10 suggerimenti per ottimizzare i campioni di DNA della saliva, basati su milioni di campioni
Come specialisti nel campo della raccolta di campioni di saliva, sappiamo che avere campioni di DNA della saliva ottimizzati per garantire i migliori risultati possibili è fondamentale per il tuo studio di ricerca.
Il DNA della saliva ad alta resa e alta qualità consente ai nostri clienti di eseguire più studi e generare più dati, accelerando così la loro ricerca. Inoltre, avere opzioni di raccolta non invasive come Oragene fornisce ai ricercatori e ai partecipanti un metodo di raccolta che piace veramente.
Abbiamo pensato che sarebbe stato utile evidenziare consigli e trucchi collaudati per ottimizzare i tuoi campioni. Sappiamo cosa serve per ottenere grandi risultati dai campioni di saliva e abbiamo anni di esperienza per sostenerlo.
Abbiamo compilato la nostra top 10 modi per ottimizzare i campioni di saliva del DNA che possono contribuire al tuo successo. Mentre leggi, chiediti se qualcuno di questi consigli potrebbe essere utile nel tuo laboratorio. E se hai ulteriori suggerimenti da condividere, facci sapere su Twitter, Linkedin o sulla nostra pagina Facebook.
Ottimizzazione basata sulla raccolta
- È importante seguire attentamente le istruzioni di raccolta. Assicurarsi che i soggetti consegnino la quantità richiesta di saliva e che non mangino/bevano/fumino/masticino gomme per 30 minuti prima di dare un campione. Il mancato rispetto di queste raccomandazioni può comportare una resa ridotta del DNA.
- Quando si sputa, le bolle non contano. Assicurarsi che la saliva liquida sia sulla linea di ‘Fill To’; eventuali bolle presenti dovrebbero essere sopra la linea. Questo assicurerà che venga raccolta la quantità ottimale di saliva. Se si raccoglie meno saliva, la qualità non è influenzata ma la resa del DNA sarà ridotta in proporzione.
- La resa del DNA varierà tra i donatori. E’ importante testare campioni da diversi donatori per avere un quadro accurato della resa che ci si può aspettare.
- Per i donatori che hanno difficoltà a sputare 2 ml, il flusso di saliva può spesso essere stimolato strofinando le guance, proprio dietro i denti posteriori. Si può anche stimolare la produzione di saliva usando un pizzico di zucchero sulla lingua. Basta una piccola quantità, quanto basta perché la persona possa sentirne il sapore. Anche una goccia di succo di limone funziona.
- A volte può essere difficile raccogliere da una persona incapace di sputare a comando, come un bambino piccolo. Utilizzando un kit di raccolta progettato per chi non sputa, come la raccolta assistita Oragene (OG-675) o ORAcollect per la pediatria (OC-175), renderà la raccolta del campione più facile sia per voi che per il donatore e vi assicurerà di raccogliere abbastanza DNA.
Ottimizzazione basata sulla lavorazione
- La fase di incubazione a 50°C deve essere effettuata nella provetta originale del campione, prima di rimuovere un’aliquota per l’estrazione del DNA. L’incubazione deve essere fatta solo una volta; non è necessario ripetere questo passaggio quando si estrae il DNA da aliquote successive.
- A meno che non vengano prese misure specifiche per rimuovere l’RNA, l’RNA si purifica insieme al DNA. Si consiglia di quantificare il DNA mediante fluorescenza (ad es. Picogreen) poiché l’assorbanza UV può sovrastimare la quantità di DNA.
- Se l’applicazione a valle richiede alte concentrazioni di DNA, è possibile aumentare la concentrazione riducendo la quantità di tampone utilizzato per sciogliere il pellet di DNA da 100 µL a 50 µL. È sempre più facile diluire il DNA in seguito piuttosto che doverlo concentrare.
- I campioni di ormone/saliva sono stabili a temperatura ambiente per anni. Se non puoi estrarli subito, non c’è bisogno di refrigerarli o congelarli; basta lasciarli sul banco.
- Assicurati un tempo sufficiente per la dissoluzione del DNA dopo l’estrazione. Il DNA estratto da campioni di ormone/saliva con il metodo prepIT-L2P ha un peso molecolare estremamente elevato e, pertanto, richiede tempo per dissolversi completamente. Dopo l’estrazione, si consiglia di lasciare il campione a temperatura ambiente per una notte per consentire al DNA di dissolversi completamente. La mancata dissoluzione completa del DNA può influire sull’accuratezza della quantificazione.
Questi sono i nostri 10 modi migliori per ottimizzare i campioni di DNA. Avete qualcosa da aggiungere alla lista? Per favore lascia un commento e facci sapere.
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