%のアセトニトリルを含む2つのリザーバーを利用し、流速は室温で1.5 mL/minに設定されました。 グラジエントプログラムは溶媒Aを100%として開始し、7分後に溶媒Bを直線的に増加させ、5分で7%に到達させた。 12分から19分までは溶媒Aを93%、溶媒Bを7%に保ち、その後、流速を開始時の条件に変更して15分間カラムを平衡化してから次の試料を再び10μL注入しました。 結果

3.1. 定義培地での中和の分析

細菌が生産する有機酸の分析には、定義培地であり、飲料産業廃水と炭素源が似ていることから、最小塩培地を選択した。 菌は、異なる炭素源であるグルコース、フルクトース、スクロースを添加した最小塩培地で生育させた。 図1は、生育プロファイルと培地のpH特性を経時的に示したものである。 フルクトースとスクロースは、グルコースと比較して、培地の中和が非常に速かった。 また、グルコースで得られた最終的なpHは、スクロースやフルクトースで補った培地の場合よりも若干高くなった。 このことは、3つの炭素源で増殖した細菌の増殖プロファイルにも反映されている。 細菌はスクロースでより速く成長し、フルクトースとグルコースがそれに続いた。

(a)
(a)
(b)
(b)
(a)(b)
(b)
図1

pH(a)およびO.D. (b)のMSM上での経時変化。 数値は3回測定の平均値、エラーバーは標準偏差を表す

3.2. 培養上清に存在する官能基の同定

アルカリ廃液を中和するために菌が生産する代謝物の機能的な広義の官能基を同定するために、凍結乾燥した培養上清をFT-IRスペクトルに供した。 スペクトルにはカルボニル基(1644.98cm-1)と水酸基(3436.74cm-1)に対応する2つのピークが存在した(表1)。 文献調査によると、本菌は代謝産物として有機酸を生成し、アルカリ性廃水を中和している可能性が高い。

ピーク番号 ピークタイプ Wave cm-1) 推論
1 メジャー 3436.74 ヒドロキシル基
2 マイナー 2095.92
3 Major 1644.98 カルボニル基
4 マイナー 1167.97
5 Minor 1079.99
4 Monor 1079.97
4 5
表1
12/1 株の培養上清のFT-IRスペクトルの結果
3.3. 本菌の特異的代謝産物の同定

本菌が生産する有機酸を同定するために、文献調査により選定した既知の有機酸標準物質を用いて逆相HPLCを行った。 培地中の他の有機酸による干渉で生じる保持時間の違いを確認するため、標準物質を単独(図2(a))と混合(図2(b))の両方で測定した。 両者の標準有機酸のRTは、プロピオン酸を除いて保持時間の差が0.09単位を超えず、同様であることがわかった(Table 2)。 培養上清を同じ方法で分析したところ、ギ酸と同様の保持時間を持つ単一のピークから構成されていることがわかった。 さらに、上清に標準ギ酸を添加したところ、そのピークは上清中の生成物のピークと重なった(図2(d))。

4.N.A.13

5.28

1

1

酢酸

S. No. 有機酸 RTa RTb RTa-RTb RTc
1 ギ酸 4.18 -0.05 2.56
2 Lactic acid 5.37 -0.09 3.0
2 2 2 2 3.57
3 5.58 5.65 -0.07 3.76
4 sccinic acid 7.0 7.0 7.0 7.0 7.0 7.0 7.065 7.80 -0.13 5.68
5 プロピオン酸 11.49 10.73 0.76 8.08
6 Isobutyric acid 23.40 23.35 0.00 0.05

Table 2
標準有機酸のリテンション・タイム。 RTaは個々の保持時間、RTbは混合物中の保持時間。 RTcはTormo and Izcoで報告された保持時間。
(a)
(a)
(b)
(b)
(c)
(c)
(d)
(d)
(a)
(a)(b)
(b)(c)
(c)(d)
(d)
図2

-RP-」は、「RP-」と「RC-」を組み合わせたものです。個々の標準有機酸のHPLCクロマトグラム(a)。 標準有機酸混合物(b)、培養上清(c)、およびギ酸を添加した培養上清。
3.4. 細菌の代謝産物の定量分析

培養上清の定量分析では、異なる標準濃度のギ酸を実行し、各濃度に対応するピーク面積を算出した。 ピーク面積を濃度に対してプロットし、標準曲線を得た(図3)。 この標準曲線を用いて、異なる炭素源を添加した最小塩培地での時間経過に伴う酸の生成量を算出した。 また、本菌の培養上清を時間依存的に分析し、再度逆相HPLC分析に供した。 その結果、菌体培養上清中の主要生成物のピークが時間と共に増加することがわかった。 また、その保持時間はギ酸の保持時間とほぼ同じである。 異なる炭素源で生成されたギ酸の時間の関数としての研究を図4に示す。 ショ糖を添加したMSMの場合に最も多くの酸が生成され、次いでフルクトース、グルコースの順であった。

図3


培養上清中の蟻酸濃度測定の標準曲線。
図4

異なる炭素源を添加したMSMの有機酸生成量の経時的な変動。 数値は3回測定の平均値、エラーバーは標準偏差を表す。 議論

飲料産業廃液の主要な炭素源はスクロースである。 そこで、中和時に生成する代謝産物を分析するために、スクロースとその構成単糖であるグルコースおよびフルクトースを含む明確な最小塩培地を選択した。 3種の炭素源を添加した最小塩培地上での12/1株の増殖特性は、増殖と同時に効率的な中和が行われることを示している(図1(a)、(b))。 生育培地のpHの低下は、酸の生成または塩基の除去のいずれかによるものであることが必然である .

単糖で増殖する細菌では、酸の生成はよく知られている。 バチルス属のいくつかのアルカリ性菌の代謝産物が研究されている。 これらの研究では、スクロースを炭素源として生産される主要な有機酸は酢酸であることが判明した。 また、アルカリ性バチルス属のBacillus pseudofirmus OF4、Bacillus halodurans、Bacillus clausiのゲノム配列は、これらの種が機能的なピルビン酸-酢酸変換経路を有することから、この観察結果を支持している。 ギ酸は嫌気性条件下における好中性細菌の一般的な代謝物であり、B. circulans var. alkalophilusは好気性培養においても最大2 g/Lのギ酸を生産している。 その他の揮発性酸であるプロピオン酸、酪酸、イソ酪酸、イソ吉草酸はBacillus alcalophilus ssp. halodurans、B. alcalophilus、Bacillus sp.17-1 株に典型的に認められる。 イソ酪酸とイソ吉草酸は、いくつかの好中球性細菌の培地中に報告されている 。 しかし、これらの酸は、プロピオン酸や酪酸と同様に、Clostridium sp.の研究に基づいて、アミノ酸に由来するものと考えられている。 乳酸やピルビン酸は好中性細菌がごく普通に生産するが、バチルスによるコハク酸の生産はまれである。 エタノールは多くの好中性菌のグルコース培養による典型的な生成物であるが、アルカリ性菌では検出されていない。 このように、アルカリ性条件下での増殖は中性代謝産物の生産に影響を与える可能性がある。

バチルス属の代謝産物に関する最初の研究は、滴定法で行われた。 また、培養上清の緩衝能がカルボン酸のプロトン化領域であるpH5付近で上昇したことから、培地にカルボン酸が含まれていると推定された。 本研究では、培養上清に含まれる化合物の官能基を確認するために、FT-IR分光法を使用した。 その結果、カルボニル基(1644.98 nm)と水酸基(3436.74 nm)に特徴的なピークを示した(表1)ことから、水酸基とカルボニル基からなる化学種が存在し、カルボン酸である可能性が高い。

逆相HPLC法により培養上清に含まれる有機酸を分析した。 HPLCの条件は、pH2.2、1%アセトニトリルという、最も分解能が高いとされる条件を選択した。 逆相HPLC法は、より安価なカラムを使用できること、分離を最適化するための分析パラメータの操作が容易であること、室温での分析が可能であることなどの利点がある。 まず、この方法を用いて、文献調査に従って選んだ酸の標準物質の保持時間を計算した。 この条件下での酸の溶出順序はTormo and Izcoの報告と同じであったが、本研究で観察された保持時間とTormo and Izcoで報告された保持時間にはばらつきがあった。 この変動は、TormoとIczoで報告された24℃±1℃の温度に対して、本研究では25-30℃といったHPLC条件の違いに起因するものと考えられる。

培養上清のRP-HPLCでは、有機酸の特徴的な吸収波長である211 nmに単一のピークが存在することが確認された。 このことから、上清には有機酸と考えられる単一の化学物質が含まれていることが分かります。 このピークの保持時間を標準有機酸の保持時間と比較したところ、ギ酸に最も近い保持時間であることがわかった。 この観察は、培養上清にギ酸を添加し、生成物のピーク面積を増加させることでさらに確認された(Figure 2(c) and 2(d))。 培養上清中のギ酸の存在は、Bacillus属のいくつかのアルカリ性細菌、およびHalonatronum saccharophilum、Amphibacillus fermentum、Amphibacillus tropicusなどのいくつかの糖分解嫌気性アルカリ性細菌の代謝産物と一致するものであった。

これまで報告されているアルカリ性細菌における単位時間当たりの最大pH低下は、Bacillus circulans var. alkalophilusの場合で0.13 units/hであり、本研究で報告された接種後1時間での2ユニット以上の低下と比べるとかなり低い。 pHの低下が大きいことから、酸性の異化産物が生成されていることが示唆された。 しかし、pHの低下速度だけでは酸の濃度の増加は確認できない。 そこで、RP-HPLCを用いて、本菌の代謝産物の定量分析を行った。 好アルカリ性細菌の培養上清中の有機酸の定量において、GCとHPLCの方法を比較したところ、GLCによる酸の分解能は優れていたものの、HPLCによる定量的再現性はGLCよりも優れていたため、GCよりもHPLCが優先されました . 予想通り、生成される酸の濃度は培養時間の増加とともに増加することがわかった(図4)。 実際、酸の量は最低pHに達した後も増え続けていた。 このことは、pHが最小値に達した後30時間経過しても酸の生産量が増加し続けた、通性および偏性アルカリ性Bacillus属細菌を用いた先行研究とも一致する。 異なる炭素源を添加した培地で生産された代謝産物を比較分析したところ、酸は同じ最終濃度であったが、酸の生産率はショ糖を添加した培地で最も高く、次いでフルクトースとグルコースであった(図4)。 これは、これらの糖類を添加した培地での菌の増殖特性と一致する。

5. 結論

Exiguobacterium sp.12/1株は短鎖有機酸-ギ酸を生産することにより外部培地のpHを中和することができる。 アルカリ性廃液の大規模バイオレメディエーションへの応用を考えると、本菌の飲料産業廃液に対するアルカリ中和能力は、実用化への第一歩と考えることができる。

謝辞

N. M. KulshreshthaはUniversity Grants Commissionから研究奨学金を授与されたことを認める。 また、本研究のためにR&Dプラットフォームと施設を提供してくださったインド科学産業研究評議会に深く感謝いたします。

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