Biologisista näytteistä tai reaktioseoksista saadun RNA:n laatu on kriittisen tärkeää jatkojalostussovellusten onnistumisen kannalta, mukaan lukien reaaliaikainen kvantitatiivinen PCR, käänteinen transkriptio PCR, mikrosarjatutkimukset, Northern blot -analyysi, nukleaasisuojausmääritykset, RNA-kartoitus, in vitro -käännökset, cdna-kirjastojen rakentaminen jne.

Näin ollen on olennaista, että menetelmät, joilla RNA uutetaan, puhdistetaan tai eristetään erityyppisistä soluista ja kudoksista, tuottavat RNA:ta, jonka saanto ja rakenteellinen eheys ovat riittävät. Tätä silmällä pitäen Zymo Researchin tutkijat ovat kehittäneet valikoiman RNA:n uutto-, puhdistus- ja eristyssarjoja, jotka on suunniteltu korkealaatuisen RNA:n tehokkaaseen talteenottoon erilaisista lähteistä.

RNA:n puhdistus & konsentrointi

RNA:n puhdistaminen erityyppisistä soluista ja kudoksista on aiemmin ollut vaikeaa, mutta korkealaatuinen RNA on kuitenkin olennaisen tärkeää jatkojalostussovellusten, kuten mikrosarjojen, RNA-transfektion, denaturointi-geelielektroforeesin, Northern blottingin ja RT-PCR:n onnistumisen kannalta. Zymo Research Corporation on käyttänyt uusinta Fast-Spin-kolonniteknologiaansa RNA Clean & Concentrator kitin valmistukseen. Tällä kitillä saadaan talteen erittäin konsentroitua RNA:ta, mutta samalla varmistetaan tuotteen rakenteellinen eheys.

Total RNA Purification

Zymo Research tarjoaa valikoiman tuotteita, joiden avulla voidaan eristää yksinkertaisesti, nopeasti ja tehokkaasti total RNA:ta useista eri biologisista lähteistä, kuten tuoreista, jäädytetyistä tai parafiiniin sulautetuista kudoksista, viljellyistä soluista, buccal-soluista, kokoverestä, plasmasta, seerumista, virtsasta, hiivasta tai RNA-viruksista. Kuten RNA-puhdistussarjoissamme, kaikissa RNA-eristyssarjoissa on Fast-Spin-kolonnitekniikka, jolla saadaan erittäin konsentroitua RNA:ta, joka soveltuu hyvin sovelluksiin, kuten mikrosarjatutkimuksiin, denaturoivaan geelielektroforeesiin, Northern blottingiin ja RT-PCR:ään. Quick-RNA-pakkaukset ovat monipuolinen ratkaisu RNA:n kokonaispuhdistukseen, ja niitä on saatavana mikro-, mini-, midi- ja 96-kuoppamuodossa. Lisäksi ZR RNA MicroPrep™- ja ZR RNA MiniPrep™ -kitit pystyvät eristämään jopa 17 nt:n pituisia RNA-lajeja. Kukin kitti on optimoitu tiettyä sovellusta varten erikoistuneilla, nukleaaseista vapailla komponenteilla, jotka takaavat: 1) maksimaalisen membraaniliukenemisen ja solujen hajoamisen, 2) nukleaasiaktiivisuuden täydellisen estämisen, 3) näytteen täydellisen deproteiinisaation, 4) tehokkaan RNA:n eristämisen ja konsentroinnin, 5) RNA:n stabiloinnin ja turvallisen säilytyksen.

RNA:n molekyylipainomarkkeri

Agaroosi- ja polyakryyliamidigeelielektroforeesi ovat kaksi yleistä tekniikkaa koon, puhtauden ja sekvenssi-identiteetin määrittämiseksi (esim, Northern- ja Southern blotting -menetelmät) nukleiinihappojen osalta. Nukleiinihapot voidaan visualisoida geeleissä käyttämällä fluoresoivia väriaineita (esim. etidiumbromidia) tai hopeavärjäystä. RNA-kokomarkkereita (tai tikapuita) tarvitaan tuntemattomien nukleiinihappojen tunnistamiseen geelipohjaisissa menetelmissä. ZR small-RNA™ Ladder sopii erinomaisesti pienten RNA:iden (eli siRNA:iden ja miRNA:iden) tunnistamiseen, joiden koko on 17 – 29 emästä.