Human patogeenit kasveissa: monitieteisen tutkimusstrategian suunnittelu
Viimeaikaiset ponnistelut, joilla on pyritty vastaamaan elintarvikekasvien mikrobikontaminaatiota ja siitä johtuvia elintarvikevälitteisiä sairauksia koskeviin huolenaiheisiin, ovat synnyttäneet uudenlaista yhteistyötä ja vuorovaikutusta kasvipatologian ja elintarviketurvallisuuden tiedeyhteisöjen välillä. Tässä artikkelissa esitetään molempien tieteenalojen tutkijoiden näkökulmia ja esitellään valikoituja tutkimustuloksia ja käsitteitä, jotka korostavat nykyisiä ja mahdollisia tulevia synergioita molempien tieteenalojen yleisölle. Kasvipatologia on monitahoinen tieteenala, joka käsittää tutkimukset mikrobien, kuten bakteerien, virusten, sienten ja homomykeettien aiheuttamasta kasvien leviämisestä, kolonisaatiosta ja infektioista. Kasvipatologit tutkivat kasvitauteja sekä isäntäkasvien puolustusreaktioita ja tautien hallintastrategioita, joiden tavoitteena on minimoida tautien esiintyminen ja vaikutukset. Toistuvat ihmisten sairastumiset, jotka johtuvat ihmisten suolistopatogeenien, kuten Shiga-toksiinia tuottavien Escherichia coli -bakteerien ja Salmonella spp:n, aiheuttamasta tuoreiden tuotteiden, pähkinöiden ja siementen sekä muiden kasviperäisten elintarvikkeiden saastumisesta, ovat saaneet eräät kasvipatologit viimeisten kahden vuosikymmenen aikana laajentamaan tieteenalansa soveltamisalaa käsittelemään kasveissa esiintyviin ihmisen patogeeneihin liittyviä ongelmia (HPOP). Elintarvikemikrobiologia, joka aloitti tutkimalla elintarvikkeita pilaavia mikrobeja ja elintarviketuotannon kannalta kriittisiä mikrobeja, keskittyy nykyään tutkimaan myös sitä, miten elintarvikkeet saastuvat taudinaiheuttajilla ja miten tätä voidaan valvoa tai ehkäistä. Samaan aikaan kansanterveystutkijat ja elintarvikemikrobiologit ovatkin kiinnostuneet enemmän kasvien ja mikrobien vuorovaikutuksesta ennen sadonkorjuuta ja sen jälkeen. Kasvipatologian ja elintarviketurvallisuuden yhteisöjen jäsenten välille on syntymässä uusia yhteistyömuotoja, jotka parantavat tutkimuskapasiteettia ja lisäävät ymmärrystä niistä kysymyksistä, joiden osalta tutkimusta tarvitaan. Nämä kaksi yhteisöä käyttävät hieman erilaisia sanastoja ja käsitteellisiä malleja. Esimerkiksi perinteiset kasvipatologian käsitteet, kuten tautikolmio ja taudinkierto, voivat auttaa määrittelemään ristikkäisiä kysymyksiä, jotka liittyvät myös HPOP-tutkimukseen, ja ne voivat ehdottaa loogisia strategioita mikrobikontaminaation riskin minimoimiseksi. Jatkuva vuorovaikutus ja viestintä näiden kahden tieteenalan välillä on olennaisen tärkeää, ja se voidaan toteuttaa luomalla tieteidenvälinen tutkimuksen koordinointiverkosto. Toivomme, että tämä artikkeli, joka on johdatus monitieteiseen HPOP-areenaan, on hyödyllinen monien siihen liittyvien alojen tutkijoille.