En 1964, W39AA, un traducteur de WBGU-TV à Bowling Green, Ohio, a signé sur l’antenne sur le canal 39. Avant 1974, Fort Wayne avait été la seule région de l’Indiana à ne pas avoir accès aux programmes de PBS, même sur le câble (c’était une pratique courante pour PBS d’offrir des programmes aux stations commerciales sur les marchés sans stations membres de PBS, mais aucune preuve concernant le transport des programmes du réseau à Fort Wayne n’a encore fait surface) ; la couverture de W39AA était généralement limitée à la région immédiate de Fort Wayne, car sa couverture n’était pas assez puissante pour couvrir l’ensemble du marché. Cette station répétitrice de faible puissance n’était qu’un pis-aller, le canal 39 ayant été attribué comme canal éducatif à pleine puissance à Fort Wayne. Au début des années 1980, la station est devenue un traducteur de la station PBS d’Indianapolis WFYI.

Le 12 mars 1985, un groupe local de télévision publique a obtenu de la FCC l’emplacement du canal 39 et a accordé une licence à la station sous les lettres d’appel WFWA ; WFWA a signé sur les ondes le 5 décembre 1986, apportant au nord-est de l’Indiana sa propre station PBS pour la toute première fois.

En 2003, WFWA est devenue la première station de télévision du marché de Fort Wayne à diffuser un signal numérique, transmettant à l’origine le flux HDTV national de PBS sur un sous-canal distinct de sa programmation régulière ; des problèmes de financement entraîneraient plus tard le retrait du flux HD national, laissant toute la programmation en définition standard pendant plusieurs années. Il a été annoncé que le canal principal 39.1 de la WFWA diffuserait en haute définition à plein temps à un moment donné au cours de l’été 2010. Au cours d’une pause d’engagement de l’été 2010, le directeur général Bruce Haines a annoncé que le changement aurait lieu le 4 juillet 2010 à 19 h 30. En raison des progrès de la compression vidéo, la station a pu mettre à niveau son canal principal en HD sans sacrifier la qualité vidéo de ses trois autres sous-canaux SD.

En mai 2013, la station a annoncé une collecte de fonds pour améliorer son infrastructure au cours des trois prochaines années, y compris une augmentation du signal, l’achat d’équipement de production à distance et des améliorations à la commande principale de la station.