Sukupuolistuminen

Krokotiilit ovat sukupuolidimorfisia, ja aikuiset urokset ovat naaraita suurempia. Parittelu tapahtuu vedessä, ja sitä edeltää monimutkainen kosiskelu, jossa eläimet viestittävät toisilleen kehon profiilin muutoksilla, kosketuksella ja ääntelyllä. Myös kemialliset signaalit ovat todennäköisesti osa kosiskelua. Tämän jälkeen uros nousee naaraan selkään, ja molemmat eläimet kääntävät pyrstöjään niin, että molempien kloakit joutuvat kosketuksiin ja uroksen erektio-elin tunkeutuu sisään.

Kaikki krokotiilit munivat kovakuorisia munia, jotka voivat painaa 50-160 grammaa. Naaras munii keskimäärin 12-48 munaa per pesä, riippuen sen iästä, koosta ja lajista. Tunnetaan kaksi yleistä pesänrakennustapaa. Jotkin lajit, kuten Niilin krokotiili (C. niloticus), kaivavat kuopan maahan ja täyttävät sen uudelleen lialla munien laskemisen jälkeen. Toiset, kuten suistokrokotiili (tai suolaisen veden krokotiili) (C. porosus), rakentavat kasveista ja maaperästä kasan. Munat sijoitetaan kumpuun, ja auringon lämpö, lämmin ympäristö ja kasvillisuuden luonnollinen hajoaminen pitävät yllä lämmintä lämpötilaa, joka edistää alkion kehitystä. Munien haudonta kestää 55-100 päivää. Kuten monien muidenkin matelijoiden kohdalla, kehittyvän alkion sukupuoli määräytyy haudottavan munan lämpötilan perusteella kriittisenä ajankohtana eli haudonta-ajan ensimmäisen puoliskon aikana. Viileämmässä ja lämpimämmässä lämpötilassa syntyy naaraita, keskilämpötilassa uroksia ja lähellä 31 °C:ta (88 °F) molempia sukupuolia. Kuoriutumiseen asti naaras pysyy yleensä pesän lähellä suojellakseen munia saalistajilta.

Kahden tai kolmen kuukauden kuluttua poikaset ovat täysin kehittyneitä ja valmiita kuoriutumaan. Vielä munassa ollessaan poikaset saattavat äännellä, mikä saattaa olla merkki siitä, että ne ovat valmiita tulemaan esiin. Aikuinen naaras poistaa lian tai muut roskat munista ja auttaa poikaset veteen. Monissa tapauksissa naaras avaa munat varovasti kielellään ja kantaa poikaset suussaan. Naaras pysyy jälkeläistensä lähellä ja suojaa niitä saalistajilta useiden viikkojen tai kuukausien ajan. Kun poikaset kasvavat, ne hajaantuvat, mutta ne voivat jäädä pesäpaikan lähelle yli vuodeksi. Vankeudessa myös urosten on havaittu avustavan kuoriutumisprosessissa ja huolehtivan poikasista.