En 1988, Brennaman y Nuxhall comparecieron ante el presidente de la Liga Nacional, Bart Giamatti, en la oficina de la NL, en la ciudad de Nueva York, en relación con las acusaciones de que Brennaman incitó a la multitud a provocar un retraso del juego tras un altercado entre el mánager de los Reds, Pete Rose, y el árbitro Dave Pallone. Después de que Rose fuera expulsado del partido y de que Brennaman criticara a Pallone durante la retransmisión radiofónica en directo, los aficionados llenaron el campo de escombros, lo que provocó un retraso del partido. Brennaman dijo lo siguiente sobre el incidente.

«Sigo manteniendo que teníamos razón», dijo Brennaman. «Nunca me disculparé por ello. Nos acusaron de incitar a una revuelta. No creo que lo hiciéramos entonces y no creo que lo hagamos ahora».

El 12 de junio de 2007, Brennaman se disculpó en antena durante la emisión de la Red de Radio de los Cincinnati Reds por un comentario que había hecho recientemente comparando un próximo viaje por carretera con la Marcha de la Muerte de Bataan. Los Reds, que en ese momento tenían el peor récord de la Liga Nacional, iban a enfrentarse a los Oakland Athletics, los Seattle Mariners y los Philadelphia Phillies en el viaje por carretera.

El 17 de abril de 2008, durante la parte alta de la octava entrada de un partido entre los Chicago Cubs y los Cincinnati Reds en el Wrigley Field de Chicago, Brennaman hizo comentarios sobre los aficionados y el equipo de los Cubs. Esto ocurrió después de que el entonces jugador de los Reds, Adam Dunn, conectara un jonrón. Los aficionados de los Cubs acostumbran a lanzar la pelota del jugador contrario al campo. En este caso, el campo se llenó de múltiples pelotas lanzadas por los aficionados al campo, lo que provocó un retraso en el juego mientras el equipo de campo recuperaba los desechos. Las declaraciones de Brennaman se emitieron en la red de radio de los Reds durante el partido.

«Este es el tipo de cosas, honestamente, ahora mismo, que hace que quieras ver perder al equipo de los Chicago Cubs. Entre todos los aficionados al béisbol, y no puedo dar fe de los Yankees o los Red Sox, porque no los vemos con ningún grado de regularidad a menos que sea un juego entre ligas, pero de lejos los aficionados más odiosos en el béisbol, en esta liga, son los que siguen a este equipo aquí mismo. Lanzar 15 o 18 pelotas al campo, no hay absolutamente ninguna excusa para eso, y eso es tan típico de los fans de los Chicago Cubs. Es increíble.»
«Simplemente los apoyas. Ya sabes, he dicho que todo el invierno han hablado de que este equipo va a ganar la división, y mi comentario es que no la van a ganar, porque al final del día, siguen siendo los Chicago Cubs, y van a encontrar una manera de fastidiar todo esto.»

El 18 de abril de 2008, Brennaman apareció en una entrevista en la emisora de radio deportiva de Chicago WMVP-AM 1000 en la que reforzó su posición sobre los aficionados de los Cubs, y comparó a los aficionados de los Chicago Cubs con los aficionados rivales de los St.

«Si no pueden entender que lo que ocurrió el miércoles por la noche fue completamente exagerado, entonces lo siento», dijo Brennaman. «Dije lo difícil que es alentar a los Cachorros. Creo que mucha gente siente lo mismo que yo, pero no lo articulan. No tengo miedo de decir lo que pienso»
«. Los aficionados de los Cardinals son sin duda los mejores del béisbol. Respetan el juego. No van al juego para hacer cosas estúpidas».
«Los Cubs tienen algunos grandes aficionados al béisbol. Pero los que actúan como idiotas (lo arruinan) para gente como yo».

El 5 de febrero de 2010, Brennaman fue reprendido por comentar que el presidente de la Universidad de Marshall debía ser «maricón» para el softbol en el banquete y la recaudación de fondos de la universidad. Brennaman declaró: «Probablemente podría haber elegido mejor las palabras, pero eso no refleja en absoluto mi opinión sobre los gays. Es sólo un comentario que hice sobre el presidente de la universidad».