Citrobacter est une infection bactérienne courante. Elle est souvent observée lorsque des tests intestinaux fonctionnels sont effectués pour aller au fond de vos symptômes digestifs. Cet article couvrira comment et pourquoi les infections à Citrobacter peuvent contribuer à votre mauvaise santé digestive et vous orientera vers des options de traitement naturel pour cette surcroissance bactérienne particulière.

Infection à Citrobacter

D’abord, exposons quelques concepts clés.

L’espèce Citrobacter, y compris la notable Citrobacter freundii, est généralement considérée comme étant une bactérie commensale présente dans un intestin humain sain. Elle ne devient un « problème » que lorsqu’on lui donne l’espace et les nutriments nécessaires à sa croissance (1).

En langage clair – Citrobacter est une bactérie qui fait partie intégrante de notre flore intestinale. Lorsqu’on lui donne de l’espace pour se développer, elle peut devenir un problème.

Citrobacter est un membre de l’embranchement des protéobactéries et peut-être plus important encore de la famille des Enterobacteriaceae. Nous avons abordé cette famille en profondeur dans un article précédent que je vous indiquerai à plusieurs reprises dans cet article. Si vous ne l’avez pas encore lu, c’est peut-être le bon moment pour y faire un saut et vous mettre à jour – Comment traiter les infections bactériennes : Une approche holistique.

Bien que le phylum des protéobactéries soit représenté dans un intestin sain, tout se résume à des chiffres. Lorsqu’on les laisse se développer, les membres de ce groupement de bactéries peuvent provoquer toute une série de problèmes, comme le montre l’image ci-dessous. Un exemple classique de dysbiose – ou un microbiote intestinal déséquilibré.

Les autres membres de la famille de bactéries Enterobacteriaceae comprennent

• Escherichia coli
• Shigella
• Klebsiella
• Yersinia

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• Salmonella
• Enterobacter
• Hafnia
• Morganella
• Proteus

Le gros titre de la famille de bactéries dont fait partie Citrobacter est leur impact négatif sur le système immunitaire.

Laissez-moi vous expliquer.

Les bactéries gram négatif ont un produit connu sous le nom de lipopolysaccharide trouvé dans leur paroi cellulaire. Le lipopolysaccharide, également appelé LPS ou endotoxine, est libéré lorsque la cellule bactérienne est perturbée. Cela déclenche à son tour une réaction immunitaire et la cascade inflammatoire associée à tous ces méchants symptômes digestifs que vous pouvez ressentir (2).

Symptômes d’une infection à Citrobacter

Citrobacter ne joue pas toujours franc jeu. Il a été associé à toute une série d’états pathologiques différents dans tout le corps, et bien que ceux-ci soient moins fréquents, il vaut la peine de le savoir.

Ceux-ci comprennent

• Les infections des voies urinaires (plus souvent associées à E. coli
• Les infections des voies respiratoires
• Les infections du système nerveux central
• L’arthrite infectieuse
• La septicémie (infections du sang).

Bien que ces complications d’une infection à Citrobacter soient très rares chez les adultes en bonne santé, elles sont plus fréquentes chez les personnes immunodéprimées et chez les nourrissons (3).

Chez les adultes immunocompétents (ici le système immunitaire fonctionne correctement), les infections à Citrobacter restent généralement dans l’intestin – soit l’intestin grêle, soit le gros intestin. J’aime considérer cette présentation comme étant plutôt une surcroissance bactérienne.

Bien que Citrobacter puisse jouer un rôle dans la surcroissance bactérienne de l’intestin grêle (4), vous ne pourrez pas le déterminer avec les tests de selles indiqués ci-dessous. Ici, vous devrez vous fier aux tests respiratoires SIBO.

Les tests sur les selles permettront de déterminer si vous avez une infection à Citrobacter dans le gros intestin.

Alors, quels sont les meilleurs tests de selles ?

Comment tester une infection et une surcroissance de Citrobacter ?

Du fait que vous lisez cet article, je suppose que vous avez déjà testé et trouvé une infection à Citrobacter.

Peut-être avez-vous effectué le GI MAP complet (également connu sous le nom de cartographie complète du microbiome ici en Australie) comme le montre l’image ci-dessous.

Une deuxième façon de tester les infections à Citrobacter serait un autre test de selles basé sur l’ADN qui vous donne un instantané plus complet du biome intestinal du gros intestin. Ces tests comprennent Ubiome et Microba. Dans ce cas, vous devrez peut-être approfondir les résultats et même télécharger les données brutes pour savoir si vous avez une surcroissance de Citrobacter. C’est pourquoi il est important de travailler avec un clinicien qui connaît bien les intestins. À long terme, cela permet d’économiser du temps et de l’argent.

Un autre test de selles qui peut montrer une infection à Citrobacter est l’analyse complète des selles digestives (CDSA en abrégé). Ces tests de culture et de microscopie sont beaucoup moins fiables et sont considérés comme une technologie dépassée par de nombreux experts en santé digestive. Il y a tellement de raisons pour lesquelles c’est le cas.

• Nombre un votre échantillon de selles est expédié au laboratoire, ce qui peut prendre des jours à des semaines. La variation de température pourrait conduire à des changements dans la population microbienne de l’échantillon.
• Deuxièmement, les techniciens de laboratoire doivent effectivement cultiver la culture. Ici, ils utilisent des milieux spécifiques à la culture sur lesquels les bactéries aiment se développer. Vous parlez de résultats faussés !
• Enfin, la plupart des CDSA vous donnent une note indiquant l’étendue de la croissance des bactéries. Contrairement à la MAP GI (vue ci-dessus), ceci est complètement subjectif. Quelle est la différence entre + et +++ ? Qui sait ! Et comment cela vous concerne-t-il, vous et votre éventuelle surcroissance bactérienne ?

Ok, assez de culture et de microscopie (CDSA) bashing. Passons à la façon dont vous avez pu contracter cette infection particulière.

Causes des infections à Citrobacter

Nous avons donc établi que Citrobacter est un habitant normal d’un intestin sain. Il ne devient un problème que lorsqu’on lui permet de se développer de manière excessive et de devenir une prolifération bactérienne propre dans le gros intestin. Mais comment ce processus se produit-il réellement ?

Le débat en cours…

Voici quelques théories étayées par la science.

Inflammation

Certains chercheurs pointent l’inflammation comme moteur de la surcroissance de la famille de bactéries dont fait partie Citrobacter. Ils postulent qu’en présence d’une inflammation, les bactéries anaérobies facultatives moins amicales (comme Citrobacter) ont un avantage concurrentiel sur les bactéries anaérobies obligatoires (la plupart des microbes bénéfiques) dans le gros intestin (5).

En voyant qu’une expansion des membres du phylum Proteobacteria (vu dans l’image ci-dessus) tels que Citrobacter conduit à une inflammation systémique cela se transforme rapidement en un cercle vicieux. L’inflammation nourrit la croissance de Citrobacter qui nourrit ensuite l’inflammation…

La perte de l’équilibre bactérien

Comme avec la plupart des choses dans la nature, tout se résume à l’équilibre.

Lorsque certaines des superstars de l’intestin ont été compromises, ou même perdues, alors cela ouvre une niche pour que des microbes moins amicaux s’installent.

Vous connaissez tous les principales insultes à votre flore intestinale, mais couvrons-les juste pour être complet.

1. Antibiotiques – Nous savons tous que les antibiotiques peuvent vraiment gâcher nos intestins. Certains d’entre vous peuvent même avoir une expérience de première main avec cela. Les vrais intellos du microbiome ont peut-être même échantillonné leur microbiome intestinal et constaté une faible diversité bactérienne (un acteur majeur de la santé et de la maladie). Pour nous éviter de couvrir le même sujet ad nauseum, je vais vous indiquer ici une plongée plus profonde dans les questions entourant l’utilisation des antibiotiques et la façon dont ils conduisent réellement à la dysbiose et aux infections bactériennes ! C’est drôle… les antibiotiques, souvent utilisés pour combattre les infections bactériennes provoquent des proliférations bactériennes qui conduisent ensuite à des infections bactériennes.
2. La naissance par césarienne – Lorsque les bébés naissent par voie vaginale, ils héritent de leur microbiome de leur mère. Cette transmission de microbes bénéfiques de la mère à l’enfant s’est produite pendant une grande partie de notre évolution. Lorsque les bébés naissent par césarienne, ils héritent d’une grande partie de leur microbiome intestinal de la peau de leur mère. Les microbes impliqués dans ce transfert bactérien sont complètement différents et peuvent contribuer à un déséquilibre intestinal.
3. Les préparations pour nourrissons – Les nourrissons nourris avec des préparations manquent de beaucoup de bienfaits, à tel point qu’un article scientifique a déclaré que  » le lait maternel est la nutrition parfaite pour les nourrissons, résultat de millions d’années d’évolution « . Le même article a noté que le lait maternel contient des prébiotiques connus sous le nom d’oligosaccharides du lait humain, parfaits pour nourrir les bactéries bénéfiques du nouveau-né.

Traitement des infections à Citrobacter

Un médecin vous dira de prendre des antibiotiques.

Un naturopathe, un praticien de médecine fonctionnelle ou un médecin holistique pourrait vous dire de prendre de l’extrait de graines de pamplemousse ou de l’huile d’origan.

Plusieurs fois, cette approche axée sur la mort peut éliminer votre infection bactérienne à court terme. À long terme, cette approche peut vous laisser avec un microbiome intestinal perturbé aka dysbiose – la chose même que vous avez reçu ces traitements lourds en premier lieu.

Cela peut sembler confus et contradictoire. Comment un traitement qui perturbe ou endommage votre microbiote peut-il vous faire vous sentir mieux ?

C’est compliqué.

De nouveau, nous revenons à l’idée d’équilibre contre déséquilibre. Les surcroissances bactériennes représentent un déséquilibre de la flore intestinale. Traiter ces déséquilibres avec des herbes antimicrobiennes de type antibiotique extrêmement fortes (huile d’origan, extrait de pépins de pamplemousse, berbérine à haute dose à long terme) peut tuer ou réduire les surcroissances bactériennes. Simultanément, cela peut également avoir un impact négatif sur la flore intestinale bénéfique qui aide à maintenir l’équilibre dans votre intestin.

Ce concept a été présenté dans un article d’un chercheur sur le microbiome Martin J. Blaser comme l’hypothèse de la disparition du microbiote. Comme notre flore intestinale indigène diminue au fil des générations, différentes maladies deviennent plus courantes. Comme nous continuons à perdre nos microbes intestinaux ancestraux, les allergies et les maladies métaboliques deviennent plus courantes. Sont-elles liées ? Possiblement.

Le graphique ci-dessous décrit la perte de notre microbiote ancestral au cours des 80 dernières années.

Une approche plus réfléchie serait d’examiner la composition de l’intestin dans son ensemble. Plus j’ai étudié le microbiome intestinal, plus je le considère comme un écosystème complexe et fragile. Cet écosystème peut être modulé en nourrissant sélectivement les microbes bénéfiques avec des prébiotiques et des probiotiques très sélectionnés et ciblés.

Plusieurs fois, cela aidera à réduire les surcroissances bactériennes telles que Citrobacter à des niveaux sains dans l’intestin.

Si les symptômes digestifs ne s’améliorent pas, alors certains antimicrobiens à base de plantes peuvent être indiqués. Ici, nous pouvons commencer avec des herbes qui sont moins dommageables pour les bactéries bénéfiques dans notre intestin et passer à des herbes plus fortes si nécessaire.

Une approche centrée sur le microbiote

Comme toujours, il faut un clinicien intestinal compétent pour évaluer et déterminer quel cours est le meilleur pour vous et vos symptômes digestifs.

Prenez-le de moi.

Il m’a fallu plus de cinq ans pour traiter mes déséquilibres intestinaux. J’apprenais au fur et à mesure et j’ai dépensé plus d’argent et de temps que je n’aurais dû en essayant d’aller au fond de mes problèmes digestifs. En fin de compte, il a fallu travailler avec un clinicien qui connaît bien les intestins pour vraiment aider à déplacer l’aiguille.

De ce voyage, j’ai reconstitué la meilleure (et la moins nocive) approche pour traiter les infections intestinales telles que Blastocystis hominis (qui peut ou non avoir besoin d’être traitée dans chaque cas spécifique), les surcroissances bactériennes dans l’intestin grêle et le gros intestin.

Si vous souhaitez travailler avec moi, veuillez vous rendre ici. À partir de décembre 2019, j’offre des consultations gratuites de 15 minutes qui sont conçues pour voir si nous sommes compatibles et si je pense que je peux vous aider.

Comme toujours, n’hésitez pas à laisser un commentaire et à partager vos réflexions sur vos expériences en matière de santé digestive, de prébiotiques, de probiotiques et de phytothérapie dans la section des commentaires ci-dessous.

Références et ressources

1. La relation clonale parmi les Citrobacter freundii isolés de l’hôpital principal de Kermanshah, ouest de l’Iran
2. Infections dues à Citrobacter et Enterobacter
3. Espèces de Citrobacter
4. La surcroissance bactérienne du petit intestin est associée au syndrome du côlon irritable et est indépendante de l’utilisation des inhibiteurs de la pompe à protons
5. Pourquoi des espèces bactériennes apparentées fleurissent simultanément dans l’intestin : principes sous-jacents au concept ‘Like will to like’
6. Le lait maternel : une contribution intentionnelle au développement du microbiote et de l’immunité du nourrisson.
7. Quelles sont les conséquences de la disparition du microbiote humain ?

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