Varios Pokémon son a menudo discutidos en cuanto a si son realmente legendarios o son a menudo confundidos como verdaderos legendarios por los fans.

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Rotom – A menudo se piensa que Rotom es Legendario porque sólo hay uno en un juego determinado y toca la música de Pokémon Legendario una vez que se combate. También está etiquetado como Legendario en el libro de la Pokédex de DP, aunque el mismo libro contiene otros errores (de dos dígitos), tanto mayores como menores.

Arcanine – Arcanine es comúnmente malinterpretado como un Pokémon Legendario, principalmente debido a un episodio (llamado «¡Emergencia Pokémon!», y conocido por ser el segundo episodio de la serie) que mostraba a Arcanine como uno de los cuatro Pokémon legendarios en la tablilla del Centro Pokémon de Ciudad Viridiana, y porque su descripción de especie desde la Generación I figura como «Pokémon legendario». A pesar de ello, no es un verdadero Legendario.

Unown – Muchos creen que Unown es un Pokémon Legendario porque aparece en el libro de Molly Hale sobre los Pokémon Legendarios en Hechizo de los Unown, su poder en gran número parece coincidir con el de los Pokémon Legendarios y dentro del canon de la película se le menciona explícitamente como un Pokémon Legendario.

Riolu & Lucario – Se cree que Lucario es un Pokémon legendario debido al hecho de que protagonizó una película de Pokémon, que suele estar reservada únicamente a los Pokémon legendarios. Otra razón es el hecho de que en el momento de su lanzamiento la única forma de conseguir un Lucario era evolucionando un Riolu, que sólo se podía obtener a través de un evento del juego, y por tanto sólo se podía obtener una vez en el juego.

Zorua & Zoroark – Se cree que Zoroark es un Pokémon legendario porque, al igual que Lucario, fue el protagonista de una película, algo que normalmente sólo se concede a los Pokémon legendarios. Como muchos otros Pokémon legendarios, solo estaba disponible como evento en el juego en Negro & Blanco y Negro 2 & Blanco 2, pudiendo encontrar solo uno en cada juego. En Negro & Blanco, un entrenador necesitaba un evento shiny Raikou, Entei o Suicune para poder activar el evento en el juego y en Negro 2 & Blanco 2 sólo está disponible evolucionando a Zorua de N. Esto también podría deberse a que Zoroark puede ser liberado de una Master Ball en Super Smash Bros. 3DS, algo que normalmente sólo se da a los Legendarios o Míticos.

Volcarona – Mucha gente especuló sobre si Volcarona era un Pokémon Legendario o no debido al hecho de que sólo se puede encontrar una vez en el juego al igual que los Pokémon Legendarios y se encuentra a través de un evento en el juego. Volcarona se encuentra en la parte inferior del Castillo Reliquia y sólo se puede acceder a él después de que el jugador haya derrotado al Equipo Plasma en Negro & Blanco.

Delibird – El libro de la Pokédex de DP afirma incorrectamente que Delibird es un Pokémon legendario. Esto confundió a muchos fans y se creyó que era cierto o se consideró un error. Al igual que con Spiritomb, Rotom y Spinda, este es un error de los muchos que hay en la Pokédex DP.

Spinda – La Pokédex DP afirma incorrectamente que Spinda es un Pokémon legendario. Esto confundió a muchos fans y se creyó que era cierto o se consideró un error. Al igual que con Spiritomb, Rotom y Delibird, este es un error de los muchos que hay en la Pokédex DP.

Spiritomb – La Pokédex DP afirma incorrectamente que Spiritomb es un Pokémon legendario. Esto confundió a muchos fans y se creyó que era cierto o se consideró un error. Al igual que Rotom, Spinda y Delibird, este es sólo un error de los muchos que hay en el libro de la Pokédex del PD.