Era la seconda chiesa cattolica romana di Philadelphia. Fu costruita nel 1763 come chiesa domenicale per essere usata dai parrocchiani della vecchia chiesa di San Giuseppe. Alla fine divenne una parrocchia a sé stante. La chiesa fu prominente nella vita della Filadelfia coloniale e rivoluzionaria.

La vecchia chiesa di St. Mary fu il luogo della prima commemorazione religiosa pubblica della Dichiarazione di Indipendenza.

La vecchia chiesa di St. Mary divenne la prima cattedrale della diocesi cattolica romana di Filadelfia nel 1810. Rimase tale fino al 1838.

Molte figure di spicco della Filadelfia coloniale e della Rivoluzione frequentavano questa storica chiesa.

I membri del Congresso Continentale parteciparono alle funzioni qui in quattro occasioni dal 1777 al 1781. George Washington, in uno spirito ecumenico, vi si recò in almeno due occasioni. Anche il puritano John Adams venne qui e scrisse a sua moglie Abigail,

“la musica, composta da un organo e un coro di cantanti, è andata avanti tutto il pomeriggio tranne il tempo del sermone, e l’assemblea ha cantato in modo molto dolce e squisito. Qui c’è tutto ciò che può colpire l’occhio, l’orecchio e l’immaginazione, tutto ciò che può affascinare e ammaliare i semplici e gli ignoranti, mi chiedo come Lutero abbia mai rotto l’incantesimo”. – US Library of Congress