Nel 1964, W39AA, un traduttore di WBGU-TV a Bowling Green, Ohio, ha firmato in onda sul canale 39. Prima del 1974, Fort Wayne era stata l’unica area dell’Indiana senza accesso alla programmazione della PBS anche via cavo (era una pratica standard per la PBS offrire programmi alle stazioni commerciali nei mercati senza stazioni membri della PBS, ma non è ancora emersa alcuna prova riguardante il trasporto dei programmi della rete a Fort Wayne); la copertura di W39AA era generalmente limitata all’immediata area di Fort Wayne, poiché la sua copertura non era abbastanza potente da coprire l’intero mercato. Questa stazione ripetitore a bassa potenza era semplicemente un segnaposto, in quanto il canale 39 è stato assegnato come un canale educativo a piena potenza a Fort Wayne. Entro i primi anni 1980, la stazione divenne un traduttore della stazione PBS di Indianapolis WFYI.

Il 12 marzo 1985, un gruppo televisivo pubblico locale è stato concesso lo slot del canale 39 dalla FCC, e concesso in licenza la stazione sotto le lettere di chiamata WFWA; WFWA firmato in aria il 5 dicembre 1986, portando nord-est Indiana sua propria stazione PBS per la prima volta.

Nel 2003, WFWA è diventata la prima stazione televisiva nel mercato di Fort Wayne a trasmettere un segnale digitale, originariamente portando il feed nazionale PBS HDTV su un sottocanale separato dalla sua programmazione regolare; problemi di finanziamento avrebbe poi causare il feed HD nazionale per essere tirato, lasciando tutta la programmazione in definizione standard per diversi anni. È stato annunciato che il canale principale 39.1 della WFWA avrebbe trasmesso in alta definizione a tempo pieno ad un certo punto durante l’estate 2010. Durante una pausa di impegno estate 2010, direttore generale Bruce Haines ha annunciato che il cambiamento si sarebbe verificato il 4 luglio 2010 alle 7:30 p.m. A causa di progressi nella compressione video, la stazione è stata in grado di aggiornare il suo canale principale in HD senza sacrificare la qualità video dei suoi altri tre sottocanali SD.

Nel maggio 2013, la stazione ha annunciato una raccolta di fondi per aggiornare la sua infrastruttura nei prossimi tre anni, tra cui un aumento del segnale, l’acquisto di attrezzature di produzione remota e miglioramenti al controllo principale della stazione.

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