A szalmonellózis az emberek és az állatok bélrendszeri megbetegedéseinek egyik fő oka. Évente becslések szerint 1,4 millió szalmonellózisos eset fordul elő emberek körében az Egyesült Államokban (15). Ezen esetek közül körülbelül 35 000 esetben a közegészségügyi laboratóriumok szalmonellaizolátumokat szerotipizálnak, és az eredményeket elektronikusan továbbítják a Betegségellenőrzési és Megelőzési Központoknak (CDC). Ezeket az információkat a helyi és állami egészségügyi hivatalok és a CDC felhasználja az emberi szalmonellózis helyi, regionális és országos tendenciáinak nyomon követésére és a szalmonellózis lehetséges kitöréseinek azonosítására (1, 5). Az elmúlt 25 év során a Nemzeti Szalmonella Felügyeleti Rendszer értékes információkat szolgáltatott az emberi szalmonellózis előfordulási gyakoriságáról az Egyesült Államokban és az egyes szerotípusok tendenciáiról. A nemrégiben bevezetett Salmonella Outbreak Detection Algorithm, amely a kitörések felismerésének másik értékes eszköze (11), lehetővé teszi a felhasználók számára, hogy észleljék az egyes szalmonella szerotípusok által okozott emberi fertőzések növekedését. A szalmonella felügyeleti tevékenységek a szerotípusok azonosításának pontosságától függenek, és a szabványosított nómenklatúra megkönnyíti őket. A CDC Nemzeti Szalmonella Referencia Laboratóriuma az Egyesült Államok közegészségügyi laboratóriumainak segítséget nyújt a szerotípusok azonosításában eljárási kézikönyvek, képzési workshopok, frissítések és a problémás izolátumok azonosításához nyújtott segítség révén.

A szalmonellának jelenleg 2463 szerotípusa (szerovara) van (18). A Salmonella szerotípusok antigénképleteit az Egészségügyi Világszervezet (WHO) Szalmonella Referencia- és Kutatási Együttműködő Központja (Pasteur Intézet, Párizs, Franciaország) (WHO Együttműködő Központ) határozza meg és tartja fenn, és az új szerotípusokat a Kauffmann-White séma éves frissítései tartalmazzák (18, 19).

A Salmonella nomenklatúra összetett, és a tudósok különböző rendszereket használnak a nemzetségre való hivatkozásra és kommunikációra. A szalmonella-nómenklatúra egységessége azonban szükséges a tudósok, az egészségügyi tisztviselők és a nyilvánosság közötti kommunikációhoz. Sajnos a jelenlegi használat gyakran több olyan nómenklatúra-rendszert kombinál, amelyek következetlenül osztják a nemzetséget fajokra, alfajokra, alnemzetségekre, csoportokra, alcsoportokra és szerotípusokra (szerovarokra), és ez zavart okoz. A CDC számos megkeresést kap a megfelelő Salmonella-nómenklatúrával kapcsolatban az eredmények jelentéséhez és a tudományos publikációkban való használathoz.

A Salmonella nemzetség nómenklatúrája a Kauffmann (12) által az O (szomatikus) és H (flagelláris) antigének szerológiai azonosítása alapján javasolt kezdeti egy szerotípus – egy faj koncepcióból fejlődött ki. Minden egyes szerotípust külön fajnak tekintettek (például S. paratyphi A, S. newport és S. enteritidis); ha ezt a koncepciót ma is alkalmaznák, akkor a Salmonella 2463 faját kapnánk. Más rendszertani javaslatok a törzs klinikai szerepén, a szerotípusokat alnemzetségekre osztó biokémiai jellemzőkön, és végül a genomikai rokonságon alapultak. A nemzetség nómenklatúrájának megváltoztatására vonatkozó javaslatokat korábban már összefoglaltuk (8, 9, 14).

A Salmonella taxonómiájában a meghatározó fejlemény 1973-ban történt, amikor Crosa és munkatársai (6) DNS-DNS hibridizációval kimutatták, hogy a Salmonella összes szerotípusa és I., II. és IV. alnemzetsége, valamint az “Arizona” összes szerotípusa faji szinten rokon; tehát egyetlen fajba tartoznak. Az egyetlen, később leírt kivétel a korábban V. alfajként ismert S. bongori, amely a DNS-DNS hibridizáció alapján különálló faj (21). Mivel a S. choleraesuis a baktériumnevek jóváhagyott listáján (23) a Salmonella típusfajaként szerepelt, elsőbbséget élvezett fajnévként. A “choleraesuis” név azonban egy fajra és egy szerotípusra is utal, ami zavart okoz. Ezenkívül a Choleraesuis szerotípus nem reprezentatív a szerotípusok többségére, mivel biokémiailag különbözik, mivel arabinóz- és trehalóz-negatív (4, 13).

1986-ban a Nemzetközi Szisztematikus Bakteriológiai Bizottság Enterobacteriaceae albizottsága a XIV. nemzetközi mikrobiológiai kongresszuson egyhangúlag javasolta, hogy a Salmonella típusfaját a Kauffmann és Edwards által 1952-ben kitalált S. enterica (17) névre változtassák (13), mivel egyetlen szerotípus sem osztja ezt a nevet. 1987-ben Le Minor és Popoff, a WHO Együttműködő Központ munkatársai hivatalosan “Véleménykérésként” tettek javaslatot a Nemzetközi Szisztematikus Bakteriológiai Bizottság Igazságügyi Bizottságának (14). Az ajánlást a CDC, Ewing 1986-ban az Edward’s and Ewing’s Identification of Enterobactericeae 4. kiadásában (8) és más laboratóriumok is elfogadták (16).

Mindezek ellenére a kérelmet az Igazságügyi Bizottság elutasította. Bár az Igazságügyi Bizottság általánosságban a S. enterica mint a Salmonella típusfaja mellett foglalt állást, tagjai úgy vélték, hogy a tífuszos láz kórokozójának, a Salmonella serotípus Typhi-nek a státuszával nem foglalkoztak megfelelően ebben a véleménykérésben. Aggódtak amiatt, hogy ha a S. enterica-t fogadnák el típusfajként, akkor a Salmonella serotype Typhi-t S. enterica subsp. enterica serotype Typhi néven említenék, és az orvosok esetleg nem vennék észre vagy figyelmen kívül hagynák, ugyanúgy, ahogyan a S. choleraesuis subsp. choleraesuis serotype Typhi-t is figyelmen kívül hagynák. Ebből a szempontból a típusfaj nevének megváltoztatásával semmit sem nyerhetnénk. Az Igazságügyi Bizottság ezért úgy döntött, hogy a S. choleraesuis maradjon a törvényes típusfaj, amíg egy módosított véleménykérés nem érkezik (24). E döntésnek eleget téve 1999-ben Euzéby (7) módosított kérelmet nyújtott be, amely jelenleg is folyamatban van, és a S. enterica-t fogadta el a Salmonella típusfajaként, miközben kivételként megtartotta a “S. typhi” fajt.

1987-ben Le Minor és Popoff (14) szintén azt javasolta, hogy a Salmonella hét alnemzetségét alfajként (I., II., IIIa, IIIb, IV, V és VI. alfaj) nevezzék meg. A III. alnemzetséget genomikai rokonság és biokémiai reakciók alapján IIIa és IIIb alnemzetségre osztották. A IIIa alfaj (S. enterica subsp. arizonae) a monofázisos “Arizona” szerotípusokat, a IIIb alfaj (S. enterica subsp. diarizonae) pedig a difázisos szerotípusokat tartalmazza. Az összes “Arizona” szerotípust Rohde 1979-ben (22) beépítette a Kauffmann-White sémába.