Specie di Achromobacter e Alcaligenes

Le denominazioni tassonomiche delle specie Achromobacter e Alcaligenes sono state particolarmente confuse. Achromobacter xylosoxidans è stato rinominato Alcaligenes xylosoxidans subsp. xylosoxydans, ma l’analisi della sequenza 16S rRNA e gli studi sul contenuto di guanina-citosina supportano il posizionamento di questo organismo nel genere Achromobacter.88 Anche altre specie di Alcaligenes, A. ruhlandii, A. piechaudii, e A. denitrificans, sono state trasferite ad Achromobacter. Gli organismi precedentemente considerati Achromobacter gruppi A, C, e D (e prima ancora, CDC gruppi Vd-1 e Vd-2) sono ora chiamati Ochrobactrum anthropi e sono considerati separatamente. Le specie di Achromobacter sono bacilli gram-negativi non fermentanti che si trovano nel suolo e nell’acqua, comprese piscine, acqua di pozzo, soluzioni di dialisi e soluzioni di clorexidina. Occasionalmente possono essere recuperati dal tratto respiratorio e gastrointestinale, principalmente in persone con contatto sanitario. L’infezione risulta quando vengono introdotti nelle ferite o colonizzano quelle con difese dell’ospite compromesse. Le specie clinicamente rilevanti includono le specie asaccarolitiche A. dentrificans, A. piechaudii, e Alcaligenes faecalis (questo organismo rimane nel genere Alcaligenes); la specie saccarolitica A. xylosoxidans; e l’innominato Achromobacter gruppo F. Sebbene a volte sia considerato un contaminante, l’Achromobacter gruppo B (ora classificato insieme all’Achromobacter gruppo E come Pannonibacter phragmitetus) è stato recuperato dal sangue di pazienti con sepsi clinica ed endocardite.89

A. xylosoxidans è il più importante clinicamente tra questi organismi. Probabilmente fa parte del microbiota endogeno dell’orecchio e del tratto gastrointestinale ed è un contaminante comune dei fluidi.90 L’organismo è stato implicato in focolai di infezione nosocomiale associati a soluzioni contaminate (ad esempio, fluidi intravenosi, fluidi per emodialisi, fluidi per irrigazione, collutorio), trasduttori di pressione, incubatrici e umidificatori, saponi e disinfettanti contaminati.91 La contaminazione dell’acqua del pozzo è stata la fonte di infezione in un caso di batteriemia.92 La malattia clinica causata da A. xylosoxidans ha coinvolto isolati da sangue, fluidi peritoneali e pleurici, urina, secrezioni respiratorie ed essudati di ferite. La batteriemia, spesso collegata a cateteri intravascolari, è l’infezione più comunemente riportata ed è spesso polimicrobica in pazienti con tumori maligni sottostanti.93,94 Sono state segnalate sepsi delle vie biliari, meningite (a volte con predominanza linfocitaria nel liquido cerebrospinale), polmonite (nosocomiale e acquisita in comunità), peritonite (compresa la peritonite batterica spontanea e la peritonite in pazienti in dialisi peritoneale ambulatoriale continua), infezione del tratto urinario, congiuntivite, osteomielite, infezione del ginocchio protesico, infezione della rete, pancreatite necrotizzante infetta ed endocardite della valvola protesica.90,91-99 I pazienti hanno spesso uno stato immunosoppresso come il cancro o l’infezione da HIV, ma questo non è sempre il caso, specialmente nei focolai nosocomiali.94,98 A. xylosoxidans così come altre specie di Achromobacter sono state recuperate con frequenza crescente dalle secrezioni respiratorie di persone con fibrosi cistica.99 La colonizzazione è stata associata all’esacerbazione dei sintomi respiratori, probabilmente come risultato dell’esacerbazione della risposta infiammatoria causata dal lipopolisaccaride (LPS) e da un fattore citotossico prodotto da Achromobacter.99,100 Diversi studi caso-controllo non hanno mostrato un deterioramento più rapido dello stato clinico o della funzionalità polmonare tra i pazienti con fibrosi cistica colonizzati cronicamente con specie di Achromobacter o Alcaligenes, tranne in un sottogruppo di pazienti con un rapido aumento degli anticorpi specifici precipitanti verso A. xylosoxidans.101 Il recupero nell’infezione neonatale può derivare dal trasferimento perinatale dalla madre.102

A. denitrificans è stato recuperato come singolo patogeno dal sangue, dal liquido cerebrospinale e da altri fluidi corporei normalmente sterili, così come da un ascesso renale e in coltura mista da siti solitamente contenenti microbiota normale.103 Poche pubblicazioni recenti hanno affrontato il ruolo patogeno di questi organismi. Si ritiene che A. piechaudii abbia causato un’otite cronica in un paziente diabetico104 ed è stato anche recuperato dal sangue in un paziente con una neoplasia ematologica e un catetere di Hickman infetto che aveva una batteriemia ricorrente.105

Alcaligenes faecalis può essere recuperato in una varietà di ambienti clinici. La maggior parte degli isolati di A. faecalis dal sangue o dalle secrezioni respiratorie sono legati alla contaminazione di attrezzature o fluidi ospedalieri con l’organismo, con conseguente colonizzazione o infezione umana. L’urina è l’altro sito comune di recupero, anche se raramente causa un’infezione sintomatica del tratto urinario. È stato anche recuperato da ulcere corneali, scariche auricolari, drenaggi di ferite, liquido peritoneale e feci.106-108 Raramente viene recuperato in coltura pura da uno di questi siti.

Filogeneticamente e biochimicamente, Alcaligenes e Achromobacter sono strettamente correlati al genere Bordetella. Le specie di Achromobacter crescono bene su supporti microbiologici standard, compreso l’agar MacConkey. Producono colonie piatte, diffuse e ruvide e hanno flagelli peritrichi, caratteristiche che aiutano a distinguerli dalle pseudomonadi. La maggior parte dei ceppi crescerà anche su agar selettivo Burkholderia cepacia. Gli organismi sono ossidasi positivi e catalasi positivi e ossidano il glucosio per produrre acido, ma sono ureasi negativi e indolo negativi. A. xylosoxidans, come indica il nome della specie, ossida rapidamente lo xilosio, il che lo distingue dalle altre specie del genere. Distinguere gli organismi e confermare l’identificazione è reso difficile dalla loro mancanza di reattività in molti test biochimici o di assimilazione. La spettrometria di massa MALDI-TOF offre un’identificazione accurata di questo gruppo di organismi e giocherà un ruolo sempre più importante man mano che la tecnologia verrà utilizzata più ampiamente.

Un isolato di A. xylosoxidans può essere facilmente scambiato per un ceppo non P. aeruginosa di Pseudomonas o per un ceppo del complesso B. cepacia, ma il modello di suscettibilità insolito suggerisce la corretta identità. A. faecalis produce un caratteristico odore dolce simile a quello delle mele verdi. Piperacillina-tazobactam e carbapenemi sono attivi in vitro e sarebbero una terapia iniziale appropriata per gravi infezioni da A. xylosoxidans, mentre il trimetoprim-sulfametossazolo può essere usato per il tratto urinario e altre infezioni che non richiedono terapia parenterale. Anche la ceftazidima ha attività, sebbene i ceppi siano generalmente resistenti ad altre cefalosporine, penicilline a spettro stretto, aztreonam e aminoglicosidi. La suscettibilità ai fluorochinoloni è variabile. Alte concentrazioni di colistina inibiscono la maggior parte dei ceppi. Alti tassi di resistenza alla ciprofloxacina e agli aminoglicosidi sono stati notati in ceppi isolati da pazienti con fibrosi cistica. I meccanismi di resistenza includono un’oxacillinasi costitutiva e β-lattamasi acquisite, così come pompe di efflusso multidroga.109 La presenza di geni di metallo-β-lattamasi di tipo IMP, VIM o TMB trasportati su integroni trasferibili di classe 1 può produrre resistenza ai carbapenemi e contenere il potenziale per il trasferimento orizzontale.110,111

I ceppi di A. faecalis sono solitamente sensibili al trimetoprim-sulfametossazolo, alle ureidopenicilline, ai carbapenemi e, a differenza delle specie di Achromobacter, alla maggior parte delle cefalosporine.107 I risultati variano per aztreonam, fluorochinoloni e aminoglicosidi, con una resistenza comune alla gentamicina.107 La produzione di β-lattamasi ad ampio spettro è stata descritta anche in A. faecalis.